Fitxa persona

JOSE ENRIQUE PEREZ ORTIN
PDI-Catedratic/a d'Universitat
Coordinador/a de Programa de Doctorat
Secretari/a d' Institut Universitari

jose.e.perez@uv.es
http://www.uv.es/perezje

Knowledge area: BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
Department: Biochemistry and Molecular Biology

E.R.I. Biotecmed Dr. Moliner 50 E46100 Burjassot Spain
(9635) 43467

Subjects taught and teaching methods

33135 - Macromolecular biosynthesis and its regulation - Degree in Biochemistry and Biomedical Sciences	Practices, Theory
33159 - Degree final project in biochemistry and biomedical sciences - Degree in Biochemistry and Biomedical Sciences	Work end of studies
44695 - Omics technologies - Master's Degree in Research and Development in Biotechnology and Biomedicine	Theory
44703 - Master's final project - Master's Degree in Research and Development in Biotechnology and Biomedicine	Work end of studies

Tutorials

Anual

Monday de 14:00 a 17:00. 2.11.P1.023

Anual

Friday de 11:00 a 13:00. 2.11.P1.023

Observations

You don't participate in the electronic tutoring program of the Universitat de València

Academic training

Journal Publications

Martínez-García, J., Estruch, F. y Pérez-Ortín, J.E. (1989) Chromatin structure of of the 5' flank of the yeast LEU2 gene. Molecular and General Genetics, 217, pp. 464 - 470 . ISSN: 0026-8925
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Estruch, F., Pérez-Ortín, J.E., Matallana, E. y Franco, L. (1989) Chromatin structure of transposon Tn903 cloned into a yeast plasmid. Plasmid, 22, pp. 143 - 150 . ISSN: 0147-619X
Igual, J.C.; Matallana, E.; González-Bosch, C.; Franco, L.; Pérez-Ortín, J.E. (1991) A new glucose-repressible gene identified from the analysis of chromatin structure of deletion mutants of the yeast SUC2 locus. Yeast, 7, pp. 379 - 389 . ISSN: 1097-0061
Matallana, E.; Franco, L. y Pérez-Ortín, J.E. (1992) Chromatin structure of the yeast SUC2 promoter in regulatory mutants. Molecular and General Genetics, 231, pp. 395 - 400 . ISSN: 0026-8925
Igual, J.C.; González-Bosch, C; Dopazo, J.; Pérez-Ortín, J.E. (1992) Phylogenetic analysis of the thiolase family. Implications on the evolutionary origin of peroxisomes. Journal of Molecular Evolution, 35, pp. 147 - 155 . ISSN: 0022-2844
Igual, J.C.; González-Bosch, C.; Franco, L.; Pérez-Ortín, J.E. (1992) The POT1 gene for the yeast peroxisomal thiolase is subjected to three different mechanisms of regulation. Molecular Microbiology, 6, pp. 1867 - 1875 . ISSN: 0950-382X
Del Olmo M. y Pérez-Ortín, J.E. (1993) A natural A/T-rich sequence from the 3' end of yeast FBP1 gene exists as a cruciform in E. coli cells. Plasmid, 29, pp. 222 - 232 . ISSN: 0147-619X
Tordera, V., Sendra, R. y Pérez-Ortín, J.E. (1993) The role of histones and their modifications in informative content of chromatin. Experientia, 49, pp. 780 - 788 . ISSN: 0014-4754
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Bargues, M.; Salom, D.; Gómez, A.; Paricio, N.; Pérez-Alonso, M. y Pérez-Ortín, J.E. (1996) Sequencing analysis of a 4.1 kb subtelomeric region from yeast chromosome IV identifies HXT15, a new member of the hexose transporter family. Yeast, 12, pp. 1005 - 1011 . ISSN: 1097-0061
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Ruiz-García, A.B.; Sendra, R.; Galiana, M.; Pamblanco, M.; Pérez-Ortín, J.E. y Tordera., V. (1998) HAT1 and HAT2 proteins are componets of a yeast nuclear histone acetyltransferase enzyme specific for free histone H4. Journal of Biological Chemistry, 273, pp. 12599 - 12605 . ISSN: 0021-9258
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Rodríguez-Navarro, Susana; Llorente, B.; Rodríguez-Manzaneque, M.T.; Ramne, A.; Uber Garcia, Genoveva; Marchesan, D.; Dujon, B.; Herrero,E.; Sunnerhagen, P.; Pérez-Ortín, José Enrique (2002) Functional analysis of yeast gene families involved in metabolism of vitamins B1 and B6. Yeast, 19, pp. 1261 - 1276 . ISSN: 1097-0061
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Stays abroad in Research Centers

