Juli Peretó

 ©Mar Peretó

 



 


pereto(at)uv.es

phone: +34 96 354 3666

Mailing address
Institut de Biologia Integrativa de Sistemes
C. Jose Beltran 2
E-46980 Paterna, Spain







Position

Associate Professor of Biochemistry and Molecular Biology at Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of València

Co-director, Institute for Integrative Systems Biology (I2SysBio, UVEG-CSIC)

Education

B.Sc. (Chemistry), University of Valencia (1980), Ph.D. (Biochemistry), University of Valencia (1988)

Major research interests

My main research interests are related to the origin and early evolution of life, the evolution of metabolism, the symbiogenetic evolution of metabolic pathways, the stoichiometric analysis of metabolic networks, and the history of ideas on the natural origin and the artificial synthesis of life.

Current research projects

  • Microbial bioprospection of natural environments
  • Inference from complete genome sequences and
    stoichiometric analysis of metabolic networks
  • Evolution of metabolism and symbiosis
  • The minimal cell concept
  • Historical origins of synthetic biology

Academies and Scientific Societies

  • Full Member, Secció de Ciències Biològiques, Institut d’Estudis Catalans (UAI)
  • Fellow (2014–) International Society for the Study of the Origin of Life (ISSOL), Secretary (2005-08), 2nd Vicepresident (2011-14), Councilor (2014-17)
  • Member Societat Catalana de Biologia (SCB)
  • Member Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM)
  • Member Sociedad Española de Microbiología (SEM)

Publications


ORCID ID 0000-0002-5756-1517

0000-0002-5756-1517
0000-0002-5756-1517
0000-0002-5756-1517

Research papers in PubMed.

