Fitxa persona

Soy Profesor Titular en Ecología en la Universitat de València (UV), en el Departamento de Microbiología y Ecología. Obtuve mi doctorado en Ecología Evolutiva y Ecología Molecular, centrándome en el efecto de los rasgos del ciclo de vida sobre la diversidad y la estructura genética de las poblaciones, en particular explorando la producción de huevos y las formas de resistencia en organismos zooplanctónicos. Durante este periodo adquirí experiencia en 1) técnicas de análisis molecular, 2) análisis genético de poblaciones y 3) modelización y simulación.

Tras completar mi doctorado, realicé investigación posdoctoral sobre el efecto de la impredecibilidad ambiental en la coexistencia de especies crípticas, lo que incluyó la supervisión de una tesis doctoral. Posteriormente, me incorporé al Grupo de Bioinformática y Genómica del COMAV (Universitat Politècnica de València), donde contribuí a investigaciones en genómica de poblaciones, ecofisiología y mejora genética tanto de especies agrícolas como no agrícolas. Entre los logros más destacados se incluyen: 1) la generación del primer genoma de calabacín, 2) la resecuenciación masiva de variedades de calabacín, 3) la creación de un atlas transcriptómico de tejidos de calabacín y 4) la investigación de la diversidad genómica y el origen del tomate mediante la secuenciación de más de 300 genomas (proyecto financiado por la NSF, EE. UU.).

Actualmente, mi investigación implica la programación en Python y R, el desarrollo de algoritmos y software para el análisis de poblaciones y el procesamiento de datos de secuenciación a gran escala. Estoy especializado en el análisis de datos procedentes de plataformas de genotipado, transcriptómica (RNA-seq) y secuenciación de genomas de novo en rotíferos, insectos, coníferas, algas y hongos. Además, he creado mapas genéticos para diversas especies, he identificado genes candidatos para caracteres de interés y he analizado la composición de comunidades de microinvertebrados en núcleos de sedimento mediante secuenciación de nueva generación.

Como docente, he codirigido tres tesis doctorales, dos trabajos de fin de máster y numerosos proyectos de grado. Asimismo, he actuado como tutor en empresa de numerosos estudiantes durante sus prácticas externas de Formación Profesional y programas de máster. He impartido docencia en niveles de grado y posgrado en universidades españolas e internacionales, incluyendo estancias como profesor invitado en la University of Hull (Reino Unido) y Georgia Tech (EE. UU.). Además, he coordinado 14 ediciones de cursos de formación permanente sobre análisis de datos de secuenciación de nueva generación y he dirigido cursos de posgrado en bioinformática y programación.