Projects

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Estructura de la cromatina y actividad génica. 1989 - 1992. Comisión Asesora de Investigación Científica y Técnica (CAICYT). . PI: Luis Franco Vera.
Mecanismos moleculares de la regulación por glucosa en levadura. 1994 - 1995. Dirección General de Investigación Científica y Técnica. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Yeast Genome Sequencing Network. 1994 - 1995. Dirección General de Ciencia, Investigación y Desarrollo (DGXII). Comunidades Europeas. . PI: José E. Pérez Ortín.
Secuenciación de un fragmento del cromosoma IV de levadura. 1994 - 1995. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: José E. Pérez Ortín.
Desarrollo de una metodología para la obtención, por modificación genética, de levaduras recombinantes comercialmente aceptables. 1995 - 1998. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: José E. Pérez Ortín.
Yeast Genome Functional Analysis Network (EUROFAN). 1996 - 1998. Dirección General de Ciencia, Investigación y Desarrollo (DGXII). Comunidades Europeas. . PI: José E. Pérez Ortín.
Identificación de promotores de genes de levaduras industriales con expresión diferencial a lo largo de la fermentación vínica. 1996 - 1998. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Análisis funcional del genoma de levadura. Proyecto europeo EUROFAN. 1996 - 1997. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: José E. Pérez Ortín.
Yeast Genome Functional Analysis Network (EUROFAN II). 1997 - 2000. Dirección General de Ciencia, Investigación y Desarrollo (DGXII). Comunidades Europeas. . PI: José E. Pérez Ortín.
Análisis funcional del genoma de levadura. Proyecto europeo EUROFAN II. 1998 - 1999. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: José E. Pérez Ortín.
Mejora genética de las respuestas fisiológicas de las levaduras vínicas a los estreses debidos al proceso de fermentación. 1998 - 1999. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: José E. Pérez Ortín.
Funciones biológicas de las histona acetiltransferasas en Saccharomyces cerevisiae. 1999 - 2002. Dirección General de Enseñanza Superior e Investigación Científica. . PI: Vicente Tordera Donderis.
Comprehensive Yeast Genome Database (CYGD). 2000 - 2004. Dirección General de Ciencia, Investigación y Desarrollo (DGXII). Comunidades Europeas. . PI: José E. Pérez Ortín.
Proyecto piloto para la fabricación de chips de DNA para el análisis genómico en levaduras. 2000 - 2001. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: José E. Pérez Ortín.
Estudio de las funciones in vivo de las Histonas Acetiltransferasas Taf145p y Esa1p mediante el uso inmunoprecipitación de cromatina. 2000 - 2001. Ministerio de Ciencia y Tecnología.. . PI: Vicente Tordera Donderis.
Desarrollo de DNA-chips para la detección específica y simultánea de agentes fitopatógenos y genes de respuesta a la infección en patata (Solanum tuberosum). (PapaChip). 2001 - 2004. Dirección General de Enseñanza Superior e Investigación Científica. . PI: José E. Pérez Ortín.
Localización e identificación de un nuevo gen supresor de tumores en 8p21-p23 en Linfomas B mediante Chips de ADN. 2001 - 2003. Fondo de Investigaciones Sanitarias. . PI: José E. Pérez Ortín.
Clonaje posicional de un nuevo gen supresor de tumores en la región cromosómica 8p en linfomas B mediante microchips de ADN. 2002 - 2003. Conselleria de Cultura, Educació i Esports. Generalitat Valenciana. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Análisis genómico del estrés por etanol en Saccharomyces cerevisiae. 2002 - 2005. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: José E. Pérez Ortín.
Medida de las tasas de transcripción y de las vidas medias de todos los mRNAs de levadura. 2003 - 2006. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: José E. Pérez Ortín.
Complementos para la instalación de nuevos laboratorios en el IATA. 1996 - 1996. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Lector (scanner) de radiactividad y fluorescencia. 1999 - 1999. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Equipo para Microchips de DNA. 2000 - 2000. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Complemento para la fabricación de Chips de DNA de levadura. 2001 - 2001. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Creación y distribución de microchips de DNA de la levadura S. cerevisiae. 2002 - 2002. Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT). . PI: Joaquín Ariño Carmona.
Red Valenciana de Genómica y Proteómica. 2002 - 2002. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Red Valenciana de Genómica y Proteómica. 2003 - 2003. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: José E. Pérez Ortín.
Contrato para la ejecución del proyecto: Desarrollo de DNA-chips para la detección específica y simultánea de agentes fitopatógenos y genes de respuesta a la infección en patata (Solanum tuberosum). (PapaChip). Empresas: Sistemas Genómicos S.L., MedPlant Genetics, Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias. 2000 - 2004. Ministerio de Ciencia y Tecnología.. . PI: José E. Pérez Ortín/ Mariano Cambra.
