Fitxa persona

JULI PERETO MAGRANER
PDI Catedratic/a d'Universitat
Subdirector/a d' Institut Universitari
Avalador d'Efimers

juli.pereto@uv.es
http://www.uv.es/pereto
http://pereto.blogs.uv.es

Knowledge area: BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
Department: Biochemistry and Molecular Biology

Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SysBio, UV-CSIC) C. José Beltrán 2 46980 Paterna
(9635) 43666

Subjects taught and teaching methods

33056 - Main evolutionary transitions	Teoría, Tutorías
33172 - Metabolism and regulation	Teoría
42589 - Computational systems biology	Laboratorio, Teoría

Tutorials

Anual

Tuesday de 14:00 a 15:30. I2SYSBIO, DESPATX 4.2.3

Observations

Participa en el programa de tutories electròniques de la Universitat de València.

Academic training

Journal Publications

Cornish-Bowden, A.; Peretó, J.; Cárdenas, M.L. (2014) Biochemistry and evolutionary biology: two disciplines that need each other. Journal of Biosciences , 39(1), pp. 1 - 15 . ISSN: 0250-5991
Becerra, A.; Rivas, M.; García-Ferris, C.; Lazcano, A.; Peretó, J. (2014) A phylogenetic approach to the early evolution of autotrophy: the case of the reverse TCA and the reductive acetyl-CoA pathways. International Microbiology , 17, pp. 91 - 97 . ISSN: 1139-6709
Peretó, J. (2014) La vida impura. Algunes visions sobre la vida que ens ha llegat Lynn Margulis. Treballs de la Societat Catalana de Biologia , 65, pp. 56 - 59 . ISSN: 0212-3037
Patiño-Navarrete, R.; Piulachs, M.D.; Belles, X.; Moya, A.; Latorre, A.; Peretó, J. (2014) The cockroach Blattella germanica obtains nitrogen from uric acid through a metabolic pathway shared with its bacterial endosymbiont. Biology Letters , 10(7), p. 20140407 . ISSN: 1744-9561
Dorado-Morales P; Iglesias A; Zafrilla G; Valero A; Torres A; Miravet-Verde S; de Loma J; Mañas M; Ruiz A; Corman A; Morales LJ; Peretó J; Vilanova C; Porcar M. (2014) Engineering Bacteria to Form a Biofilm and Induce Clumping in Caenorhabditis elegans. Acs Synthetic Biology . ISSN: 2161-5063
Vilanova, C.; Tanner, K.; Dorado-Morales, P.; Villaescusa, P.; Chugani, D.; Frías,A.; Segredo, E.; Molero, X.; Fritschi, M; Morales, L.J.; Ramón, D.; Peña-Garay, C.; Peretó, J.; Porcar, M. (2015) Standards not that standard. Journal Of Biological Engineering , 9(17), pp. 1 - 4 . ISSN: 1754-1611
Scharf, C.; Virgo, N.; Cleaves, H.J. 2nd; Aono, M.; Aubert-Kato, N.; Aydinoglu, A.; Barahona, A; Barge, L.M.; Benner, S.A.; Biehl, M.; Brasser, R.; Butch, C.J.; Chandru, K.; Cronin, L.; Danielache, S.; Fischer, J.; Hernlund, J.; Hut, P.; Ikegami, T.; Kimura, J.; Kobayashi, K.; Mariscal, C.; McGlynn, S.; Menard, B.; Packard, N.; Pascal, R.; Pereto, J.; Rajamani, S.; Sinapayen, L.; Smith, E.; Switzer, C.; Takai, K.; Tian, F.; Ueno, Y.; Voytek, M.; Witkowski, O.; Yabuta, H. (2015) A strategy for origins of life research. Astrobiology , 15(12), pp. 1031 - 1042 . ISSN: 1531-1074
Ponce-de-Leon, M.; Calle-Espinosa, J.; Peretó, J.; Montero, F. (2015) Consistency analysis of genome-scale models of bacterial metabolism: a metamodel approach. Plos One , 10(12), p. e0143626 . ISSN: 1932-6203
