Los enterovirus son una de las causas más frecuentes de infecciones virales en humanos y pueden producir desde cuadros leves de resfriados hasta enfermedades como meningitis, parálisis o inflamación cardíaca. Pese a su impacto, el desarrollo de vacunas y antivirales se ve obstaculizado por su extraordinaria capacidad de mutación y por la diversidad de mecanismos de interacción que tienen con las células.

El equipo responsable de la investigación ha mapeado, con una resolución sin precedentes, cómo afectan miles de mutaciones al funcionamiento de dos enterovirus humanos de gran relevancia sanitaria: Enterovirus A71 (EVA71) y Coxsackievirus B3 (CVB3). