- Beatriz Soriano Salvador. "Soluciones bioinformáticas para el análisis de datos ómicos, descubrimiento de conocimiento y diagnóstico genético en Sparus aurata y otros organismos biológicos" Dirección: Carlos Llorens, Jaume Pérez y Vicente Arnau.
- José Miguel Juanes Tébar. "MGVIZ: desarrollo e integración de métodos de análisis y visualización de datos genómicos en biomedicina". Dirección: Felipe Javier Chaves Martínez, Vicente Arnau Llombart y Pablo Marín García. 2021.
- José Manuel Martí. “Longitudinal metagenomics”. Dirección: Carlos Peña-Garay. 2019.
- Antonio Fabregat Mundo. "Performance optimisation of biological Pathway data storage, retrieval, analysis and its interactive visualisation". Dirección: Pablo Marín García y Vicente Arnau Llombart. 2018.
- Daniel Martínez Martínez. "Stability of the Human Microbiome". Dirección: Andrés Moya Simarro y Carlos Peña Garay. 2018.