- Mecanismes subjacents al procés d’autoorganització en ecosistemes.
- Processos lacustres implicats en la desnitrificació de l’aigua que prové dels aquífers.
- Emisors i receptors de carboni al Parc Nacional Tablas de Daimiel.
- Contaminació de les aigües dolces per nitrats: solucions naturals y solucions tecnològiques.
- Descontaminació de les aigües riques en nitrats del Camp de Montiel.
- Efecte de la pèrdua i reintroducció d’espècies en l’estructura, funció i dinàmica dels ecosistemes.
- Reintroducció de caròfits en ecosistemes aquàtics de la Comunitat Valenciana.
- Vulnerabilitat d’ecosistemes aquàtics del Sud de la Península Ibèrica front a factors de canvi global. Radiació ultraviolada i aport de nutrients minerals.
- El binomi fitoplàncton-macròfits submergits. Les seues respostes front a canvis globals (augment de la radiació ultraviolada i eutrofització) i implicacions en la gestió de zones humides.
- Seguiment del plàncton i la vegetació sumergida en un àrea restaurada (Tancat de la Pipa (PN Albufera de Valencia).