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Servicio de secuenciación Sanger y análisis de fragmentos

  • Equipo de secuenciación de DNA mediante electroforesis capilar
  • Marca y modelo: Applied Biosystems ABI3730XL
  • Equipo de separación y detección mediante electroforesis capilar de fragmentos de DNA marcados fluorescentemente. Se utiliza un array de 96 capilares de 50 cm con lo que se pueden obtener secuencias de DNA de alrededor de 900 pb. El marcaje con 5 fluorocromos también permite el desarrollo de aplicaciones de genotipado, con la determinación del tamaño de fragmentos marcados como STRs, MLPAs, etc.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.49
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Servicio de secuenciación masiva

  • Equipo de secuenciación masiva
  • Marca y modelo: Illumina, MiSeq
  • Equipo de secuenciación de alto rendimiento con diferente output según los reactivos utilizados. Con este equipo se pueden obtener hasta 25M de secuencias pareadas de una longitud de 2x300 pb (15 Gb). Algunas aplicaciones son: secuenciación “de novo” de genomas pequeños, metagenómica, secuenciación de amplicones (16S, ITS, otros), secuenciación de regiones diana, entre otras.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.48
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  • Equipo de secuenciación de moléculas largas
  • Marca y modelo: PacBio, Sequel
  • Equipo de secuenciación de molécula única. Basado en la tecnología SMRT, permite la obtención de secuencias de DNA de una longitud superior a 10 kb, con una precisión del 99,999 % (QV50). Aplicaciones: secuenciación de “novo” de genomas, transcriptomas y epigenomas, metagenómica, análisis de isoformas de RNA, etc.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.48
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Servicio de análisis de célula única

  • Equipo de separación de célula única
  • Marca y modelo: Fluidigm, C1
  • Equipo de separación y detección mediante electroforesis capilar de fragmentos de DNA marcados fluorescentemente. Se utiliza un array de 96 capilares de 50 cm con lo que se pueden obtener secuencias de DNA de alrededor de 900 pb. El marcaje con 5 fluorocromos también permite el desarrollo de aplicaciones de genotipado, con la determinación del tamaño de fragmentos marcados como STRs, MLPAs, etc.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.48
  • Ficha

Servicio de PCR cuantitativa

  • Equipo de qPCR en tiempo real
  • Marca y modelo: Life Technologies, StepOne plus
  • Sistema de PCR cuantitativa en tiempo real para trabajar con placas de 96 pocillos. Permite la detección de diferentes fluoróforos por lo que se pueden realizar ensayos con SYBR Green o Sondas TaqMam. Aplicaciones: cuantificación absoluta y relativa de expresión génica, detección de SNPs, análisis de miRNAs, cuantificación de carga viral, etc.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.49
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  • Equipo de PCR digital
  • Marca y modelo: Life Technologies, QuantStudio 3D
  • La técnica de PCR digital se basa repartir la muestra de DNA en muchas reacciones individuales de PCR (20.000 pocillos en este equipo) y tras la reacción, contar directamente el número de moléculas que son amplificadas por lo que se consigue una cuantificación absoluta del DNA o cDNA. Aplicaciones: cuantificación absoluta de la expresión génica, detección de alelos raros, cuantificación absoluta de carga viral, cuantificación absoluta de patrones de DNA, etc.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.49
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Servicio de análisis de calidad de ácidos nucleicos

  • Equipo de electroforesis de ácidos nucleicos
  • Marca y modelo: Agilent, Bioanalyzer 2100
  • Sistema de electroforesis microcapilar para la separación de biomoléculas. Permite determinar el tamaño, la integridad y pureza de una muestra de DNA, RNA o proteínas, así como su cuantificación. Aplicaciones: control de calidad de librerías NGS, análisis de smRNA, análisis de amplicones de PCR, análisis de fragmentos de restricción, etc.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.48
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Equipamiento para preparación de muestras

  • Espectrofotometros y espectrofluorimetros
  • Marca y modelo: ThermoFisher, NanoDrop 2000
    Invitrogen, Qubit 2.0
  • Equipos de cuantificación de DNA, RNA y proteínas mediante espectrofotometría y fluorimetría. Permiten la utilización de microvolúmenes (a partir de 1 µl de muestra).
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.49
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  • Equipo de ultrasonicación dirigida
  • Marca y modelo: Covaris, S2
  • Equipo de ultrasonicación de lata frecuencia controlada (AFA) para muestras biológicas. Entre las aplicaciones de este equipo están: fragmentación de DNA, RNA o cromatina, homogenización de tejido, lisis celular, disolución de compuestos químicos y micronización de partículas.
  • Ubicación: Edificio Jeroni Muñoz. Lab 0.48
  • Ficha

 
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