La
Universitat de València colabora
en
la secuenciación del genoma
completo
de una planta
Un equipo compuesto por siete investigadores valencianos
ha conseguido obtener la primera secuencia completa del
genoma de una planta. Esta secuencia de ADN representa
toda la información genética de una planta denominada
Arabidopsis thaliana. La tecnología que han desarrollado
facilitar· la secuenciación de otros genomas vegetales y
además permitir·localizar con facilidad los genes de las
plantas de mayor interés para la industria agroalimentaria de
España. El equipo investigador está compuesto por cuatro
científicos del Departamento de Genética de la Universidad
de Valencia y por tres científicos de Sistemas Genómicos
S.L., una empresa ubicada en el Parque Tecnológico de
Valencia.
Un equipo de siete científicos valencianos ha finalizado un
importante estudio genómico en el que se describe la
secuencia completa del genoma de una planta cuyo nombre
científico es Arabidopsis thaliana. El año pasado ya
publicaron un avance de esta información en la revista
NATURE con la secuencia del cromosoma 4 de esta planta.
Con esta nueva publicación, se hace da a conocer toda la
secuencia de este genoma vegetal, que incluye el análisis
bioinformático de los resultados y la identificación de todos
los genes de este organismo. Los componentes del equipo
de la Universitat de València son Manuel Pérez-Alonso,
Mónica Bargues, Javier Terol y Joan Climent, mientras que
los científicos de la empresa Sistemas Genómicos son
Ángela Pérez, Pilar Navarro y Carmen Collado.El trabajo se ha llevado a cabo a través de una colaboración
entre laboratorios europeos, japoneses y americanos y se
publica en la prestigiosa revista científica NATURE. La
trascendencia de este trabajo radica en que la tecnología
empleada (secuenciación de ADN a gran escala) se puede
aplicar ahora al genoma de organismos de interés para la
industria agroalimentaria.Los científicos de la Universidad de Valencia y de Sistemas
Genómicos muestran en este nuevo trabajo toda la
información genética que contiene el cromosoma 3 de esta
planta. Esta publicación es el resultado de 6 años de intensa
investigación y en el que hemos obtenido 22,7 millones de
nucleótidos (la medida de longitud con que se mide el ADN).
El análisis de este cromosoma revela que esta secuencia
genómica contiene 5.120 genes que codifican para
proteínas, además de un gran número de elementos
repetitivos, según afirma el Dr. Javier Terol.Esta secuencia de ADN se ha puesto a disposición de la
comunidad científica a través de Internet, en una página web
que permite “navegar” por los cromosomas y que se
encuentra en la siguiente dirección de Internet:
(www.madriditaliapamplonasevilla.biochem.mpg.de/proj/thal).
Esta página web también permite obtener información
detallada sobre cada uno de los genes identificados.La razón por la que se ha escogido esta planta es porque
Arabidopsis tiene un genoma muy compacto, que está
distribuido en cinco cromosomas. Además, dado que es una
planta de pequeño tamaño, su cultivo en el laboratorio es
relativamente simple. Por este motivo, Arabidopsis se ha
convertido en un organismo modelo para el estudio de los
genomas vegetales, según indica el Prof. Pérez-Alonso. La
secuenciación de genomas -señala- requiere aplicar las
técnicas de secuenciación de ADN a gran escala. Esto da
lugar a una enorme competencia internacional, en la que sólo
los laboratorios más productivos logran secuenciar grandes
segmentos de ADN, con una financiación muy escasa.
Existen grandes centros en EE.UU. en Europa y en Japón
dedicados a la obtención de secuencias genómicas a gran
escala, mientras que en España sólo quedan dos
laboratorios que contribuyen a estos grandes proyectos
internacionales, uno de Barcelona y el nuestro en Valencia.En total, la aportación de los laboratorios españoles ha sido
de 800.000 nucleótidos. De éstos, la contribución del
laboratorio valenciano a la secuencia de este nuevo
cromosoma ha sido de 500.000 nucleótidos, mientras que el
laboratorio de Barcelona ha obtenido 300.000 nucleótidos.
Esto nos sitúa a la altura de los grandes centros
internacionales de secuenciación de genomas.Con este trabajo de secuenciación, Arabidopsis es el primer
organismo vegetal cuya secuencia completa se conoce, y los
datos obtenidos van a tener una repercusión muy importante
en los próximos años.La Genómica es una nueva rea de la Biología que ha
experimentado un auge extraordinario gracias a los trabajos
de secuenciación de ADN a gran escala. Esta nueva
disciplina permite aproximarse de una manera global a la
Biología, pues permite estudiar genomas completos, así
como patrones de expresión de todos los genes.Una de las investigadoras de este trabajo y gerente de la
empresa Sistemas Genómicos S.L., Ángela Pérez, es quien
nos indica que esta tecnología va a ser aplicada al análisis
del genoma de los principales cultivos. Además, en los
laboratorios de esta empresa se están aplicando estas
técnicas para resolver las necesidades analíticas de la
Industria Agroalimentaria, sobre todo en lo que se refiere al
análisis de material transgénico en alimentos. De este modo,
la secuenciación de ADN se aplica en este importante sector
industrial.
MÓDULO | CÓDIGO | CRÉDITOS | PROFESOR | HORARIO |
Procedim. sancionador | 26966 | 4 | Dr. Martín Queralt | Viernes: 16-18 h. |
Organiz. Hacienda AR | 20882 | 4 | Dra. Ferrero Micó | Martes, 16-18 h. |