Gil, R.; Peretó, J. (2015) Small genomes and the difficulty to define minimal translation and metabolic machineries. Frontiers in ecology and evolution , 3(123) . ISSN: 2296-701X
Porcar, M.; Peretó, J. (2015) ¿Quién hace biología sintética?. Encuentros en la biología , 8(153), pp. 5 - 6 . ISSN: 1134-8496
Peretó, J. (2016) Erasing borders: a brief chronicle of early synthetic biology. Journal of Molecular Evolution , 83(5-6), pp. 176 - 183 . ISSN: 0022-2844
Mori, M.; Ponce-De-León, M.; Peretó, J.; Montero, F. (2016) Metabolic complementation in bacterial communities: necessary conditions and optimality. Frontiers In Microbiology , 7, p. 1553 . ISSN: 1664-302X
Calle-Espinosa, J.; Ponce-De-Leon, M.; Santos-Garcia, D.; Silva, F. J.; Montero, F.; Peretó, J. (2016) Nature lessons: The whitefly bacterial endosymbiont is a minimal amino acid factory with unusual energetics. Journal of Theoretical Biology , 407, pp. 303 - 317 . ISSN: 0022-5193
Dorado-Morales, P.; Vilanova, C.; Peretó, J.; Codoñer, F. M.; Ramón, D.; Porcar, M. (2016) A highly diverse, desert-like microbial biocenosis on solar panels in a Mediterranean city. Scientific Reports , 6, p. 29235 . ISSN: 2045-2322
Porcar, M.; Peretó, J. (2016) Nature versus design: synthetic biology or how to build a biological non-machine. Integrative Biology , 8(4), pp. 451 - 455 . ISSN: 1757-9694
Peretó, J. (2016) La ciencia nunca se acaba. Pasajes , 50, pp. 185 - 187 . ISSN: 1575-2259
Peretó, J.; Català, J. (2016) A reconciliation with Darwin? Divergent views on evolutionism in Erich Wasmann and Jaime Pujiula, biologists and Jesuits. Mètode Annual Review . ISSN: 2174-3487
Abendroth, C.; Simeonov, C.; Peretó, J.; Antúnez, O.; Gavidia, R.; Lusching, O.; Porcar, M. (2017) From grass to gas: microbiome dynamics of grass biomass acidification under mesophilic and thermophilic temperatures. Biotechnology For Biofuels , 10, p. 171 . ISSN: 1754-6834
Lazcano, A.; Peretó, J. (2017) On the origin of mitosing cells: a historical appraisal of Lynn Margulis endosymbiotic theory. Journal of Theoretical Biology , 434, pp. 80 - 87 . ISSN: 0022-5193
Ponce-de-León, M.; Tamarit, D.; Calle-Espinosa, J.; Mori, M.; Latorre A.; Montero, F.; Peretó, J. (2017) Determinism and contingency shape metabolic complementation in an endosymbiotic consortium. Frontiers In Microbiology , 8, p. 2290 . ISSN: 1664-302X
Tanner, K.; Manuel Martí, J.; Belliure, J.; Fernández-Méndez, M.; Molina-Menor, E.; Peretó, J.; Porcar M. (2018) Polar solar panels: Arctic and Antarctic microbiomes display similar taxonomic profiles. Environmental Microbiology Reports , 10(1), pp. 75 - 79 . ISSN: 1758-2229
Porcar, M.; Peretó, J. (2018) Creating life and the media: translations and echoes. Life Sciences, Society and Policy , 14(1), p. 19 . ISSN: 2195-7819
Montanucci, L.; Laayouni, H.; Dobón, B.; Keys, K.l.; Bertranpetit, J.; Peretó J. (2018) Influence of topology and functional class on the molecular evolution of human metabolic genes. Plos One , 13(12), p. e0208782 . ISSN: 1932-6203
Muñoz-Velasco, I.; García-Ferris, C.; Hernandez-Morales, R.; Lazcano, A.; Peretó, J.; Becerra, A. (2018) Methanogenesis on Early Stages of Life: Ancient but Not Primordial. Origins Of Life And Evolution Of Biospheres , 48(4), pp. 407 - 420 . ISSN: 0169-6149

