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Adaptaciones metabólicas asociadas a la adaptación de las microalgas liquénicas a condiciones ambientales extremas

Las microalgas liquénicas desempeñan un papel muy activo en la capacidad de los líquenes para sobrevivir en condiciones ambientales extremas. El objetivo de esta línea de trabajo consiste en la determinación de los metabolitos implicados en la adaptación de las microalgas liquénicas a condiciones extremas como desecación o frío al objeto de desarrollar posibles aplicaciones biotecnológicas de cara a su aplicación en la tolerancia de cultivos.

Angiogénesis e inmunoregulación

Estudio de interrelaciones entre la neovascularización tumoral, la presencia de poblaciones de células inmunoreguladoras y la recidiva o progresión en el microambiente tumoral.

Análisis de bioestimulantes de origen orgánico y su efecto sobre cultivos

Linea de trabajo llevada a cabo en colaboración con la empresa DADELOS SA. Se desarrollan dos aproximaciones: La identificación y análisis semicuantitativo por espectrometría de masas de los componentes químicos de los diferentes productos. El análisis del efecto de los productos sobre cultivos.

Análisis de todo el genoma de las respuestas de la vid a las tensiones ambientales, incluidas las influenciadas por el cambio climático

Estamos interesados en abordar diferentes datos bioinformáticos acoplados a datos experimentales para modelar las respuestas al estrés de las plantas, utilizando la vid como modelo de frutos carnosos no climatéricos.

Análisis genómico de la transcripción en levadura

La complejidad del fenómeno de la expresión génica se comprenderá mejor si se mejoran las técnicas para medir, al nivel genómico, la transcripción in vivo y se usan aproximaciones genéticas y genómicas para clarificar las conexiones funcionales que controlan la transcripción. 

Aplicaciones biotecnológicas de las microalgas liquénicas

Las microalgas liquénicas son capaces de crecer en medio sólido o líquido bajo condiciones en que difícilmente lo hacen otros organismos. Este hecho las convierte en candidatas para su uso en biorreactores o para la producción de biomasa y de compuestos obtenidos por transformación.

Biología Evolutiva de Plantas Mediterráneas

La descripción detallada del contenido de esta línea de investigación se encuentra incluida en la descripción de la actividad investigadora del grupo.

Caracterización a todo el genoma de la familia de factores de transcripción R2R3-MYB en plantas

Intentamos caracterizar a la familia MYB en diferentes especies de plantas combinando estudios de todo el genoma y en caracterizaciones funcionales de planta.

Caracterización de vesículas extracelulares y sus componentes. Aplicaciones en salud

Aislamiento y caracterización de vesículas extracelulares (EVs) en diversos helmintos parásitos. Identificación de las moléculas presentes en las EVs. Análisis de la utilidad de las EVs en el control de helmintiasis y otras enfermedades (diagnóstico, vacunación y tratamiento).

Caracterización del modo de acción de toxinas de Bacillus thurigiensis en insectos plaga

Identificación de receptores de toxinas de B. thuringiensis. Ensayos de unión ligando-receptor. Experiencias de silenciamiento génico. Realización de ensayos de toxicidad. Análisis de la respuesta inmune de los insectos a la intoxicación por B. thuringiensis.

Caracterización del represor de Start Whi7

Nuestro grupo ha caracterizado un nuevo regulador importante en la transición de Start: Whi7. Whi7 actúa como represor transcripcional del programa de Start colaborando con Whi5 en dicha función, de manera que, como ocurre en mamíferos con la familia Rb, el control de la iniciación del ciclo celular depende del juego entre distintos represores. Los trabajos del grupo pretenden avanzar en la caracterización de la regulación y función de Whi7 y su comparación con Whi5 en diferentes condiciones fisiológicas, lo que puede ayudar a entender como se coordina la acción de distintos represores en el control del inicio del ciclo celular. Además, se está investigando la relación existente entre Whi7 y la ruta de la proteinaquinasa C. El hecho de que un miembro de la familia Rb esté mutado en casi todos los tumores refuerza aun más la importancia de estudiar el papel de estos represores de G1.

Caracterización del represor de Start Whi7

Nuestro grupo ha caracterizado un nuevo regulador importante en la transición de Start: Whi7. Whi7 actúa como represor transcripcional del programa de Start colaborando con Whi5 en dicha función, de manera que, como ocurre en mamíferos con la familia Rb, el control de la iniciación del ciclo celular depende del juego entre distintos represores. Los trabajos del grupo pretenden avanzar en la caracterización de la regulación y función de Whi7 y su comparación con Whi5 en diferentes condiciones fisiológicas, lo que puede ayudar a entender como se coordina la acción de distintos represores en el control del inicio del ciclo celular. Además, se está investigando la relación existente entre Whi7 y la ruta de la proteinaquinasa C. El hecho de que un miembro de la familia Rb esté mutado en casi todos los tumores refuerza aun más la importancia de estudiar el papel de estos represores de G1.