Contrato para la ejecución del proyecto: Proyecto piloto para la fabricación de chips de DNA para el análisis genómico en levaduras. Empresas: Sistemas Genómicos S.L., Biotools Biotechnological & Medical laboratories S.A. 2000 - 2002. Ministerio de Ciencia y Tecnología.. . PI: José E. Pérez Ortín.
Contrato de Comercialización del Servicio de Chips de ADN de la Universitat de València Empresa: DURVIZ S.L. 2001 - 2002. Universitat de València. . PI: José E. Pérez Ortín.
Contrato de Formación de Personal Empresa: DURVIZ S.L. 2002 - 2003. Universitat de València. . PI: José E. Pérez Ortín.
Agilent 2100 Bioanalyzer. 2006 - 2006. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Ayuda complementaria al proyecto BMC2003-07072-C03-02. 2006 - 2006. Conselleria de Cultura, Educació i Ciència. Generalitat Valenciana. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Aproximaciones Genómicas al estudio de la transcripción en levadura. 2006 - 2007. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Análisis genómico de la transcripción en levadura. 2007 - 2010. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Desarrollo de una base de datos de Genómica Funcional para levadura. 2007 - 2008. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Mecanismos de coordinación entre la transcripción y la estabilidad de mRNAs en levadura. 2011 - 2013. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Patógenos fúngicos humanos bajo estrés oxidativo: mecanismos adaptativos frente a hipoxia y ROS. 2011 - 2013. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Enrique Herrero Perpiñán.
Estudio global de las estrategias transcripcionales y post-transcripcionales de regulación de la expresión génica en respuesta al estrés osmótico en Saccharomyces cerevisiae: un modelo de sistema eucariótico. 2011 - 2014. Conselleria d'Educació i Ciència.. . PI: José E. Pérez Ortín.
Identification and validation of a gene expression signature for problematic fermentations diagnosis. 2011 - 2013. Fundacâo para a Ciencia e a Tecnología de Portugal. . PI: Alexandra Mendes Ferreira.
Instituto Superior de Investigación Cooperativa de Biotecnología y Biomedicina (ISIC BIOTECMED). 2013 - 2016. Generalitat Valenciana. . PI: Juan Ferré Manzanero.
Red Temática: La vida del mRNA desde la transcripción a la degradación. 2015 - 2017. Ministerio de Economía y Competitividad. . PI: Susana Rodriguez Navarro.
Mecanismos moleculares y rutas participantes en la interconexión entre transcripción y degradación de mRNAs durante las respuestas al estrés en levaduras. 2015 - 2018. Conselleria d'Educació i Ciència.. . PI: José E. Pérez Ortín.
Regulación cruzada entre la transcripción y la estabilidad de los mRNAs. Aproximaciones genómicas y mecanismos implicados en la respuesta al estrés. 2014 - 2017. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Homeostasis molecular en el Dogma Central. Recambio de mRNAs y proteínas y los mecanismos de comunicación cruzada entre ellos. 2017 - 2020. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Red Temática: La vida del RNA desde la transcripción a la degradación (RNAlife-II). 2020 - 2021. MINISTERIO DE CIENCIA, INNOVACIÓN Y UNIVERSIDADES. . PI: José E. Pérez Ortín (coordinador con 13 grupos más).
Homeostasis del RNA en células eucariotas: control de la transcripción global por el volumen celular y el envejecimiento. 2021 - 2024. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Estudio de las rutas de comunicación cruzada (cross-talk) entre las etapas del flujo de información genética en células eucariotas. 2019 - 2020. Conselleria d'Educació i Ciència.. . PI: José E. Pérez Ortín.
Ribostasis celular y proteostasis mitocondrial mediada por eIF5A durante el envejecimiento. 2023 - 2025. Generalitat Valenciana. . PI: Paula Alepuz Martínez (IP) y José Erique Pérez Ortín (co-IP).
Estudio global de las estrategias transcripcionales y post-transcripcionales de regulación de la expresión génica en respuesta al estrés osmótico en Saccharomyces cerevisiae: un modelo de sistema eucariótico. 2011 - 2014. Conselleria d'Educació i Ciència.. . PI: José E. Pérez Ortín.
Instituto Superior de Investigación Cooperativa de Biotecnología y Biomedicina (ISIC BIOTECMED). 2013 - 2016. Generalitat Valenciana. . PI: Juan Ferré Manzanero.
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Homeostasis molecular en el Dogma Central. Recambio de mRNAs y proteínas y los mecanismos de comunicación cruzada entre ellos. 2017 - 2020. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Red Temática: La vida del RNA desde la transcripción a la degradación (RNAlife-II). 2020 - 2021. MINISTERIO DE CIENCIA, INNOVACIÓN Y UNIVERSIDADES. . PI: José E. Pérez Ortín (coordinador con 13 grupos más).
Homeostasis del RNA en células eucariotas: control de la transcripción global por el volumen celular y el envejecimiento. 2021 - 2024. Ministerio de Ciencia y Tecnología, Dirección General de Investigación. . PI: Jose Enrique Perez Ortin.
Estudio de las rutas de comunicación cruzada (cross-talk) entre las etapas del flujo de información genética en células eucariotas. 2019 - 2020. Conselleria d'Educació i Ciència.. . PI: José E. Pérez Ortín.
Ribostasis celular y proteostasis mitocondrial mediada por eIF5A durante el envejecimiento. 2023 - 2025. Generalitat Valenciana. . PI: Paula Alepuz Martínez (IP) y José Erique Pérez Ortín (co-IP).