Other publications

Lectures

Participations in Conferences

Vida sintética: el concepto de genoma mínimo. (Conferencia en el Auditorio Carlos Graef de la Facultad de Ciencias, UNAM), 18/05/2016. México DF. MEXICO.
Bricolage y oportunismo en la evolución del metabolismo. (Seminario del Laboratorio de Origen de la Vida, Facultad de Ciencias, UNAM), 19/05/2016. México DF. MEXICO.
La teoria endosimbiòtica. (Tertúlies de Literatura Científica de la Universitat de Vic), 23/11/2016. Vic. SPAIN.
Recrear l'origen de la vida: una aventura científica inacabable?. (Pioners, visionaris i somiadors: algunes aventures científiques excepcionals, Càtedra Lluís A. Santaló d'Aplicacions de la Matemàtica, Universitat de Girona Aula Magna, Casa de Cutura de la Diputació), 06/10/2016. Girona. SPAIN.
El origen de la vida en la Tierra: una odisea científica inacabable. (XIV Encuentros con la Ciencia, Ámbito Cultural de El Corte Inglés de Málaga), 27/01/2017. Málaga. SPAIN.
L'origen de la vida. (Associació Cultural El Guaret, Ajuntament de Cocentaina, Seu Universitària de la Universitat d'Alacant en Cocentaina), 30/06/2016. Cocentaina. SPAIN.
Cuando despertó, el de metabolismo seguía allí. (Curso de Iniciación a la Investigación en Bioquímica y Biología Molecular. XXXVIII Congreso de la SEBBM), 07/09/2015. València. SPAIN.
The evolution of metabolic pathways. (XIII International School of Astrobiology. The origin of life: from monomers to cells. Universidad Internacional Menéndez Pelayo/NASA Astrobiology Institute/Centro de Astrobiología), 29/06/2015. Santander. SPAIN.
Minimal genomes and the Last Universal Common Ancestor. (XIII International School of Astrobiology. The origin of life: from monomers to cells. Universidad Internacional Menéndez Pelayo/NASA Astrobiology Institute/Centro de Astrobiología), 30/06/2015. Santander. SPAIN.
Metabolic evolution by symbiosis. (Biologisches Kolloquium, Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn. Grosser Hörsaal des Instituts für Zoologie, Poppelsdorfer Schloss), 13/01/2014. Bonn. GERMANY.
Metabolic innovation by endosymbiosis. (PRBB-CRG Conferences. Marie Curie Room), 13/05/2014. Barcelona. SPAIN.
Evolutionary innovations by symbiogenesis: from ancient to modern (geological) time. (Seminars, IAS-Research, Departamento de Lógica y Filosofía de la Ciencia, Universidad del País Vasco), 30/05/2014. San Sebastián. SPAIN.
Per què Darwin tenia raó i per què ens ha d'importar?. (Fòrum Vives: 20 anys de recerca en l'espai Vives. Universitat de Perpinyà), 08/10/2014. Perpinyà. FRANCE.
El origen de la vida. (Ciclo "Los orígenes". Ateneo de Granada, Instituto de Astrofísica de Andalucía (CSIC). Biblioteca de Andalucía), 16/10/2014. Granada. SPAIN.
Biologia sintètica: història d'una quimera realitzable. (Matinal de Biologia Sintètica: Com i per què fabricar vida. Octubre Centre de Cultura Contemporània), 25/10/2014. València. SPAIN.
Crónica de una vida sintética anunciada. (Conferencia en el marco del curso 'Historía de la biología y evolución', Facultad de Ciencias, Universidad Autónoma de Madrid), 01/12/2017. Madrid. SPAIN.
El origen de la vida en la Tierra. (El hecho evolutivo y la teoría que lo explica. Una visión multidiscioplinar. Centro Mediterráneo, Universidad de Granada.), 18/09/2017. SPAIN.
Simbiogénesis e innovación metabólica. (El hecho evolutivo y la teoría que lo explica. Una visión multidiscioplinar. Centro Mediterráneo, Universidad de Granada.), 18/09/2017. SPAIN.
L'origen de la vida. (Jornades d'activitats complementàries 2017, Facultat de Psicologia, Universitat de València), 07/03/2017. SPAIN.
L'origen de la vida: una narració científica inacabada. (Unisocietat, Universitat i Societat a Ontinyent, Universitat de València), 19/10/2017. SPAIN.
L'origen de la vida: una narració científica inacabada. (Universitat i Societat a Cullera, Universitat de València), 03/05/2017. SPAIN.
Darwin: la vigència de la teoria evolutiva. (Centre Internacional de Gandia, Universitat de València), 01/03/2017. SPAIN.

