El Departamento de Biología Vegetal de la Universitat de Valencia actualmente está constituido por dos Áreas de Conocimiento: el Área de Fisiología Vegetal y el Área de Edafología y Química Agrícola.
El Área de Fisiología Vegetal a su vez está estructurada en dos unidades docentes, una ubicada en la Facultad de Farmacia y la otra ubicada en la Facultad de Biología, ambas en el Campus de Burjassot.
El Área de Edafología y Química Agrícola está formada por una unidad docente, ubicada en la Facultad de Farmacia.
Cada una de las distintas unidades docentes tiene como responsable para su funcionamiento interno a un/a profesor/a que actúa como coordinador/a de dicha unidad ante los órganos de dirección del Departamento: la Dirección, la Junta Permanente y el Consejo de Departamento.
El Departamento de Biología Vegetal es responsable de la docencia de diferentes asignaturas de varias licenciaturas y grados de la Universitat de València, las cuales aparecen recogidas en el apartado de docencia de esta página Web.