University of Valencia logo Logo Microbiology and Ecology Department Logo del portal

El nostre grup té una trajectòria de més de 30 anys dedicada a l'estudi de la diversitat procariòtica de medis aquàtics i de la taxonomia bacteriana. La investigació actual comprèn la caracterització polifàsica de soques bacterianes, especialment marines, amb fins taxonòmics i es tradueix en la descripció formal i conservació de nous tàxons bacterians i la generació de bases de dades d'utilitat en la seva identificació. La seva activitat suposa la utilització de multitud d'eines de caracterització del fenotip dels bacteris: caràcters estructurals, fisiològics, bioquímics i nutricionals, a més de la determinació de dades quimiotaxonómiques (àcids grassos, lípids polars, quinones, proteïnes majoritàries mitjançant MALDI-TOF, G+C). Així mateix, es duen a terme estudis d'aplicació de genòmica comparada a la taxonomia procariota, incloent-hi tant l'obtenció de dades (noves seqüències, ampliació i/o tancat) de soques tipus i addicionals d'interès, així com la posterior anàlisi amb eines informàtiques i seqüències públiques, estudis filogenètics basats en gens conservats (gen 16S rRNA i diversos gens essencials) així com filogenòmica basada en genomes complets. Les afinitats genòmiques es determinen mitjançant hibridació DNA-DNA in silico i determinació dels índexs ANI (Average Nucleotide Identity) i AAI (Average Aminoacid Identity) a partir de seqüències genòmiques.

Els tàxons bacterians que han rebut més aportacions del nostre grup de recerca en els darrers anys comprenen famílies, gèneres i espècies dels Phyla Pseudomonadota i Bacteroidota, però també s'han estudiat bacteris làctics, actinomicets i altres tàxons.