Other articles and chapters in books

  1. PERETÓ, J, Pamblanco, M (1987)  Textbook Error: The products of photosynthetic fixation of CO2 in plants. Trends in Biochemical Sciences 12, 3.
  2. PERETÓ, J (1992) De la zimasa al ribozim: l’evolució del concepte d’enzim. Treballs de la Societat Catalana de Biologia 43, 117-123.
  3. Domínguez, M., PERETÓ, J (1993) Déu no juga als daus, però li agrada el bricolatge. Entrevista amb François Jacob. Mètode 4, 22-29.
  4. PERETÓ, J (1995) The unresolved enigma of the origin of life: at the centennial of the birth of Aleksandr I. Oparin. Microbiología SEM 11, 263-272.
  5. PERETÓ, J (1996) The Calvin cycle: A metabolic pathway still misunderstood. Biochemical Education 24,147-148.
  6. PERETÓ, J, Fani, R, Leguina, JI, Lazcano, A (1997) Enzyme evolution and the development of metabolic pathways. In: New Beer in an Old Bottle. Eduard Buchner and the growth of biochemical knowledge (Athel Cornish-Bowden, ed), pp. 173-191. Publicacions de la Universitat de València.
  7. PERETÓ, J, Beltrán, A (1999) La investigació científica i tècnica al País Valencià. In: Història, Política, Societat i Cultura dels Països Catalans (Culla, JB, dir.). Enciclopèdia Catalana, Barcelona, vol. 12, p. 360-361.
  8. PERETÓ, J (1999) El futur de la recerca bàsica a la universitat. L’Espill 2, 88-99.
  9. PERETÓ, J, Velasco, AM, Becerra, A, Lazcano, A (1999) Comparative biochemistry of CO2 fixation and the evolution of autotrophy. International Microbiology 2, 3-10.
  10. Ruiz-Mirazo, K, Moreno, A, Morán, F, PERETÓ, J, Merelo, JJ (1999) Designing a simulation model of a self-replicating cellular system. In: Advances in Artificial Life (D. Floreano, J.D. Nicoud, F. Mondada, eds). 5th European Conference, ECAL 99, Springer, Berlin, pp. 379-388.
  11. PERETÓ, J, Morales, FJ (2000) Panorama actual. In: Història de la Universitat de València. Vol. III La Universitat Liberal (segles XIX i XX), p. 343-364.
  12. PERETÓ, J (2000) L’arbre de la vida: d’ufanós a marcit. Mètode 28, 29-34.
  13. PERETÓ, J (2000) L’evolució química i l’origen de la vida. Revista de la Societat Catalana de Química 1, 8-14.
  14. PERETÓ, J (2001) Reescrivint el Gènesi: un relat del nostre (des)coneixement sobre l’origen de la vida. In: Homenatge als nostres pobles i a la seua gent (V. Pitarch, coord.). Publicacions de la Presidència, núm. 6, IEC, Barcelona, pp. 37-54.
  15. PERETÓ, J (2002) Cent cinquanta anys seran suficients? Per a que l’evolucionisme il·lumine el pensament contemporani. L’Espill 11, 56-65.  
  16. PERETÓ, J, Lazcano, A (2003) Qui va cuinar la sopa? L’experiment de Miller i l’inici de la química prebiòtica. Mètode 39, 25-28.
  17. PERETÓ, J, Lazcano, A (2003) El experimento de Miller y el inicio de la química prebiótica. Mundo Científico, núm. 247, 44-45.
  18. PERETÓ, J. (2005) Controversies on the origin of life. International Microbiology 8, 23-31.
  19. PERETÓ, J., Català, J., Moreno, A. (2005) Qu’est-ce que la vie? La Recherche 390, 36-40. (In Catalan, Mètode 50, 41-45.
  20. PERETÓ, J (2005) Els orígens químics de la vida. Omnis Cellula (octubre), 6-14.
  21. PERETÓ, J (2006) L’origen de la vida (Introducció del llibre L’origen de la vida, A.I. Oparin, J.B.S. Haldane, PUV). Omnis Cellula 11, 36-42.
  22. PERETÓ, J (2006) El disseny intel·ligent i l’assalt a la ciència. L’Espill 22, 6-16. English version: Intelligent design and the assault on science, published in Eurozine and Transfer. Journal of Contemporary Culture 2 (2007), 6-17 PDF.
  23. Pascal, R, Boiteau, L, Forterre, P, Gargaud, M, Lazcano, A, López-Garcia, P, Moreira, D, Maurel, MC, PERETÓ, J, Prieur, D, Reisse, J (2006) Prebiotic chemistry. Biochemistry. Emergence of life (4.4-2 Ga). Earth, Moon, and Planets 98, 153-203.
  24. Olasagasti F, Moreno A, PERETÓ J, Morán F. (2007) Energetically plausible model of a self-maintaining protocellular system. Bulletin of Mathematical Biology 69, 1423-1445.
  25. PERETÓ, J, Català, J (2007) The Renaissance of Synthetic Biology. Biological Theory 2, 128-130.
  26. PERETÓ, J (2007) L’enganyifa del disseny intel·ligent. Ciència obsoleta i pseudociència en el neocreacionisme. Mètode 54, 55-61.
  27. PERETÓ, J (2007) Darwin vive (también) entre las moléculas. SEBBM 153, 3-4.
  28. PERETÓ, J (2007) El neocreacionismo del diseño inteligente: entre la bioquímica obsoleta y la seudociencia. SEBBM 153, 18-11.
  29. PERETÓ, J, Català, J, Moya, A (2008) La synthèse d’êtres vivants. Pour la Science (Dossier: Où est née la vie?) Juillet/Septembre, 48-52.
  30. Iturbe, U, PERETÓ, J, Lazcano A (2008) The young Ramón y Cajal as a cell-theory dissenter. International Microbiology 11, 143-145.
  31. Gabaldón, T, Gil, R, PERETÓ, J, Latorre, A, Moya, A (2008) The core of a minimal gene set: insights from natural reduced genomes. In: Protocells: bridging nonliving and living matter (S Rasmusen, MA Bedau, L Chen, D Deamer, DC Krakauer, NH Packkard, PF Stadler, eds.). MIT Press, Boston. pp. 347-366.
  32. PERETÓ, J (2008) Sobre la naturaleza y fabricación de seres vivos. Apuntes de Ciencia y Tecnología 27, 30-38.
  33. Català, J, PERETÓ, J (2009) El Darwin indigesto: repercusiones políticas, sociales y religiosas del darwinismo. In: El alcance del darwinismo a los 150 años de la publicación de El Origen de las Especies (C. López Fanjul, ed.), pp. 208-231. Colegio Libre de Eméritos, Madrid.
  34. PERETÓ, J (2009) A partir d’un inici tan simple. L’origen de la vida, un problema de química amb història. Treballs de la Societat Catalana de Biologia 60, 31-44.
  35. PERETÓ, J (2009)  ¿Cuándo empezó la evolución biológica? Apuntes de Ciencia y Tecnología 32, 8-9.
  36. PERETÓ, J (2009) ¿Qué sabemos hoy sobre el origen de la vida? Alambique. Didáctica de las Ciencias Experimentales 62, 20-28.
  37. PERETÓ, J (2009) Simbiogènesis metabòliques en animals. Omnis Cellula 21, 7.
  38. PERETÓ, J (2009) Sobre evolución, bioquímica y biología molecular: añada la palabra clave complejidad. SEBBM 160, 5-9.
