Este curso está concebido para profesionales que requieran en su trabajo del análisis de imágenes digitales para la obtención de datos cuantitativos. Aunque los contenidos y habilidades que se trabajan tienen una clara aplicación en los campos de la Microscopía y la Biología Celular, se trata de herramientas perfectamente trasladables al análisis de imágenes en otros ámbitos dentro y fuera de las Biociencias. El objetivo principal del curso es conseguir que las/os participantes comprendan la naturaleza de las imágenes digitales y sean capaces de manipularlas diseñando flujos de análisis completos para extraer datos cuantitativos no sesgados. El programa intercalada sesiones “teóricas” de conceptos y ejemplos con horas de “prácticas” consistentes en ejercicios guiados por el profesorado en la propia sesión y trabajo individual asíncrono. No se requieren conocimientos previos de análisis digital o programación.

OBJETIVOS FORMATIVOS

• Comprender la naturaleza y propiedades de las imágenes digitales.
• Reconocer y describir la importancia de las distintas etapas de un diagrama de flujo de trabajo de análisis de imagen.
• Conocer y aplicar diferentes técnicas de realce y restauración de imágenes, incluyendo la manipulación del histograma, la aplicación de filtros matriciales y las operaciones aritméticas entre imágenes.
• Distinguir entre los diferentes tipos de segmentación y ser capaz de aplicar diversas técnicas incluyendo tanto básicas (Thresholding) como avanzadas (basadas en machine learning) para la clasificación de píxeles y la identificación automática de objetos de interés.
• Comprender la naturaleza y propiedades de las imágenes binarias, así como las operaciones que pueden realizarse sobre ellas.
• Identificar los distintos parámetros morfométricos y densitométricos que se pueden extraer de las imágenes digitales y comprender su aplicación en el análisis cuantitativo.
• Entrenar a las/os estudiantes en el uso de programas de análisis de imagen de libre distribución.

• Unidad 1: Propiedades de la imagen digital y diagramas de flujo de análisis.
• Unidad 2: Operaciones de realce y restauración de imágenes digitales.
• Unidad 3: Técnicas de segmentación: clasificación de píxeles e identificación de objetos de interés.
• Unidad 4: Operaciones con imágenes binarias.
• Unidad 5: Obtención de medidas cuantitativas: parámetros y su aplicación.

Al finalizar la acción formativa el alumnado podrá:

• Comprender la esencia del proceso de digitalización de imágenes y las implicaciones que tiene a la hora de manipularlas y extraer datos cuantitativos de ellas.
• Reconocer en una imagen sus dimensiones y ser capaz de interpretar sus metadatos.
• Diseñar flujos de trabajo completos de análisis de imagen para la obtención de datos cuantitativos.
• Aplicar operaciones de realce y restauración de imágenes destinadas a corregir defectos en el proceso de captura y/o a favorecer la posterior identificación de objetos.
• Segmentar imágenes digitales utilizando técnicas con distinto nivel de complejidad para lograr la identificación automática de objetos/regiones de interés.
• Manipular de manera eficiente imágenes binarias.
• Extraer todo tipo de parámetros cuantitativos de los objetos de interés identificados en forma de tabla de resultados y comprender su naturaleza y aplicaciones.

El aprovechamiento de este curso requiere del alumnado:

• Asistencia al 85% de las sesiones online
• Entrega de todas las tareas asíncronas solicitadas dentro del plazo estipulado