El personal investigador del ICBiBE està integrat en diversos programes de doctorat de la Universitat de Valéncia, especialment en el Programa de Doctorat de Biodiversitat i Biologia Evolutiva i en el Programa de Doctorat de Biomedicina i Biotecnologia. Habitualment, els estudiants de doctorat de la Universitat de València dirigits per membres del ICBiBE entrar a formar part del Institut, i desenvolupen les seues recerques en aquest.