El Doctorat està organitzat per la Facultat de Física. El seu període de formació s’estructura amb el Màster Universitari Física Avançada de la Universitat de València. El període d’investigació té un petit complement docent denominat "Seminaris Especialitzats" en el qual s'oferiran programes docents especialitzats en una o diverses temàtiques.

En aquest complement docent del Programa de Doctorat en Física participaran essencialment doctors del Departament d’Astronomia i Astrofísica, del Departament de Física Aplicada i Electromagnetisme, del Departament de Física Atòmica, Molecular i Nuclear, del Departament de Física Teòrica i del Departament d’Òptica, tots ells de la Universitat de València; doctors de l’Institut de Física Corpuscular (centre mixt Universitat de València-CSIC), i doctors de la Fundació General de la Universitat de València que estiguen adscrits com a investigadors a aquests departaments o a l’Institut.

Des del punt de vista acadèmic i científic, l’interès i la rellevància del Programa de Doctorat de Física està directament relacionat amb la capacitació que proporciona per a la docència i la investigació en els sector públic i privat. Addicionalment, des del punt de vista professional, la transcendència de la contribució de la física al desenvolupament tecnològic, i, per tant, a la formació de tecnòlegs és crucial en qualsevol societat moderna que vulga basar el seu desenvolupament en el coneixement d’avantguarda.