El departamento está organizado en dos áreas, ambas localizadas en el campus de Burjassot-Paterna:
- El área de Parasitología se localiza en el edificio de la Facultad de Farmacia - 2ª planta.
- El área de Biología Celular se localiza en el edificio B de la Facultad de Ciencias Biológicas - 4ª planta.