* Análisis del Control Metabólico

TEMARIO :

I. ESTUDIO DEL METABOLISMO.

1. Introducción.

1.1. Tipos de rutas metabólicas.

1.2. Regulación de enzimas y regulación de rutas metabólicas.

1.3. Estado estacionario en rutas metabólicas.

1.4. Termodinámica de rutas metabólicas.

2. Metodología para el estudio del metabolismo.

2.1. Sistemas experimentales; aspectos comparativos.

2.2. Valoración de metabolitos.

2.2.1. Técnicas invasivas.

2.2.2. Utilización de RMN.

2.2.3. Metabolitos libres y unidos a proteínas.

2.3. Medida de flujos metabólicos.

2.4. Determinación de concentración y actividad de enzimas.

2.5. Modelos metabólicos.
 

II. REGULACIÓN DE RUTAS METABÓLICAS: APROXIMACIONES CONVENCIONALES.

3. Regulación de rutas lineales.

3.1. Criterios locales de control

3.1.1. La etapa más alejada del equilibrio.

3.1.2. La etapa "limitante de la velocidad".

3.2. Relaciones teóricas entre ambos criterios.

3.3. Lógica del control; utilidad del conocimiento in vitro de la enzima.
 

4. El teorema de Chance.

4.1. Formulación inicial.

4.2. Aplicación a la regulación metabólica.

4.3. Limitaciones del teorema de Chance y de los tratamientos tradicionales.

III. ANÁLISIS DEL CONTROL METABÓLICO.

5. Conceptos y definiciones básicas.

5.1. Aspectos históricos del análisis del control metabólico.

5.2. Axiomas del análisis del control metabólico.

5.3. El coeficiente de control de flujo.

6. Herramientas teóricas en la determinación de coeficientes de control de flujo.

6.1. Teorema de la suma.

6.2. Elasticidades.

6.2.1. Coeficiente de elasticidad.

6.2.2. Primer teorema de la conectividad.

6.3. Coeficientes de respuesta.

6.4. Teorema de la respuesta.

6.5. Coeficientes de control de concentración.

6.6. Otros teoremas de la conectividad.

7. Métodos para la determinación práctica de coeficientes de control de flujo.

7.1. Análisis de la dependencia del flujo con respecto a la concentración de enzimas.

7.1.1. Modulación génica.

7.1.2. Perturbación in vivo.

7.1.3. Titulación de enzimas.

7.2. Utilización del teorema de la respuesta.

7.3. Determinación a partir de elasticidades.

7.4. El método "top-down".

7.5. Determinación a partir de modelos.

8. Aplicación del análisis del control de flujo al estudio de la regulación de rutas.

8.1. Control de la concentración de un metabolito.

8.2. Retroinhibición.

9. Crítica del análisis del control metabólico.

9.1. Análisis del control metabólico y aproximaciones convencionales.

9.2. Limitaciones del análisis del control metabólico.

9.3. Aplicaciones del análisis del control metabólico.
 

IV. OTROS ASPECTOS DE REGULACIÓN DE RUTAS METABÓLICAS

10. Aspectos temporales del metabolismo.

10.1. Organización temporal de rutas metabólicas.

10.2. Canalización de metabolitos.

10.2.1. Concepto.

10.2.2. Ejemplos bien establecidos: sistemas multienzimáticos y enzimas polifuncionales.

10.2.3. Otros casos de canalización; el ejemplo de la glicolisis.

10.2.4. Posibles funciones de la canalización.

10.2.5. La canalización de metabolitos en el análisis del control metabólico.

10.3. Otros aspectos temporales del control del metabolismo.

11. Comportamientos singulares en rutas metabólicas.

11.1. Introducción.

11.2. Comportamientos singulares. Estados críticos.

11.3. Causas de la existencia de estados críticos.