  39. Moya A, PERETÓ, J, Latorre, A (2009) Simbiosis en clave evolutiva. In: Adaptación y evolución, 150 años después del Origen de las Especies (A Navarro and H Dopazo, eds.), pp. 359-365. ObraPropia/SESBE, València.
  40. PERETÓ, J (2010) The Ethics of Protocells (Book Review). American Journal of Human Biology 22, 141-142.
  41. Delaye, L, Gil, R, PERETÓ, J, Latorre, A, Moya, A (2010) Life with a few genes: a survey on naturally evolved reduced genomes. The Open Evolution Journal 4, 12-22.
  42. Lazcano, A, PERETÓ, J (2010) Should the teaching of biological evolution include the origin of life? Evolution, Education and Outreach 3, 661-667.
  43. PERETÓ, J (2010) Contra Darwin. Antievolucionisme i creacionisme en el món actual. In: Darwin, el seu temps, la seua obra, la seua influència (J. Català, V. Navarro, eds.), pp. 102-11. Càtedra de Divulgació de la Ciència, Universitat de València i Institut d’Estudis Catalans.
  44. Neef, A, Delaye, L, López-Sánchez, MJ, PERETÓ, J, Latorre, A, Moya, A (2010) Stages of metabolism adaptation of endosymbiotic bacteria. Nova Acta Leopoldina 111 (378), 141-149.
  45. PERETÓ, J (2010) La vigència del llegat de Darwin. L’Atzavara (Revista de la Secció de Ciències Naturals del Museu de Mataró) 19, 5-11.
  46. Català, J, PERETÓ, J (2010) La teoria de l’evolució ha significat molt més que una teoria científica. Entrevista a Janet Browne. Mètode 64, 41-44.
  47. PERETÓ, J (2010) L’any Darwin: assaig de balanç, retrospectiva i perspectiva. Omnis Cellula 24, 44-46.
  48. PERETÓ, J (2011) Origin and evolution of metabolisms. In: Origins and Evolution of Life. An Astrobiological Perspective (M Gargaud, P López-Garcia, H Martin, eds.), pp. 270-287. Cambridge University Press, Cambridge.
  49. Latorre, A, Durbán A, Moya A, PERETÓ, J (2011) The role of symbiosis in eukaryotic evolution. In: Origins and Evolution of Life. An Astrobiological Perspective (M Gargaud, P López-Garcia, H Martin, eds.), pp. 326-343. Cambridge University Press, Cambridge.
  50. González-Domenech, CM, Puchalka, J, Martins dos Santos, VAP, PERETÓ, J, Moya, A, Delaye, L (2011) Metabolic reconstruction of Synechococcus elongatus towards a minimal photoautotrophic cell. In: Microorganisms in Industry and Environment. From Scientific and Industrial Research to Consumer Products (A Méndez-Vilas, ed.), pp. 699-703. World Scientific, Singapore.
  51. PERETÓ, J (2011) Book Review: Creating Life in the Lab: How New Discoveries in Synthetic Biology Make a Case for the Creator, by Fazale Rana. Reports of the National Center for Science Education 31 (6), 8.1-8.3.
  52. González-Toril, E, PERETÓ, J (2011) Autotrophy. In: Encyclopedia of Astrobiology (M Gargaud, ed. in chief) vol. 1, pp. 228-229. Springer, Heidelberg.
  53. PERETÓ, J (2011) Citric Acid Cycle. In: Encyclopedia of Astrobiology (M Gargaud, ed. in chief) vol. 1, pp. 314-316. Springer, Heidelberg.
  54. PERETÓ, J (2011) Fermentation. In: Encyclopedia of Astrobiology (M Gargaud, ed. in chief) vol. 1, pp. 583-584. Springer, Heidelberg.
  55. Aguadé, M, Bertranpetit, J, PERETÓ, J (2012) Genomes i evolució: impacte en la biologia actual. Treballs de la Societat Catalana de Biologia 63, 101-122.
  56. Moya, A, PERETÓ, J (2012) ¿Hacia la fabricación de vida? Pasajes de Pensamiento Contemporáneo 38, 4-5.  
  57. PERETÓ, J, Català, J (2012) Darwinism and the origin of life. Evolution, Education and Outreach 5, 337-341.
  58. Porcar, M, PERETÓ, J (2012) Are we doing synthetic biology? Systems and Synthetic Biology 6, 79-83.
  59. Moreno, A, PERETÓ, J (2013) ¿Qué es la vida? de Erwin Schrödinger. ¿Vale la pena leerlo? SEBBM 175, 7-9.
  60. PERETÓ, J (2013) Theories of origin of life. In: Brenner’s Encyclopedia of Genetics, 2nd ed. (S Maloy, K Hughes, eds.), pp. 185-188. Academic Press, San Diego.
  61. PERETÓ, J (2013) Members of all kingdoms. In: Once upon a time Lynn Margulis (C Chica, ed.) pp. 153-159. Septiminus, Barcelona.
  62. PERETÓ, J (2014) Simbiogénesis y bricolaje metabólico. SEBBM (online text). 
  63. PERETÓ, J (2014) La vida impura. Algunes visions sobre la vida que ens ha llegat Lynn Margulis. Treballs de la Societat Catalana de Biologia 65, 56-59 (Open Access text).
  64. Porcar, M, PERETÓ, J (2015) ¿Quién hace biología sintética? Encuentros en la Biología 8 (153), 5-6.
  65. PERETÓ, J, Lazcano A, coord. (2015) L’origen de la vida. Monogràfic. Mètode Science Studies Journal 87, 47-103. (Articles in Catalan and Spanish).
  66. Marco-Casanova, P, PERETÓ, J (2015) La gent subestima el que la química pot arribar a fer. Entrevista a John Sutherland. Mètode Science Studies Journal 87, 97-103.
  67. PERETÓ, J (2015) L’origen de la vida: el que li hauria agradat saber a Darwin. Debats de Recerca (Societat Andorrana de Ciències) 6-7, 111-118. DOI: 10.2436/15.0110.21.9
  68. Dorado-Morales, P, Vilanova, C, PERETÓ, J, Codoñer, FM, Ramón, D, Porcar, M (2015) A highly diverse, desert-like microbial biocenosis on solar panels in a Mediterranean city. bioRxiv DOI: 10.1101/029660. Published in Scientific Reports 6, 29235 (Open Access text)
  69. Valverde, S, Porcar, M, PERETÓ, J, Solé, RV (2016) The software crisis in synthetic biology.  bioRxiv DOI: 10.1101/041640
  70. Calle-Espinosa, J, Ponce-de-León, M, Santos, D, Silva, FJ, Montero, F, PERETÓ, J (2016) Nature lessons: the whitefly bacterial endosymbiont is a minimal amino acid factory with unusual energetics. bioRxiv DOI: 10.1101/043349. Published in Journal of Theoretical Biology 407, 303-317.
  71. Mori, M, Ponce-de-León, M, PERETÓ, J, Montero, F (2016) Metabolic complementation in bacterial communities: necessary conditions and optimality. bioRxiv DOI: 10.11.01/064121. Published in Frontiers in Microbiology 7, 1553 (Open Access text)
  72. PERETÓ, J, Català, J (2016) Reconciliar-se amb Darwin? Les visions divergents de l’evolucionisme en Erich Wasmann i Jaume Pujiula, biòlegs i jesuïtes. Mètode Science Studies Journal 90, 85-91 (also in Spanish and English) DOI: 10.7203/metode.7.7996
  73. PERETÓ, J (2016) La ciencia nunca se acaba. Pasajes de Pensamiento Contemporáneo 50, 185-187.

