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La sección de rayos X cuenta con varias técnicas destinadas a distintos objetivos.
Se dispone de dos equipos de difracción de rayos X para muestras monocristalinas, los cuales pueden analizar tanto monocristales de pequeñas moléculas como proteínas.
Puede optarse por la medición a baja temperatura o temperatura ambiente.
Se dispone además del software adecuado para la manipulación de datos y resolución de las estructuras medidas.
Para el análisis de muestras mediante fluorescencia de rayos X se dispone del espectrómetro Philips PW2400 con su software recientemente actualizado. En él se puede analizar muestras tanto líquidas como sólidas.