La electroforesis bidimensional - proteómica sigue siendo la técnica más resolutiva y empleada en los análisis proteómicos, ya que permite aislar mediante una doble separación en un gel 2D-PAGE en base al punto isoeléctrico (pI) y al peso molecular (PM). Sin embargo, dados los inconvenientes y limitaciones que presenta, existe actualmente una intensa actividad en la búsqueda de sistemas alternativos.

Entre ellos, la Tecnología DIGE (Differential In Gel Electrophoresis) comercializada por GE Healthcare, supone un claro avance en el análisis comparativo de la expresión diferencial de proteínas, ya que minimiza la variabilidad de los geles, disminuye el tiempo de análisis, y permite una cuantificación muy precisa del perfil de expresión.