Participations in Conferences

Becerra, A.; Rivas, M.; García-Ferris, C.; Lazcano, A.; Peretó, J., (2014). A phylogenetic approach to the early evolution of autotrophy. (Paper). Origins 2014 International Conference. . . Nara . JAPAN.
Peretó, J., (2014). Metabolic innovation by symbiogenesis. (Invited paper). TAGp-2014: Evolution and Complexity. . . Campus Bourget du Lac . FRANCE.
Peretó, J., (2014). Plenary Session: Chemistry and Biology of the Origin. (Chair of session). Origins 2014 International Conference. . . Nara . JAPAN.
Ponce-de-León, M.; Peretó, J.; Montero, F., (2014). Network curation of genome-scale models through the structural properties of a metamodel. (Poster). XII Jornadas de Bioinformática. . . Sevilla . SPAIN.
Calle-Espinosa, J.; Ponce-de-León, M.; Montero, F.; Peretó, J., (2015). Three genes for a new network: impact of beta-carotene synthesis in the whitefly bacterial endosymbiont metabolism. (Poster). XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM). . . València . SPAIN.
Ponce-de-León, M.; Mori, M.; Tamarit, D.; Calle-Espinosa, J.; Peretó, J.; Montero, F., (2015). Analyzing metabolic complementation: genome-scale metabolic modeling of endosymbiont bacterial consortium in aphids. (Poster). XXXVIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM). . . SPAIN.
Peretó, J., (2015). Synthetic biology: Herrera's contribution. (Invited paper). Alfonso L. Herrera y la biología a principios del siglo XX en México. . . MEXICO.
Peretó, J., (2015). Lessons from history: promises and realities of the artificial synthesis of life. (Invited paper). Synthetic Biology: from standard biological parts to artificial a life. BDebate-International Centre for Scientific Debate. . . SPAIN.
Peretó, J., (2015). Commentary talk on: Evolution, complexity, and computation. (Commentator). ELSI Origins Network (EON) Road Map Workshop: The strategy for origins of life research. . . JAPAN.
Calle-Espinosa, J.; Montero, F.; Peretó, J., (2016). Prediction of bacterial optimal growth rates in insect-endosymbiont systems at exponential growth. (Paper). XIII Symposium on Bioinformatics. . . València . SPAIN.
Peretó, J., (2016). Erasing borders: a brief chronicle of synthetic biology. (Invited paper). EON-ELSI Workshop: History and philosophy of origins research. . . Tokyo . JAPAN.
Peretó, J., (2016). Vicente Villar Palasí y el eclipse de la bioquímica evolutiva. (Invited paper). Congreso Internacional: La evolución tras "La evolución" (Biblioteca de Autores Cristianos). . . València . SPAIN.
Peretó, J., (2016). The origins and early evolution of metabolic pathways. (Invited paper). Simposio Internacional: Los orígenes de la vida y su búscada en el universo. . . Madrid . SPAIN.
Peretó, J., (2017). Transmetabolism: beyond the conformist approach to metabolic engineering. (Invited paper). Multi-scale Biological Design. V Colloquium of the Systems & Synthetic Biology Program. . . Madrid . SPAIN.
Peretó, J., (2016). . (Participation in organiser committee). Congreso Internacional: La evolución tras "La evolución". . . València . SPAIN.
Reyes-Prieto, M.; Peretó, J., (2016). Exploring patterns of the protein's isolectric points of the endosymbiotic bacteria in insects. (Poster). V Congreso de la Sociedad Española de Biología Evolutiva (SESBE). . . Murcia . SPAIN.
