Fitxa persona

JOSE ENRIQUE PEREZ ORTIN
PDI-Catedratic/a d'Universitat
Coordinador/a de Programa de Doctorat
Secretari/a d' Institut Universitari

jose.e.perez@uv.es
http://www.uv.es/perezje

Àrea de coneixement: BIOQUÍMICA I BIOLOGIA MOLECULAR
Departament: Bioquímica i Biologia Molecular

E.R.I. Biotecmed Dr. Moliner 50 E46100 Burjassot Spain
(9635) 43467

Asignatures impartides i modalitats docents

44695 - Tecnologies òmiques - Màster Universitari en Investigació i Desenvolupament en Biotecnologia i Biomedicina
33171 - Bioquímica - Grau en Biotecnologia
33135 - Biosíntesi macromolècules i regulació - Grau en Bioquímica i Ciències Biomèdiques
33159 - Treb. fi grau bioquim.cienc.biomèd - Grau en Bioquímica i Ciències Biomèdiques
44703 - Treball Fin de Màster - Màster Universitari en Investigació i Desenvolupament en Biotecnologia i Biomedicina

Tutories

16/09/2024 - 16/05/2025

LUNES de 14:00 a 17:00 DESPATX Planta 1 FAC. BIOLÒGIQUES (BLOC A)

16/09/2024 - 16/05/2025

VIERNES de 11:00 a 13:00 DESPATX Planta 1 FAC. BIOLÒGIQUES (BLOC A)

