El departament està organizat en dos àrees, ambdues localitzades al campus de Burjassot-Paterna:

• L'àrea de Parasitologia es localitza a l'edifici de la Facultat de Farmàcia - 2na planta.
• L'àrea de Biologia Cel·lular es localitza a l'edifici B de la Facultat de Ciències Biològiques - 4a planta.