Análisis genómico de las respondida a estrés abiótico dependiente de poliaminas.
Se analizará la respuesta a diferentes situaciones de estrés abiótico (salino, hídrico, osmótico u ozono) de plantas de Arabidopsis con modificaciones en el metabolismo de poliaminas. El análisis se llevará a cabo con plantas transgénicas, sobreexpressores de algunos de los genes de la ruta biosintètica, o con mutantes deficientes en estos genes. Los cambios globales en el transcriptoma se determinarán mediante hibridación con microchips de DNA. Se construirá una base de datos que correlaciono tolerancia con estrés, niveles de poliaminas, relación entre las diferentes poliaminas y transcritos la expresión de los cuales varío significativamente respecto a plantas “wild type” sometidas a las mismas condiciones.

Análisis de la variabilidad genética de las respondida a estrés abiótico y del metabolismo de poliaminas en diferentes ecotipos de Arabidopsis.
Se analizará la tolerancia a los mismos tipos de estrés abiótico de un conjunto de la orden de 100 diferentes variedades y ecotipos de Arabidopsis, y se compararán la respondidas fisiológicas y moleculares de las diferentes variedades. Para hacerlo, se determinará el LT50 (parámetro de tolerancia a estrés) y los niveles de poliaminas de todas ellas, bajo condiciones normales y bajo condiciones de estrés.

Análisis genómico de las respondida a estrés abiótico en ecotipos de Arabidopsis seleccionados por sus características diferenciales respecto al estrés.
Los cambios globales en el transcriptoma se determinarán mediante hibridación con microchips de DNA. Se construirá una base de datos que correlaciono tolerancia a estrés, niveles de poliaminas, relación entre las diferentes poliaminas y transcritos la expresión de los cuales varío significativamente respecto al nivel medio de los ecotipos analizados. La base de datos incluirá los niveles de poliaminas de cada uno de los ecotipos, se seleccionará marcadores de tolerancia a estrés a partir de esta y de la que se haya confeccionado en el apartado a). El nivel de expresión de los genes seleccionados como marcadores se determinará por qRT-PCR para todos los ecotipos.

Desarrollo de marcadores para plantas de interés agronómico.
Los datos originados a partir de Arabidopsis se usarán para el desarrollo de marcadores en cultivos como por ejemplo solanàcies (tomate, patata) o cereales. Se determinarán niveles de poliaminas y transcritos “marcadores” de estrés en diferentes variedades a fin de establecer criterios de selección de cultivos que hay que implantar en condiciones ambientales desfavorables.