Formació acadèmica

Publicacions en revistes

Igual, J.C.; Matallana, E.; González-Bosch, C.; Franco, L.; Pérez-Ortín, J.E. (1991) A new glucose-repressible gene identified from the analysis of chromatin structure of deletion mutants of the yeast SUC2 locus. Yeast, 7, pp. 379 - 389 . ISSN: 1097-0061
Matallana, E.; Franco, L. y Pérez-Ortín, J.E. (1992) Chromatin structure of the yeast SUC2 promoter in regulatory mutants. Molecular and General Genetics, 231, pp. 395 - 400 . ISSN: 0026-8925
Igual, J.C.; González-Bosch, C; Dopazo, J.; Pérez-Ortín, J.E. (1992) Phylogenetic analysis of the thiolase family. Implications on the evolutionary origin of peroxisomes. Journal of Molecular Evolution, 35, pp. 147 - 155 . ISSN: 0022-2844
Igual, J.C.; González-Bosch, C.; Franco, L.; Pérez-Ortín, J.E. (1992) The POT1 gene for the yeast peroxisomal thiolase is subjected to three different mechanisms of regulation. Molecular Microbiology, 6, pp. 1867 - 1875 . ISSN: 0950-382X
Del Olmo M. y Pérez-Ortín, J.E. (1993) A natural A/T-rich sequence from the 3' end of yeast FBP1 gene exists as a cruciform in E. coli cells. Plasmid, 29, pp. 222 - 232 . ISSN: 0147-619X
Tordera, V., Sendra, R. y Pérez-Ortín, J.E. (1993) The role of histones and their modifications in informative content of chromatin. Experientia, 49, pp. 780 - 788 . ISSN: 0014-4754
Del Olmo, M.; Sogo, J.M.; Franco, L. y Pérez-Ortín, J.E. (1993) Chromatin structure of the yeast FBP1 gene: transcription-dependent changes in the regulatory and coding regions. Yeast, 9, pp. 1229 - 1240 . ISSN: 1097-0061
Bargues, M.; Salom, D.; Gómez, A.; Paricio, N.; Pérez-Alonso, M. y Pérez-Ortín, J.E. (1996) Sequencing analysis of a 4.1 kb subtelomeric region from yeast chromosome IV identifies HXT15, a new member of the hexose transporter family. Yeast, 12, pp. 1005 - 1011 . ISSN: 1097-0061
Puig, S.; Querol, A.; Ramón, D. y Pérez-Ortín, J.E. (1996) Evaluation of the use of late phase gene promoters for the expression of enological enzymes in an industrial wine yeast strain. Biotechnology Letters, 18, pp. 887 - 892 . ISSN: 0141-5492
Jacq, C...Pérez-Ortín, J.E. et al. (1997) The complete nucleotide sequence of yeast chromosome IV. Nature, 387 (suplement), pp. 75 - 78 . ISSN: 0028-0836
Aranda, A.; Pérez-Ortín, J.E.; Benham, C.J. y del Olmo, M. (1997) Analysis of the in vivo structure of a natural alternating d(TA)n sequence in yeast chromatin. Yeast, 13, pp. 313 - 326 . ISSN: 1097-0061
Puig, S., Ramón D. y Pérez-Ortín, J. E. (1998) An optimized method to obtain stable food-safe recombinant wine yeast strains. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 46, pp. 1689 - 1693 . ISSN: 0021-8561
Aranda, A.; Pérez-Ortín, J.E.; Moore, C. y del Olmo, M. (1998) Transcription termination downstream of the Saccharomyces cerevisiae FBP1 poly(A) site does not depend on efficient 3' end processing. RNA-A Publication of the Rna Society, 4(3), pp. 303 - 318 . ISSN: 1355-8382
Ruiz-García, A.B.; Sendra, R.; Galiana, M.; Pamblanco, M.; Pérez-Ortín, J.E. y Tordera., V. (1998) HAT1 and HAT2 proteins are componets of a yeast nuclear histone acetyltransferase enzyme specific for free histone H4. Journal of Biological Chemistry, 273, pp. 12599 - 12605 . ISSN: 0021-9258
Aranda, A.; Pérez-Ortín, J.E.; Moore, C. y del Olmo, M. (1998) The yeast FBP1 poly(A) signal functions in both orientations and overlaps with a gene promoter. Nucleic Acids Research, 26(20), pp. 4588 - 4596 . ISSN: 0305-1048
Gimeno-Alcañiz, J.; Pérez-Ortín, J.E. y Matallana, E. (1999) Differential patterns of threalose accumulation in wine yeast strains during microvinification process. Biotechnology Letters, 21, pp. 271 - 274 . ISSN: 0141-5492
Ivorra, C.; Pérez-Ortín, J.E.y del Olmo, M. (1999) Reverse correlation of stress-resistance ability and stuck fermentations in wine yeasts. A molecular study. Biotechnology and Bioengineering, 64(6), pp. 698 - 708 . ISSN: 0006-3592
Rodriguez-Navarro, S.; Estruch, F. y Pérez-Ortín, J.E. (1999) Functional analysis of twelve ORFs from Saccharomyces cerevisiae. Yeast, 15, pp. 913 - 919 . ISSN: 1097-0061
Puig, S.; Matallana, E. y Pérez-Ortín, J.E (1999) Stochastical nucleosome positioning in a yeast chromatin region is not dependent on Histone H1. Current Microbiology, 39, pp. 168 - 172 . ISSN: 0343-8651
Puig, S.; Pérez-Ortín, J.E y Matallana, E. (1999) Transcriptional and structural study of a region of two convergent overlapping yeast genes. Current Microbiology, 39, pp. 369 - 373 . ISSN: 0343-8651
