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Análisis filogenético

Aplicación de métodos de inferencia filogenética molecular a datos de secuencias desde la ultrasecuenciación hasta la determinación de nuevos genomas.

Citómetro de flujo Separador Celular ARIA FUSION

Separador Celular equipado con 6 láseres, cabina de Bioseguridad y extracción de aerosoles. Permite, en primer lugar, la medición rápida de parámetros morfológicos y funcionales de un gran número de células individuales suspendidas en medio líquido. Para ello, las células se marcan inicialmente con anticuerpos conjugados con fluorocromos, o sondas fluorescentes que se unen a proteínas ubicadas en la superficie o dentro de la célula. La luz dispersada y la fluorescencia emitida por los marcadores al pasar las células, una a una por los diferentes láseres, permite medir simultáneamente características estructurales y varios parámetros en cada una de estas células.

Además, tras el análisis, es posible separar y recoger subpoblaciones de interés de la muestra para posteriores estudios.

Citómetro de flujo analizador - BD FACSVERSE

Equipo que determina y cuantifica la fluorescencia de sondas fluorescentes unidas a diferentes partes tanto de células eucariotas como procariotas, orgánulos, proteínas. La fluorescencia emitida es recogida en distintos filtros acotados a una longitud de onda determinada. La cuantificación de la fluorescencia está asociada con el parámetro celular que se está midiendo, generando resultados cuantitativos como la intensidad de fluorescencia, porcentaje de poblaciones celulares, contaje del número de células/ML.

Citómetro de flujo analizador - BD LSR Fortessa X-20

Equipo que determina y cuantifica la fluorescencia de sondas fluorescentes unidas a diferentes partes tanto de células eucariotas como procariotas, orgánulos, proteínas. La fluorescencia emitida es recogida en distintos filtros acotados a una longitud de onda determinada. La cuantificación de la fluorescencia está asociada con el parámetro celular que se está midiendo, generando resultados cuantitativos como la intensidad de fluorescencia, porcentaje de poblaciones celulares, contaje del número de células/ML.

Citómetro de flujo analizador FORTESSA

Citómetro analizador con 5 láseres que permite la medición rápida de parámetros morfológicos y funcionales de un gran número de células individuales suspendidas en medio líquido. Para ello, las células se marcan inicialmente con anticuerpos conjugados con fluorocromos o sondas fluorescentes que se unen a proteínas ubicadas en la superficie o dentro de la célula. La luz dispersada y la fluorescencia emitida por los marcadores al pasar las células, una a una por los diferentes láseres, permite medir simultáneamente características estructurales y varios parámetros en cada una de estas células.

Citómetro de flujo analizador VERSE

Citómetro analizador con 3 láseres que permite la medición rápida de parámetros morfológicos y funcionales de un gran número de células individuales suspendidas en medio líquido. Para ello, las células se marcan inicialmente con anticuerpos conjugados con fluorocromos o sondas fluorescentes que se unen a proteínas ubicadas en la superficie o dentro de la célula. La luz dispersada y la fluorescencia emitida por los marcadores al pasar las células, una a una por los diferentes láseres, permite medir simultáneamente características estructurales y varios parámetros en cada una de estas células.

Citómetro de flujo separador

Equipo que determina y cuantifica la fluorescencia de sondas fluorescentes unidas a diferentes partes tanto de células eucariotas como procariotas, orgánulos, proteínas. La fluorescencia emitida es recogida en distintos filtros acotados a una longitud de onda determinada. La cuantificación de la fluorescencia está asociada con el parámetro celular que se está midiendo, generando resultados cuantitativos como la intensidad de fluorescencia, porcentaje de poblaciones celulares, contaje del número de células/ML.

El equipo posee un sistema de separación celular permitiendo la separación física de una determinada población con diferentes niveles de pureza. Permite la separación en condiciones de esterilidad.