Ponce-de-León, M.; Peretó, J.; Montero, F., (2016). iGOP: an iterative algorithm to resolve inconsistencies in genome-scale metabolic models. (Poster). XIII Symposium on Bioinformatics. . . València . SPAIN.
Muñoz-Benavent, M.; Picazo, C.; Domínguez-Santos, R.; Peretó, J.; Latorre, A.; Matallana, E.; García-Ferris, C., (2016). Análisis funcional del transportador GlpF de Blattabacterium para evaluar su papel en la complementación metabólica entre Blattella germanica y su endosimbionte. (Poster). VI Congreso de Microbiología Industrial y Biotecnología Microbiana, Sociedad Española de Microbiología. . . León . SPAIN.
Tanner, K.; Vilanova, C.; Abendroth, C.; Dorado-Morales, P.; Iglesias, A.; Peretó, J.; Porcar, M., (2016). Bioprospecting artificial environments: screening for biotechnologically-relevant bacterial strains. (Poster). 17th International Conference on Systems Biology. . . Barcelona . SPAIN.
Peretó, J., (2017). Premature synthetic biology or the pioneers of 'knowing-by-making' approach to life. (Invited paper). Synthetic Biology: past, present and future. IAS Research Symposium. Universidad de País Vasco. . . San Sebastián . SPAIN.
Peretó, J., (2017). Chronicle of a synthetic life foretold. (Invited paper). Synthetic Biology: Metaphors and responsability. Synthetic Biology Research Centre, Nottingham University. . . UNITED KINGDOM.
Moreno, C.; Peretó, J.; Torres, G.; Gavaldà, J., (2017). El rigor en la comunicación científica audiovisual. (Roundtable discussion). . . . SPAIN.
Abendroth, C.; Simeonov, C.; Peretó, J.; Antúnez, O.; Gavidia, R.; Luschnig, O.; Porcar, M., (2017). From grass to gas: microbiome dynamics of grass biomass acidification under mesophilic and thermophilic temperatures. (Poster). 7th Congress of European Microbiologists (FEMS). . . València . SPAIN.
Muñoz-Benavent, M; Picazo, C; Domínguez-Santos, R; Peretó, J; García-Ferris, C; Latorre, A., (2017). Assessing the role of candidate transporters in the metabolic complementation between Blattella germanica and its endosymbiont Blattabacterium. (Poster). FEMS 2017. . . Valencia . SPAIN.
Tanner, K,; Vilanova, C.; Peretó, J.; Porcar, M., (2017). The solar panel microbiome: composition, colonisation and biotechnological applications. (Poster). 7th Congress of European Microbiologists (FEMS). . . València . SPAIN.
Tanner, K.; Molina-Menor, E.; Vidal-Verdú, A.; Martorell, P.; Genovés, S.; Ramón, D.; Peretó, J.; Porcar, M., (2017). Protectores solares naturales en microorganismos que habitan placas solares. (Poster). Reunión Nacional sobre Carotenoides. . . València . SPAIN.
Peretó, J., (2018). Determinsim and contingency shape metabolic innovation during symbiogenesis. (Invited paper). Information and noise: chemistry, biology and evolution creating complex systems. Beilstein Bozen Symposium. . . Rüdesheim . GERMANY.
Peretó, J., (2018). Origin and early evolution of life. (Invited paper). Rencontres exobiologiques pour doctorants. Astrobiology Introductory Course. . . Réserve Ornithologique du Teich . FRANCE.
Vidal-Verdú, À.; Molina-Menor, E.; Tanner, K.; Peretó, J.; Porcar, M., (2018). La bacteria que funde el medio de cultivo: bioprospección de enzimas degradadoras de polímeros. (Poster). 41 Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular SEBBM. . . Santander . SPAIN.

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