Puig, S.y Pérez-Ortín, J.E. (2000) Stress response and expression patterns in wine fermentation of yeast genes induced at the diauxic shift. Yeast, 16, pp. 139 - 148 . ISSN: 1097-0061
van Helden, J.; Olmo Muñoz, Marcel·lí del; Pérez Ortín, José Enrique (2000) Statistical analysis of yeast genomic downstream sequences reveals putative polyadenylation signals. Nucleic Acids Research, 28(4), pp. 1000 - 1010 . ISSN: 0305-1048
Puig Todolí, Sergi; Querol Simón, Amparo; Barrio Esparducer, Eladio; Pérez Ortín, José Enrique (2000) Mitotic recombination and genetic changes in Saccharomyces cerevisiae during wine fermentation. Applied and Environmental Microbiology, 66(5), pp. 2057 - 2061 . ISSN: 0099-2240
Puig, S. y Pérez-Ortín, J.E. (2000) Expression levels and pattern of glycolytic yeast genes during wine fermentation. Systematic and Applied Microbiology, 23, pp. 300 - 303 . ISSN: 0723-2020
Hauser, N.C.; Fellenberg, K.; Gil, R., Bastuck, S.; Hoheisel, J.D.; Pérez Ortín, José Enrique (2001) Whole genome analysis of a wine yeast strain. Comparative And Functional Genomics, 2(2), pp. 69 - 79 . ISSN: 1531-6912
PAMBLANCO, M.; POVEDA, A.; SENDRA, R.; RODRÍGUEZ-NAVARRO, S.; PÉREZ-ORTÍN, J. E.; TORDERA, V. (2001) Bromodomain factor 1 (Bdf1) protein interacts with histones. Febs Letters, 496, pp. 31 - 35 . ISSN: 0014-5793
Rodríguez-Navarro, S.; Igual, J.C.; Pérez-Ortín, J.E. (2002) SRC1: an intron-containing yeast gene involved in sister chromatid segregation. Yeast, 19, pp. 43 - 54 . ISSN: 1097-0061
Pérez-Ortín, J.E.; García-Martínez, J. and Alberola T. M. (2002) DNA chips for yeast biotechnology. The case of wine yeasts. Journal of Biotechnology, 98, pp. 227 - 241 . ISSN: 0168-1656
Pérez-Torrado, R., Carrasco, P., Aranda, A., Gimeno-Alcañiz, J., Pérez-Ortín, J.E., Matallana, E, y Del Olmo, M. (2002) Study of the first hours of vinification by the use of osmotic stress-specific response genes as probes. Systematic and Applied Microbiology, 25(1), pp. 153 - 161 . ISSN: 0723-2020
Rodríguez-Navarro, Susana; Llorente, B.; Rodríguez-Manzaneque, M.T.; Ramne, A.; Uber Garcia, Genoveva; Marchesan, D.; Dujon, B.; Herrero,E.; Sunnerhagen, P.; Pérez-Ortín, José Enrique (2002) Functional analysis of yeast gene families involved in metabolism of vitamins B1 and B6. Yeast, 19, pp. 1261 - 1276 . ISSN: 1097-0061
Pérez Ortín, José Enrique; Querol Simón, Amparo; Puig Todolí, Sergi; Barrio Esparducer, Eladio (2002) Molecular characterization of a chromosomal rearrangement involved in the adaptative evolution of yeast strains. Genome Research, 12(10), pp. 1533 - 1539 . ISSN: 1088-9051
Carrasco, P.; Pérez-Ortín, J.E. y del Olmo, M. (2003) Arginase Activity is a Useful Marker of Growth Nitrogen Limitation During Wine Fermentations. Systematic and Applied Microbiology, 26, pp. 471 - 479 . ISSN: 0723-2020
Rodríguez-Navarro, Susana; Fischer, Tomás; Luo, Ming Juan; Antúnez, Oreto; Brettschneider, Susanne; Pérez Ortín, José Enrique; Reed, Robin; Hurt, Ed (2004) SUS1, a functional component of the SAGA transcription complex and the mRNA export machinery. Cell, 116(1), pp. 75 - 86 . ISSN: 0092-8674
Bellí, G.; Molina, M.M.; García Martínez, José; Pérez-Ortín, José Enrique; Herrero, Enrique (2004) Saccharomyces cerevisiae glutaredoxin 5-deficient cells subjected to constitutive oxidizing conditions are affected in the expression of specific sets of genes. Journal of Biological Chemistry, 279(13), pp. 12386 - 12395 . ISSN: 0021-9258
Alberola, T. M., García-Martínez, J., Antúnez, O., Viladevall, L., Barceló, A., Ariño, J. y Pérez-Ortín, J.E. (2004) A new set of DNA macrochips for the yeast Saccharomyces cerevisiae: features and uses. International Microbiology, 7(3), pp. 199 - 206 . ISSN: 1139-6709
Pérez-Ortín, J.E.; del Olmo, M.; Matallana, E. y Tordera, V. (1997) Make your own gene library. Biochemical Education, 25, pp. 237 - 242 . ISSN: 0307-4412
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Güldener, U; Münsterkötter, M.; Kastenmüller, G; Strack1, N; van Helden, J.; Lemer, C.; Richelles, J.; Wodak, S.J.; García Martínez, José; Pérez Ortín, José E.; Michael, H.; Kaps, A.; Talla, E.; Dujon, B.; André, B.; Souciet, J.L.; De Montigny, J.; Bon, E.; Gaillardin, C. y Mewes, H.W (2005) CYGD: The Comprehensive Yeast Genome Database. Nucleic Acids Research, 33(suppl 1), pp. D364 - D368 . ISSN: 0305-1048