 

Books (author)

  1. PERETÓ, J (1994) Orígenes de la evolución biológica. Eudema Biología, Madrid, 96 pp.
  2. PERETÓ, J, Sendra, R, Pamblanco, M, Bañó, MC (1996) Fonaments de Bioquímica. 2ª ed. 1996, 3ª ed. 1998, 4a ed. 2001, 5ª ed. 2005. Col·lecció Educació, Sèrie Materials, núm. 15. Publicacions Universitat de València (textbook) 330 pp. First edition in Spanish (2006).
  3. PERETÓ, J (2000) Tan bell i sempre esponerós. Realitat i metàfora de l’arbre de la vida. Discurs de recepció com a membre numerari de la Secció de Ciències Biològiques de l’Institut d’Estudis Catalans. IEC, Barcelona, 40 pp.
  4. PERETÓ, J (2003) Què és la vida i com podem fabricar-la. Discurs llegit en la sessió inaugural del curs 2003-2004. IEC, Barcelona, 77 pp.
  5. Moya, A, PERETÓ, J (2011) Simbiosis: seres que evolucionan juntos. Síntesis, Madrid.
  6. Porcar, M, PERETÓ, J (2014) Synthetic Biology: from iGEM to the artificial cell. Springerbriefs, Springer, Dordrecht, xii+77 pp (about this book).