Control del checkpoint de integridad del DNA por proteinquinasa C

Pkc1 de levadura y la isoforma PKCd de mamíferos comparten la misma función de control del checkpoint de integridad genómica. Se plantea un estudio en paralelo en ambos organismos para caracterizar las claves moleculares de dicho mecanismo.

Control del checkpoint de integridad del DNA por proteinquinasa C

Pkc1 de levadura y la isoforma PKCd de mamíferos comparten la misma función de control del checkpoint de integridad genómica. Se plantea un estudio en paralelo en ambos organismos para caracterizar las claves moleculares de dicho mecanismo.

Desarrollo de biomarcadores de estrés biótico y abiótico en plantas de interés agronómico

Análisis de expresión de genes implicados en mecanismos de defensa frente a estrés biótico y abióticos. Identificación a nivel genómico por secuenciación masiva de miRNAs relacionados con situaciones de estrés biótico y abiótico de plantas.

Desarrollo de la metodología "Yeast surface display" y de sus aplicaciones en Biotecnología

Se aborda el desarrollo de la metodología Yeast Surface Display, no solamente en Sacchomyces cerevisiae sino también en otras levaduras no Saccharomyces. Además se pretende desarrollar aplicaciones en biocatálisis, bioremediación y salud mediante la exposición de proteínas y péptidos concretos.

Desarrollo de nuevos bioinsecticidas
  • Aislamiento y caracterización de nuevos genes de B. thuringiensis que codifiquen proteínas con alta acción insecticida.
  • Uso de aislados naturales o modificados genéticamente con alta efectividad y/o con un espectro de acción más amplio.
Estudio de los mecanismos naturales de defensa de las plantas frente al ataque por patógenos

Identificación de nuevas proteínas de defensa de las plantas frente a patógenos a través de análisis proteómicos masivos y dirigidos. Análisis del efecto potenciador de inductores naturales de las defensas de las plantas en la acción de las toxinas de B. thuringiensis.

Estudio del control de la traducción por el factor, conservado evolutivamente, eIF5A y su función en patologías

eIF5A es un factor de elongación que se une a los ribosomas cuando éstos se atascan durante la síntesis de algunas proteínas que contienen motivos con prolinas, glicinas y amino ácidos cargados. Nuestro grupo ha determinado que eIF5A es necesario para la síntesis de forminas (de levadura, mosca y ratones), colágeno (de ratón y humanos) y proteínas humanas que tienen tendencia a la agregación en células envejecidas. Nuestro objetivo es determinar mecanísticamente la función de eIF5A, a través de la síntesis de sus proteínas diana, en patologías tales como la fibrosis, el cáncer o durante el envejecimiento. Comprender estos mecanismos ayudará al desarrollo de terapias específicas dirigidas a regular la función de eIF5A.

Estudios de relaciones parásito-hospedador mediante técnicas ómicas

Estudio de las interacciones moleculares entre helmintos parásitos y sus hospedadores. A partir de las moléculas identificadas se generan herramientas (proteínas y péptidos recombinantes junto a anticuerpos policlonales) destinadas al control de dichas parasitosis.

Evaluación de efectos citoprotectores y citotóxicos mediante técnicas in vitro

Evaluación de efectos biológicos de componentes de los alimentos e ingredientes alimentarios: citoprotección y/o citotoxicidad, marcadores de estrés oxidativo, inflamación y apoptosis, utilizando cultivos celulares.

Genética de la esquizofrenia

Estudio de expresión génica, identificación de biomarcadores de respuesta al tratamiento en esquizofrenia, y caracterización de la respuesta celular al fármaco en modelos derivados de células madre pluripotentes inducidas (iPSCs).
 

Homeostasis de metales en levadura

Nuestro principal objetivo de investigación es descifrar cómo las células eucariotas regulan la expresión génica para transportar, distribuir y utilizar correctamente el hierro en respuesta a la frecuentemente baja disponibilidad de este micronutriente esencial. Utilizamos la levadura Saccharomyces.