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Solieri, L.; Gullo, M.; De Vero, L.; Antúnez, O.; Pérez Ortín, José Enrique; Giudici, P. (2005) Homogeneity of Interspecific Hybrids Between Saccharomyces cerevisiae and Saccharomyces uvarum by Phenotypic and Transcriptional Analysis. International Journal of Biotechnology & Biochemistry (IJBB), 1(1), pp. 11 - 21 . ISSN: 0973-2691
Pelechano, Vicente José; García Martínez, José; Pérez Ortín, José Enrique (2006) A genomic study of the Inter-ORF distances in Saccharomyces cerevisiae. Yeast, 23, pp. 689 - 699 . ISSN: 1097-0061
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Rosaleny Peralvo, Lorena Estefanía; Ruiz García, Ana Belén; García Martínez, José; Pérez Ortín, José Enrique; Tordera Donderis, Vicente (2007) The Sas3p and Gcn5p histone acetyltransferases are recruited to similar genes. Genome biology, 8(6), p. R119 . ISSN: 1474-7596
Mendes-Ferreira A.; Olmo Muñoz, Marcel·li del; García Martínez José; Jiménez Martí, Elena; Leão, C.; Mendes-Faia A, Pérez Ortín José E. (2007) Saccharomyces cerevisiae signature genes for predicting nitrogen deficiency during alcoholic fermentation. Applied and Environmental Microbiology, 73(16), pp. 5363 - 5369 . ISSN: 0099-2240
Pelechano García, Vicente José; Pérez Ortín, José Enrique (2007) The transcriptional inhibitor thiolutin blocks mRNA degradation. Yeast, 25(2), pp. 85 - 92 . ISSN: 1097-0061
García Martínez, José; González Candelas, Fernando; Pérez Ortín, José Enrique (2007) Common gene expression strategies revealed by genome-wide analysis in yeast. Genome biology, 8, p. R222 . ISSN: 1474-7596
Pérez Ortín, José Enrique (2007) Genomics of mRNA turnover. Briefings in Functional Genomics & Proteomics, 6(4), pp. 282 - 291 . ISSN: 1473-9550
Fernando Cardona, Purificación Carrasco, José Enrique Pérez-Ortín, Marcel.lí del Olmo*, Agustín Aranda (* corresponding author) (2007) A novel approach for the improvement of stress resistance in wine yeasts. International Journal of Food Microbiology, 114(1), pp. 83 - 91 . ISSN: 0168-1605
Molina-Navarro, M.M.; Castells-Roca, L.; Bellí, G.; García-Martínez, J.; Marín-Navarro, J.; Moreno, J. Pérez-Ortín, J.E. y Herrero, E. (2008) Comprehensive transcriptional analysis of the oxidative response in yeast. Journal of Biological Chemistry, 283, pp. 17908 - 17918 . ISSN: 0021-9258
Solieri, L.; Antúnez, O.; Pérez-Ortín, J.E.; Barrio, E. y Giudici, P (2008) Mitochondria inheritance and fermentative/oxidative balance in hybrids between Saccharomyces cerevisiae and Saccharomyces uvarum. Yeast, 25(7), pp. 485 - 500 . ISSN: 1097-0061
Grund, S.E.; Fischer, T.; Cabal, G.G.; Antúnez, O.; Pérez Ortín, José Enrique; Hurt, E. (2008) The inner nuclear membrane protein Src1 associates with subtelomeric genes and alters their regulated gene expression. Journal of Cell Biology, 182(5), pp. 897 - 910 . ISSN: 0021-9525
Belloch, Carmela; Pérez Torrado, Roberto; González, Sara S.; Pérez Ortín, José Enrique; García Martínez, José; Querol Simón, Amparo; Barrio Esparducer, Eladio (2009) Chimeric Genomes of Natural Hybrids of Saccharomyces cerevisiae and Saccharomyces kudriavzevii. Applied and Environmental Microbiology, 75(8), pp. 2534 - 2544 . ISSN: 0099-2240
Pelechano García, Vicente José; Jimeno-González, Silvia; Rodríguez-Gil, Alfonso; García Martínez, José; Pérez Ortín, José Enrique; Chávez, Sebastián (2009) Regulon-specific control of transcription elongation across the yeast genome. PLOS genetics, 5(8), p. e1000614 . ISSN: 1553-7390
Romero Santacreu, Lorena; Moreno Mariño, Joaquín; Pérez Ortín, José Enrique; Alepuz Martínez, Paula (2009) Specific and global regulation of mRNA stability during osmotic stress in Saccharomyces cerevisiae. RNA-A Publication of the Rna Society, 15(6), pp. 1110 - 1120 . ISSN: 1355-8382
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Rodríguez-Gil, Alfonso; García Martínez, José; Pelechano García, Vicente José; Muñoz-Centeno, María de la Cruz; Geli, Vincent; Pérez Ortín, José Enrique; Chávez, Sebastián (2010) The distribution of active RNA polymerase II along the transcribed region is gene-specific and controlled by elongation factors. Nucleic Acids Research, 38(14), pp. 4651 - 4664 . ISSN: 0305-1048
Bermúdez, Ignacio; García Martínez, José; Pérez Ortín, José Enrique; Roca, Joaquim (2010) A method for genome-wide analysis of DNA helical tension by means of psoralen-DNA photobinding. Nucleic Acids Research, 38(19), p. e182 . ISSN: 0305-1048
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Altres Publicacions

