Los anticuerpos anti desmogleina 1 (Anti-Dsg 1), presentes en el pénfigo foliáceo no pueden producir ampollas en mucosas o en las porciones profundas de la piel ya que en esas localizaciones existe una representación significativa de otra proteina del desmosoma -la desmogleina 3- que es suficiente para mantener la cohesion intercelular. Los anticuerpos antidesmogleina 1 son capaces de producir ampollas cutáneas superficiales ya que a ese nivel la expresion de la desmogleina 3 es insuficiente para mantener la adhesion entre los queratinocitos.

Los anticuerpos antidesmogleina 3, presentes en el pénfigo vulgar, pueden producir por si solos ampollas a nivel de mucosas, ya que a ese nivel la expresión de desmogleina 1 es muy escasa y no puede mantener la adhesion intercelular. A nivel de piel los Ac Anti dsg 3 solo producen lesiones limitadas a la capa basal debido a la presencia de Desmogleina 1 en la piel. 

Si se producen anticuerpos anti Dsg1 y Dsg 3 se producen lesiones cutáenos y mucosas.