El Departament de Biologia Vegetal de la Universitat de València actualment està constituït per dues Àrees de Coneixement: l'Àrea de Fisiologia Vegetal i l'Àrea de Edafologia i Química Agrícola. L'Àrea de Fisiologia Vegetal al seu torn està estructurada en dues unitats docents, una situada en la Facultat de Farmàcia i l'altra situada en la Facultat de Biologia, ambdues en el Campus de Burjassot. L'Àrea de Edafologia i Química Agrícola està formada per una unitat docent, situada en la Facultat de Farmàcia.

Cadascuna de les distintes unitats docents té com responsable per al seu funcionament intern a un/a professor/a que actua com coordinador/a de aquesta unitat davant els òrgans del Departament: la Direcció, la Junta Permanent i el Consell de Departament.

El Departament de Biologia Vegetal és responsable de la docència de diferents assignatures de diverses llicenciatures i graus de la Universitat de València, les quals apareixen recollides en l'apartat de docència d'aquesta pàgina Web.