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Desarrollo de una base de datos de Genómica Funcional para levadura. 2007 - 2008. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . IP: Jose Enrique Perez Ortin.
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Estudio de las rutas de comunicación cruzada (cross-talk) entre las etapas del flujo de información genética en células eucariotas. 2019 - 2020. Conselleria d'Educació i Ciència.. . IP: José E. Pérez Ortín.
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Mecanismos de control global de la expresión del genoma: impronta del mRNA y regulación de la transcripción de la RNA pol III. 2024 - 2027. MINISTERIO DE CIENCIA, INNOVACIÓN Y UNIVERSIDADES. . IP: Francisco Navarro Gómez.
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Mecanismos moleculares y rutas participantes en la interconexión entre transcripción y degradación de mRNAs durante las respuestas al estrés en levaduras. 2015 - 2018. Conselleria d'Educació i Ciència.. . IP: José E. Pérez Ortín.
Regulación cruzada entre la transcripción y la estabilidad de los mRNAs. Aproximaciones genómicas y mecanismos implicados en la respuesta al estrés. 2014 - 2017. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . IP: Jose Enrique Perez Ortin.
Homeostasis molecular en el Dogma Central. Recambio de mRNAs y proteínas y los mecanismos de comunicación cruzada entre ellos. 2017 - 2020. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . IP: Jose Enrique Perez Ortin.
Red Temática: La vida del RNA desde la transcripción a la degradación (RNAlife-II). 2020 - 2021. MINISTERIO DE CIENCIA, INNOVACIÓN Y UNIVERSIDADES. . IP: José E. Pérez Ortín (coordinador con 13 grupos más).
Homeostasis del RNA en células eucariotas: control de la transcripción global por el volumen celular y el envejecimiento. 2021 - 2024. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . IP: Jose Enrique Perez Ortin.
Estudio de las rutas de comunicación cruzada (cross-talk) entre las etapas del flujo de información genética en células eucariotas. 2019 - 2020. Conselleria d'Educació i Ciència.. . IP: José E. Pérez Ortín.
Ribostasis celular y proteostasis mitocondrial mediada por eIF5A durante el envejecimiento. 2023 - 2025. Generalitat Valenciana. . IP: Paula Alepuz Martínez (IP) y José Erique Pérez Ortín (co-IP).
Mecanismos de control global de la expresión del genoma: represión en la proliferación celular y activación por prefoldina. 2024 - 2027. MINISTERIO DE CIENCIA, INNOVACIÓN Y UNIVERSIDADES. . IP: Sebastián Chávez de Diego.