Thesis, minor thesis and research reports

Emilia Matallana Redondo, (1989). Estructura de la cromatina de las regiones reguladoras del gen SUC2 de Saccharomyces cerevisiae. (Doctoral Thesis). .
Juan Carlos Igual García, (1991). Identificación del gen de la 3-oxoacil-CoA tiolasa peroxisomal de Saccharomyces cerevisiae. Estudio de su regulación. (Doctoral Thesis). .
Marcel.lí del Olmo Muñoz, (1991). Estructura de la cromatina del gen FBP1 de Saccharomyces cerevisiae. (Doctoral Thesis). .
Agustín Aranda Fernández, (1996). Estudio estructural y funcional de la región 3' del gen FBP1 de Saccharomyces cerevisiae. (Doctoral Thesis). .
Sergi Puig Todolí, (1999). Estudios sobre la manipulación genética de las levaduras vínicas. (Doctoral Thesis). .
Susana Rodríguez Navarro, (2000). Análisis funcional del genoma de levadura: caracterización del gen SRC1. (Doctoral Thesis). .
Purificación Carrasco Valero, (2001). Estudio de la respuesta al estrés en levaduras vínicas. (Doctoral Thesis). .
Carlos García Ferris, (1989). Un método rápido para la detección de plásmidos en microorganismos. (Bachelor thesis). .
Marcel.lí del Olmo Muñoz, (1989). Aillament de plasmids de rent en forma de cromatina. Caracterització mitjançant tècniques electroforetiques. (Bachelor thesis). .
Agustín Aranda Fernández, (1993). Estudio preliminar de las secuencias impicladas en la poliadenilación/terminación de la transcripción del gen FBP1 de Saccharomyces cerevisiae. (Bachelor thesis). .
Carmen Ivorra Ivorra, (1998). Estudi de la resposta a estrés en llevats vínics en relació amb el seu comportament en processos de fermentació. (Bachelor thesis). .
Oreto Antúnez Temporal, (2004). Estudi transcripcional dels mutants del complex HAT B en Saccharomyces cerevisiae. (Research work of 12 credits). .
Vicent Pelechano García, (2005). Estudi genómico de la separación de las ORFs entre sí en Saccharomyces cerevisiae. (Research work of 12 credits). .
Lorena Romero Santacreu, (2006). Control de la expresión génica por la MAP quinasa Hog1p en la respuesta al estrés osmótico en Saccharomyces cerevisiae. (Research work of 12 credits). .
Helena Orozco Valverde, (2007). Función de las proteínas Pub1p y Ngr1p en el control de la expresión génica en la respuesta a señales ambientales. (Research work of 12 credits). .
Vicent Pelechano García, (2009). Estudio genómico de la transcripción y de la degradación de mRNAs en Saccharomyces cerevisiae. (Doctoral Thesis). .
Lorena Romero Santacreu, (2009). Respuestas transcripcionales y postranscripcionales al estrés osmótico en Saccharomyces cerevisiae. Función de la MAPK Hog1p. (Doctoral Thesis). .
Antonio Jordan Pla, (2013). BioGRO: un nuevo método de alta resolución para el estudio de la transcripción en levadura. (Doctoral Thesis). .
Catarina de Costa Rodrigues Barbosa, (2014). Towards the understanding of the impact of nitrogen on wine fermentation: from classical to Genomic approaches. (Doctoral Thesis). .
