El modelo de Enlace de Valencia no es capaz de explicar de modo satisfactorio estructuras resonantes como la de la molecula de O₃. Las estructuras resonantes que se dibujan no están en equilibrio entre ellas, con un traslado de electrones de una parte a otra de la molecula. Tampoco son estructuras reales formando una mezcla. La estructura de O₃ es una estructura intermedia entre las resonantes.

El modelo del orbital molecular describe la resonancia con el par electrónico restante situado en un orbital molecular deslocalizado en toda la molécula.