Difractómetro de Rayos X de Monocristal

Difractómetro D8 Venture es un sistema de determinación estructural de monocristales 3-D. El sistema cubre todas las aplicaciones típicas de un monocristal en química orgánica e inorgánica, química del estado sólido y órgano-metálicos, así como mineralogía y farmacia. Se puede configurar para investigaciones de densidad de electrones a temperatura ambiente o a bajas temperaturas, investigaciones de transiciones de fase o estudios de alta presión. Además permite hacer todos estos estudios con dos radiaciones; Mo o Cu. Obtenidas a través de dos microfuentes y sus ópticas asociadas. El detector PHOTON 100 con tecnología CMOS, Iluminación de luz fría y video –microscopio de HD.

Espectrómetro de RMN de 300MHz para muestras en estado líquido

Elucidación estructural de moléculas pequeñas: elucidación de la conectividad, configuración estereoquímica y conformación.

Espectrómetro de RMN de 400MHz para muestras en estado líquido
  • Elucidación estructural de moléculas pequeñas: elucidación de la conectividad, configuración estereoquímica y conformación.
  • Caracterización estructural de nanopartículas, y sus interacciones con sustratos.
  • Estudios de movilidad y dinámica molecular.
  • Seguimiento de procesos químicos: cinéticas.
  • Determinación de procesos de asociación e interacción molecular.
  • Estudios a temperatura variable.
  • Observación de una amplia variedad de núcleos magnéticos: 19F, 195Pt, 133Cs, 11B, 31P, 6Li, 29Si, etc.
Espectrómetro de RMN de 400MHz para muestras en estado sólido

Caracterización estructural de materiales en estado sólido, y de sustancias inmovilizadas sobre sólidos.

Permite analizar materiales muy diversos:

  • Suelos, maderas, celulosas
  • Materiales cerámicos
  • Polímeros
  • Polimorfos, vidrios, metales y aleaciones
  • Materiales porosos, como zeolitas, aluminosilicatos
  • Nanopartículas
  • Estudio de complejos organometálicos en estado sólido.
Espectrómetro de RMN de 500MHz para muestras en estado líquido

Elucidación estructural de moléculas pequeñas: elucidación de la conectividad, configuración estereoquímica y conformación.

Caracterización estructural de nanopartículas, y sus interacciones con sustratos.

Estudios de movilidad y dinámica molecular.

Seguimiento de procesos químicos: cinéticas.

Determinación de procesos de asociación e interacción molecular.

Estudios a temperatura variable.

Análisis de mezclas, cuantificación e identificación de componentes.

Estudios de difusión, tamaño y movilidad molecular.

Estudio de mecanismos de reacciones químicas, caracterización de intermedios de reacción, obtención de parámetros cinéticos y termodinámicos de las reacciones.

Estudio de interacciones moleculares, determinación de procesos de asociación e interacción molecular afinidad host-guest, reconocimiento molecular enzima-sustrato.

High content Screening IN CELL

Equipo de análisis de alto contenido a través de la captura automática de imágenes para el estudio de cultivos celulares vivos o fijados, en placas o portas. Dispone de cuatro objetivos de larga distancia: 4x, 10x, 20x y 40x. Además, dispone de incubador con control de temperatura y dispensador automático de reactivos.

Laboratorio de Biología molecular

Equipamiento de biología molecular: 2 termocicladores. 1 termociclador con gradiente. Analizador de imagen para geles de agarosa. Sistema QIAxcel para análisis de ácidos nucleicos. Cabina de flujo laminar para cultivos bacterianos y trabajo con fagos. 2 contadores de colonias.

Laboratorio de Bioseguridad P3

Equipamiento: 3 cabinas de flujo laminar para cultivos celulares. 3 incubadores con conexión de CO2. 1 incubador de hipoxia. Microscopio invertido. Micromanipulador. Arcón de -80ºC. Autoclave. Congelador.

Laboratorio de citometría

Laboratorio con equipamiento completo para la preparación, adquisición, separación y análisis de muestras por citometría de flujo.