Interacción insecto-patógeno
  • Profundizar en los mecanismos moleculares que rigen la interacción de los insectos con sus patógenos virales y bacterianos.
  • Desarrollar estrategias que potencien el uso de los bioinsecticidas mediante la modificación de la respuesta inmunológica ante el ataque de patógenos.
Limnologia fundamental y aplicada

Limnología fundamental y aplicada: Dinámica y funcionamiento de los ecosistemas acuáticos epicontinentals. Estructura de las comunidades y diversidad funcional. Evaluación del estado ecológico y de conservación. Ecología microbiana en ecosistemas leníticos: Estudio de la composición y funcionalidad de la comunidad microbiana por técnicas moleculares. Metagenómica. Metabarcoding y e-DNA. Biogeoquímica y balances de carbono en humedales mediterráneos, flujos de gases carbonatos de efecto invernadero. Efectos de las características ecológicas y estado de conservación en la capacidad mitigadora del cambio climático de los ecosistemas leníticos. Ecotoxicología. Sistemas de información geográfica (SIG). Teledetección. Limnología polar.

Líquenes y microalgas: Biodiversidad y Biogeografía. Ecofisiología. Aplicaciones Biotecnológicas

La descripción detallada del contenido de esta línea de investigación se encuentra incluida en la descripción de la actividad investigadora del grupo.

Mecanismos de adaptación de las plantas superiores a las condiciones ambientales adversas

Las plantas han desarrollado mecanismos mediante los cuales se enfrentan a condiciones ambientales adversas, entre ellos la acumulación de poliaminas (PAs). Pretendemos caracterizar el papel de las PAs como moléculas reguladoras de la respuesta al estrés y sus interacciones con otras fitohormonas.

Mecanismos transcripcionales implicados en la adaptación de las microalgas liquénicas a condiciones ambientales extremas

Las microalgas liquénicas desempeñan un papel muy activo en la capacidad de los líquenes para sobrevivir en condiciones ambientales extremas. El objetivo de esta línea de trabajo consiste en el conocimiento de los mecanismos transcripcionales que modulan dicha respuesta.

Modelos experimentales en enfermedades neurodegenerativas mitocondriales

Obtención de modelos experimentales y caracterización de los efectos producidos por:

  • La pérdida/ganancia de función de frataxina y paraplegina en Drosophila de forma sistémica y específica de tejido.
  • Las alteraciones funcionales de ambas proteínas en modelos humanizados de paraplegina y frataxina en Drosophila.
Modificación de histonas durante el envejecimiento cronològico de la levadura

Análisis de las marcas de las histonas durante el envejecimiento de las células de levadura, globalmente y a nivel de genes concretos. Análisis de los complejos enzimáticos responsables de las marcas de histonas en células viejas y en células jóvenes.

Nuevos mecanismos de control de otros reguladores del ciclo celular

Los trabajos del grupo también se centran en el estudio de mecanismos de regulación espacial en el control del ciclo celular, mecanismos que implican el control de la localización subcelular de proteínas clave para la progresión en el ciclo. Se ha estudiado en particular el papel de la carioferina Msn5 en el control de factores de transcripción (Swi6, Swi4, Mbp1, Swi5, Whi5) así como de ciclinas de Start (Cln1, Cln2). Además, se investigan determinantes de la especificidad funcional de ciclinas y la identificación de nuevos mecanismos que controlan la síntesis y degradación de ciclinas (Cln2, Clb2).

Nuevos mecanismos de control de otros reguladores del ciclo celular

Los trabajos del grupo también se centran en el estudio de mecanismos de regulación espacial en el control del ciclo celular, mecanismos que implican el control de la localización sub celular de proteínas clave para la progresión en el ciclo. Se ha estudiado en particular el papel de la carioferina Msn5 en el control de factores de transcripción (Swi6, Swi4, Mbp1, Swi5, Whi5) así como de ciclinas de Start (Cln1, Cln2). Además, se investigan determinantes de la especificidad funcional de ciclinas y la identificación de nuevos mecanismos que controlan la síntesis y degradación de ciclinas (Cln2, Clb2).

Regulación de la defensa antioxidante

Papel de la MAP quinasa p38 alfa en la regulación de la defensa antioxidante en hepatocitos.

Resistencia a plaguicidas de síntesis

Estudio de los mecanismos de resistencia a plaguicidas de síntesis y fomento de su selectividad.

Secuenciación Masiva de Cloroplastos de Plantas Vasculares

La descripción detallada del contenido de esta línea de investigación se encuentra incluida en la descripción de la actividad investigadora del grupo.

Tráfico de proteínas en células vegetales

Tráfico de proteínas en células vegetales, con especial énfasis en estudios funcionales de proteínas de especial relevancia fisiológica.