Tesis, tesines i treballs

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Purificación Carrasco Valero, (2001). Estudio de la respuesta al estrés en levaduras vínicas. (Tesi Doctoral). .
Agustín Aranda Fernández, (1993). Estudio preliminar de las secuencias impicladas en la poliadenilación/terminación de la transcripción del gen FBP1 de Saccharomyces cerevisiae. (Tesina de Llicenciatura). .
Carmen Ivorra Ivorra, (1998). Estudi de la resposta a estrés en llevats vínics en relació amb el seu comportament en processos de fermentació. (Tesina de Llicenciatura). .
Oreto Antúnez Temporal, (2004). Estudi transcripcional dels mutants del complex HAT B en Saccharomyces cerevisiae. (Treball d'Investigació 12 crèdits). .
Vicent Pelechano García, (2005). Estudi genómico de la separación de las ORFs entre sí en Saccharomyces cerevisiae. (Treball d'Investigació 12 crèdits). .
Lorena Romero Santacreu, (2006). Control de la expresión génica por la MAP quinasa Hog1p en la respuesta al estrés osmótico en Saccharomyces cerevisiae. (Treball d'Investigació 12 crèdits). .
Helena Orozco Valverde, (2007). Función de las proteínas Pub1p y Ngr1p en el control de la expresión génica en la respuesta a señales ambientales. (Treball d'Investigació 12 crèdits). .
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KEVIN TROULÉ LOZANO, (2015). Study of the dependence of the transcription rate during stress responses in Saccharomyces cerevisiae. (Treball de Màster o de Tercer Cicle de 12 o mes crèdits). .
Jordi Planells Rodrigo, (2017). Study of the RNA steady-state condition along the Saccharomyces cerevisiae growth in batch culture. (Treball de Màster o de Tercer Cicle de 12 o mes crèdits). .
Ana Miguel Blanco, (2017). Functional genomic study of the response to hypoxic and oxidative stress in Candida albicans. (Tesi Doctoral). .
Gaurav Singh, (2020). Homeostatic balance study for rRNA concentration as a function of cell volume in yeast. (Treball de Màster o de Tercer Cicle de 12 o mes crèdits). .
Marina Barba Aliaga, (2023). Functions of the translation factor eIF5A in cellular metabolism and transcriptional control. (Tesi Doctoral). .
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