Laboratorio de cultivos celulares

Laboratorio de Cultivos Celulares de Nivel de Contención Biológica 2 (NCB2). Dispone de varias salas: Sala de Líneas Celulares, Sala de Cultivos Primarios, sala de Hipoxia y Sala de Vectores Virales (NCB2+), con 10 cabinas de bioseguridad, 6 incubadores y todo el equipamiento necesario para poder trabajar con cultivos de células eucariotas.

Preparado y controlado por los técnicos para que el usuario sólo piense en su experimento.

Microscopio Confocal Multifotón FV1000MPE

Microscopio confocal multifotón montado sobre un microscopio vertical BX61WI motorizado y equipado con un objetivo de inmersión en agua XPLN25xWMP exclusivo para microscopía multifotónica, con una apertura numérica de 1.05 y una distancia de trabajo de 2mm. Dispone del láser Mai-Tai HP DeepSee (Spectra Physics) pulsado sintonizable en el rango de 690 a 1040nm con una potencia media de 2,0 W. Este tipo de láser, al ser infrarrojo, permite una mayor penetración en la muestra y produce menor daño celular. La señal se recoge mediante cuatro detectores que cubren todo el rango del visible (420-500/515-580/590-650/660-740).

Microscopio Confocal Super-resolución LSM 980

Microscopio confocal Super-resolución LCS 980 dispone de los siguientes objetivos: 10x, 20x, 25x (aceite), 40x (agua) y 63x (aceite), 60x. Las líneas de excitación presentes en este equipo son: 405nm, 488nm, 561nm y 639nm. Este equipo dispone además de un sistema de incubación lo que hace que sea un equipo adecuado para trabajar con célula viva. Este equipo incorpora los sistemas de super-resolución Airyscan 2 y Elyra 7.

Microscopio electrónico de barrido emisión de campo (FESEM) SCIOS 2 FIB-SEM

Microscopio Electrónico de Barrido de emisión de campo con haz de iones enfocado (FIB). Dispone de microanálisis EDX, opción crio para la observación de muestras congeladas y presión variable.

Microscopio láser confocal FV1000

Microscopio confocal montado sobre un IX81 invertido motorizado que dispone de los siguientes objetivos: 10x, 20x, 40x (aceite), 60x (aceite), 60x (agua). Las líneas de excitación presentes en este equipo son: 405nm, 488nm, 515nm, 559nm, 594nm y 635nm. Este equipo dispone además de un sistema de incubación lo que hace que sea un equipo adecuado para trabajar con célula viva.

Microscopio láser confocal FV10W

Equipo confocal invertido de rutina totalmente motorizado que permite la realización de adquisiciones programadas sobre varias áreas predefinidas. Dispone de un objetivo 10x (NA 0,4) seco y un 60x (NA 1,2) de inmersión en agua. Las líneas de excitación son: 405nm, 473nm, 559nm y 635nm. Este equipo es adecuado para experimentos en el tiempo de célula viva ya que dispone de incubador con control de temperatura.

Microultracentrífuga

Ultracentrífuga de pie para volúmenes pequeños con 3 rotores: S55A2, S50A y rotor oscilante S52ST.

Sala NCB2+ para cultivos celulares

Sala ubicada dentro del laboratorio de Cultivos Celulares (NCB2), con equipamiento propio y protocolos de trabajo de nivel superior. Diseñada para trabajar con vectores virales, OMGs o agentes biológicos de nivel 2 que requieran de una mayor seguridad.

Secuenciación de ácidos nucleicos

Capacidad para abordar la secuenciación de material genético de cualquier organismo empleando tanto técnicas tradicionales de secuenciación (método Sanger) como secuenciación de nueva generación.

TEM HITACHI HT7800 120Kv

Microscopio electrónico de transmisión de 120 Kv de alto contraste con cámara digital CMOS EMSIS XAROSA de 20 Mpx.

TEM JEOL jem 1010 100Kv

Microscopio electrónico de transmisión de 100 Kv de alto contraste con cámara digital AMT de 8 Mpx.

Técnicas de Biología Molecular, Celular y Genética

Citometría de flujo, qRT-PCR, Western Blot, Big-Data y técnicas de cultivos celulares primarios.