 

Books (editor)

  1. PERETÓ, J (2003) Lynn Margulis: una revolución en la evolución. PUV, València, 374 pp.
  2. PERETÓ, J (2006) A. I. Oparin, J. B. S. Haldane: L’origen de la vida. Introduction (p. 7-22). PUV (Breviaris 11), València, 109 pp.
  3. Moya, A, PERETÓ, J (2007) François Jacob: el desván de la evolución. PUV, València, 360 pp.
  4. PERETÓ, J, Costa, M (2008) C. R. Darwin, A. R. Wallace: La lluita per la vida. Introduction (p. 7-20). PUV (Breviaris 20), València, 89 pp.
  5. Moya, A, PERETÓ, J (2009) Charles Darwin. L’origen de les espècies/El origen de las especies/The Origin of Species. Abridged and illustrated edition. PUV, València.
  6. PERETÓ ,J (2011) Field Editor of Biochemistry. Encyclopedia of Astrobiology (Gargaud M et al., eds.). 3 vols. Springer, Heidelberg, 1853 pp.
  7. Cleaves, HJ, Lazcano, A, Ledesma Mateos, I, Negrón-Mendoza, A, PERETÓ, J, Silva, E (2014) Herrera’s ‘Plasmogenia’ and other collected works. Early writings on the experimental study of the origin of life. Springer, New York, 233 pp (about this book).
  8. PERETÓ, J  (2015) Section Editor of Biochemistry. Encyclopedia of Astrobiology 2nd Edition (Gargaud M and Irvine WM, Editors-in-Chief). 3 vols. Springer Reference, Heidelberg, 2737 pp.

 

Books (translator)

  1. Homenatge a Stanley Miller. Primera Conferència Peregrin Casanova de Biodiversitat i Biologia Evolutiva. Càtedra de Divulgació de la Ciència de la Universitat de València, 2003 (Catalan).
  2. My Life in Science. Sydney Brenner. Translated to Catalan as Sydney Brenner. Viure per a la ciència, Col. Sense Fronteres, núm. 16, Ed. Bromera/Publicacions Universitat de València, 2004 (Catalan).
  3. Francisco Ayala. La evolución de un evolucionista. Col. Honoris Causa, Universitat de València; collected papers edited by A. Moya and A. Latorre (2006) (Spanish).
  4. J. B. S. Haldane: The Origin of Life (1929). In: L’origen de la vida (PUV, 2006), p. 95-109 (Catalan).
  5. Biochemistry, 6th edition. JM Berg, JL Tymoczko and Lubert Stryer. Curator of the Catalan translation, Ed. Reverté, Barcelona (2007).
  6. Selected letters and papers by C. R. Darwin and A. R. Wallace. In: La lluita per la vida (PUV, 2008), p. 23-89 (Catalan).
  7. Molecules. The elements and the architecture of everything. T Gray. Curator of the Catalan translation, PUV/IEC/UAB, València (2015).

Teaching

Undergraduate (University of Valencia): General Biochemistry, Bioenergetics, Chemical and Biochemical Evolution (extinct), Biology, Major Transitions in Evolution, Metabolism (for biotechnologists 2011–), Molecular and Biochemical Evolution (for biochemists, 2012–), Instructor of Valencia-Biocampus iGEM team (2012: Talking Life, 2013: Wormboys, 2014: ST2OOL).

Master Programs in Molecular and Cell Biology, in Biodiversity and Evolution, in Integrative Evolutionary Biology, and in Bioinformatics (University of Valencia): Comparative Biochemistry and Evolution of the Cell (extinct), Design and Evolution of Metabolism (extinct), Evolution of Complex Organic Systems–A Metabolic Perspective (2013), Computational Systems Biology (2014–).

International Teaching Director of the Erasmus Intensive Programme (IP) Origin, Evolution and Future of the Biosphere (2012-14).

 

Last update: April 1, 2017