Jaume Forés Martos, (2014). Comparación entre variables de expresión génica a escala ómica en Saccharomyces cerevisiae y Schizosaccharomyces pombe. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Ana Miguel Blanco, (2012). Genomic run-on experimental set up for Candida albicans. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Fernando Montón Barranco, (2012). Estudio de los cambios de velocidad de la RNA polimerasa II de Saccharomyces cerevisiae en función de la temperatura. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Daniel A Medina Salas, (2015). Análisis genómico de la interacción entre la transcripción y la degradación durante el recambio del mRNA en S. cerevisiae. (Doctoral Thesis). .
Julen Mendieta Esteban, (2016). Estrategias de expresión génica: una comparación entre levadura y humanos. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Jose Miguel Juanes Tebar, (2015). TilingScan, aplicaciones web para la detección de regiones significativamente expresadas en datos de tiling arrays. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
KEVIN TROULÉ LOZANO, (2015). Study of the dependence of the transcription rate during stress responses in Saccharomyces cerevisiae. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Jordi Planells Rodrigo, (2017). Study of the RNA steady-state condition along the Saccharomyces cerevisiae growth in batch culture. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Ana Miguel Blanco, (2017). Functional genomic study of the response to hypoxic and oxidative stress in Candida albicans. (Doctoral Thesis). .
Gaurav Singh, (2020). Homeostatic balance study for rRNA concentration as a function of cell volume in yeast. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Marina Barba Aliaga, (2023). Functions of the translation factor eIF5A in cellular metabolism and transcriptional control. (Doctoral Thesis). .
Catarina de Costa Rodrigues Barbosa, (2014). Towards the understanding of the impact of nitrogen on wine fermentation: from classical to Genomic approaches. (Doctoral Thesis). .
Jaume Forés Martos, (2014). Comparación entre variables de expresión génica a escala ómica en Saccharomyces cerevisiae y Schizosaccharomyces pombe. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Daniel A Medina Salas, (2015). Análisis genómico de la interacción entre la transcripción y la degradación durante el recambio del mRNA en S. cerevisiae. (Doctoral Thesis). .
Julen Mendieta Esteban, (2016). Estrategias de expresión génica: una comparación entre levadura y humanos. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Jose Miguel Juanes Tebar, (2015). TilingScan, aplicaciones web para la detección de regiones significativamente expresadas en datos de tiling arrays. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
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Jordi Planells Rodrigo, (2017). Study of the RNA steady-state condition along the Saccharomyces cerevisiae growth in batch culture. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Ana Miguel Blanco, (2017). Functional genomic study of the response to hypoxic and oxidative stress in Candida albicans. (Doctoral Thesis). .
Gaurav Singh, (2020). Homeostatic balance study for rRNA concentration as a function of cell volume in yeast. (Working Master or third cycle over 12 credits). .
Marina Barba Aliaga, (2023). Functions of the translation factor eIF5A in cellular metabolism and transcriptional control. (Doctoral Thesis). .