Módulo 7 — Introducción a la programación y Python

Duración estimada: 2 h

Objetivos

Al finalizar este módulo serás capaz de:

Explicar qué es una variable y crear variables en Python.
Escribir un script .py con gedit y ejecutarlo desde la terminal con python3.
Leer un archivo y contar sus líneas con un script sencillo.

De la terminal a Python

Hasta ahora le has dado órdenes a la terminal una a una (o encadenadas en pipelines). Python es distinto: en vez de comandos sueltos, escribes un programa — una secuencia de instrucciones guardada en un archivo — y se la entregas entera al intérprete de Python para que la ejecute de arriba a abajo.

Tu primer script

Abre gedit, escribe esto, y guárdalo como hola.py:

print("Hola, bióloga/o")

Ejecútalo desde la terminal, en el mismo directorio donde lo guardaste:

~$ python3 hola.py
Hola, bióloga/o

print(...) muestra un texto por pantalla. python3 hola.py le dice a la terminal: “ejecuta el intérprete de Python 3 sobre este archivo” — el mismo patrón que ./script.sh del módulo anterior, pero para Python en vez de para bash.

Variables

Una variable es un nombre que apunta a un valor. En Python no hace falta declarar de antemano qué tipo de dato guardará — se lo asignas directamente con =:

nombre = "Alicia"
especie_favorita = "Quercus robur"
altura_m = 1.68

print(nombre)
print(f"A {nombre} le gusta {especie_favorita}")

~$ python3 saludo.py
Alicia
A Alicia le gusta Quercus robur

f"..." es una f-string: una cadena de texto donde {variable} se sustituye por el valor de esa variable. Es la forma más cómoda de construir un mensaje combinando texto fijo con datos.

Comentarios

Cualquier línea que empiece por # es un comentario: Python la ignora por completo. Se usa para explicar el porqué de una decisión, no el qué (el código ya dice el qué):

# la altura se guarda en metros, no en centímetros
altura_m = 1.68

Un script real: contar líneas de un archivo

Vas a escribir un script que abra species_observations.csv y cuente cuántas líneas tiene — el equivalente en Python de wc -l del módulo 3:

with open("species_observations.csv") as f:
    lineas = f.readlines()

print(f"El archivo tiene {len(lineas)} lineas.")

~$ python3 contar_lineas.py
El archivo tiene 6 lineas.

open("...") abre el archivo; with ... as f: es una construcción que además se encarga de cerrarlo automáticamente al salir del bloque indentado, aunque ocurra un error a mitad de la lectura (volverás sobre open con más detalle en el módulo 10). f.readlines() devuelve una lista con una línea de texto por elemento, y len(...) cuenta cuántos elementos tiene esa lista.

Nota

Fíjate en la indentación: la línea lineas = f.readlines() empieza con espacios porque está dentro del bloque with. En Python la indentación no es un detalle de estilo — es la sintaxis que marca qué instrucciones pertenecen a cada bloque. Usa siempre 4 espacios (no tabulaciones) y sé consistente.

Ejercicios

Escribe y ejecuta un script hola.py que muestre “Hola, bióloga/o” (o un saludo con tu propio nombre).
Crea dos variables, nombre y especie_favorita, e imprime un mensaje que las combine usando una f-string.
Escribe un script contar_lineas.py que abra species_observations.csv y muestre cuántas líneas tiene.
Escribe un script que cuente cuántas secuencias hay en sequences.fasta, recorriendo el archivo línea a línea con un bucle for linea in f: y comprobando si cada línea empieza por > con linea.startswith(">"). Compara el resultado con el que obtuviste en el módulo 5 usando grep -c "^>".

Soluciones

```
print("Hola, bióloga/o")
```

nombre = "Alicia"
especie_favorita = "Quercus robur"
print(f"A {nombre} le gusta {especie_favorita}")

with open("species_observations.csv") as f:
    lineas = f.readlines()
print(f"El archivo tiene {len(lineas)} lineas.")

contador = 0
with open("sequences.fasta") as f:
    for linea in f:
        if linea.startswith(">"):
            contador = contador + 1
print(f"Numero de secuencias: {contador}")

Debe coincidir con el 4 que obtuviste antes con grep -c "^>" sequences.fasta.