La Universitat de València colabora
en la secuenciación del genoma
completo de una planta

                                  Un equipo compuesto por siete investigadores valencianos
                                   ha conseguido obtener la primera secuencia completa del
                                  genoma de una planta. Esta secuencia de ADN representa
                                   toda la información genética de una planta denominada
                                   Arabidopsis thaliana. La tecnología que han desarrollado
                                   facilitar· la secuenciación de otros genomas vegetales y
                                   además permitir·localizar con facilidad los genes de las
                                   plantas de mayor interés para la industria agroalimentaria de
                                   España. El equipo investigador está compuesto por cuatro
                                   científicos del Departamento de Genética de la Universidad
                                   de Valencia y por tres científicos de Sistemas Genómicos
                                   S.L., una empresa ubicada en el Parque Tecnológico de
                                   Valencia.
                                   Un equipo de siete científicos valencianos ha finalizado un
                                   importante estudio genómico en el que se describe la
                                   secuencia completa del genoma de una planta cuyo nombre
                                   científico es Arabidopsis thaliana. El año pasado ya
                                   publicaron un avance de esta información en la revista
                                   NATURE con la secuencia del cromosoma 4 de esta planta.
                                   Con esta nueva publicación, se hace da a conocer toda la
                                   secuencia de este genoma vegetal, que incluye el análisis
                                   bioinformático de los resultados y la identificación de todos
                                   los genes de este organismo. Los componentes del equipo
                                   de la Universitat de València son Manuel Pérez-Alonso,
                                   Mónica Bargues, Javier Terol y Joan Climent, mientras que
                                   los científicos de la empresa Sistemas Genómicos son
                                   Ángela Pérez, Pilar Navarro y Carmen Collado.

                                   El trabajo se ha llevado a cabo a través de una colaboración
                                   entre laboratorios europeos, japoneses y americanos y se
                                   publica en la prestigiosa revista científica NATURE. La
                                   trascendencia de este trabajo radica en que la tecnología
                                   empleada (secuenciación de ADN a gran escala) se puede
                                   aplicar ahora al genoma de organismos de interés para la
                                   industria agroalimentaria.

                                  Los científicos de la Universidad de Valencia y de Sistemas
                                   Genómicos muestran en este nuevo trabajo toda la
                                   información genética que contiene el cromosoma 3 de esta
                                   planta. Esta publicación es el resultado de 6 años de intensa
                                   investigación y en el que hemos obtenido 22,7 millones de
                                   nucleótidos (la medida de longitud con que se mide el ADN).
                                   El análisis de este cromosoma revela que esta secuencia
                                   genómica contiene 5.120 genes que codifican para
                                   proteínas, además de un gran número de elementos
                                   repetitivos, según afirma el Dr. Javier Terol.

                                   Esta secuencia de ADN se ha puesto a disposición de la
                                   comunidad científica a través de Internet, en una página web
                                   que permite “navegar” por los cromosomas y que se
                                   encuentra en la siguiente dirección de Internet:
                                   (www.madriditaliapamplonasevilla.biochem.mpg.de/proj/thal).
                                   Esta página web también permite obtener información
                                   detallada sobre cada uno de los genes identificados.

                                   La razón por la que se ha escogido esta planta es porque
                                   Arabidopsis tiene un genoma muy compacto, que está
                                   distribuido en cinco cromosomas. Además, dado que es una
                                   planta de pequeño tamaño, su cultivo en el laboratorio es
                                   relativamente simple. Por este motivo, Arabidopsis se ha
                                   convertido en un organismo modelo para el estudio de los
                                   genomas vegetales, según indica el Prof. Pérez-Alonso. La
                                   secuenciación de genomas -señala- requiere aplicar las
                                   técnicas de secuenciación de ADN a gran escala. Esto da
                                   lugar a una enorme competencia internacional, en la que sólo
                                   los laboratorios más productivos logran secuenciar grandes
                                   segmentos de ADN, con una financiación muy escasa.
                                   Existen grandes centros en EE.UU. en Europa y en Japón
                                   dedicados a la obtención de secuencias genómicas a gran
                                   escala, mientras que en España sólo quedan dos
                                   laboratorios que contribuyen a estos grandes proyectos
                                   internacionales, uno de Barcelona y el nuestro en Valencia.

                                   En total, la aportación de los laboratorios españoles ha sido
                                   de 800.000 nucleótidos. De éstos, la contribución del
                                   laboratorio valenciano a la secuencia de este nuevo
                                   cromosoma ha sido de 500.000 nucleótidos, mientras que el
                                   laboratorio de Barcelona ha obtenido 300.000 nucleótidos.
                                   Esto nos sitúa a la altura de los grandes centros
                                   internacionales de secuenciación de genomas.

                                   Con este trabajo de secuenciación, Arabidopsis es el primer
                                   organismo vegetal cuya secuencia completa se conoce, y los
                                   datos obtenidos van a tener una repercusión muy importante
                                   en los próximos años.

                                   La Genómica es una nueva rea de la Biología que ha
                                   experimentado un auge extraordinario gracias a los trabajos
                                   de secuenciación de ADN a gran escala. Esta nueva
                                   disciplina permite aproximarse de una manera global a la
                                   Biología, pues permite estudiar genomas completos, así
                                   como patrones de expresión de todos los genes.

                                   Una de las investigadoras de este trabajo y gerente de la
                                   empresa Sistemas Genómicos S.L., Ángela Pérez, es quien
                                   nos indica que esta tecnología va a ser aplicada al análisis
                                   del genoma de los principales cultivos. Además, en los
                                   laboratorios de esta empresa se están aplicando estas
                                   técnicas para resolver las necesidades analíticas de la
                                   Industria Agroalimentaria, sobre todo en lo que se refiere al
                                   análisis de material transgénico en alimentos. De este modo,
                                   la secuenciación de ADN se aplica en este importante sector
                                   industrial.

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