Técnicas informáticas para estudiantes de 4º de Biología

A quién va dirigido

Este curso está pensado para estudiantes de 4º de Biología (orientaciones molecular-biosanitaria y naturalista-de campo) sin experiencia previa en Linux ni en programación.

Enfoque

Cada lección incluye objetivos de aprendizaje, comandos y fragmentos de código listos para copiar/pegar, ejercicios prácticos paso a paso y soluciones. El material no se ejecuta automáticamente: los alumnos escriben o pegan el código en gedit (u otro editor) y lo ejecutan localmente en su propia terminal.

Varios ejercicios usan datos “sucios” — con inconsistencias de mayúsculas/minúsculas, erratas o espacios extra — porque ese es el estado real en el que suelen llegar los datos de campo o de laboratorio, y aprender a detectarlos y corregirlos es parte del objetivo del curso.

Requisitos mínimos

• Un equipo con Linux (o WSL/macOS con bash) y Python 3 instalado.
• Un editor de texto: gedit u otro similar.
• Para el módulo 11, conexión a internet.

Módulos

1. Introducción a la computación en biología — 1 h
2. Navegación y manejo de directorios en la terminal — 2 h
3. Manejo de archivos de texto mediante línea de comandos — 4 h
4. Expresiones regulares — 2 h
5. Pipelines y programación en shell — 2 h
6. Introducción a la programación y Python — 2 h
7. Tipos y operadores — 2 h
8. Bucles y condicionales — 4 h
9. Lectura, modificación y escritura de archivos — 4 h
10. Acceso a datos en línea vía APIs — 2 h

Los módulos están pensados para hacerse en orden: cada uno reutiliza herramientas y, a menudo, los mismos archivos de datos de los módulos anteriores (p. ej. registro_campo_bruto.csv aparece en los módulos 3, 4 y 5; sequences.fasta en los módulos 4, 7 y 9).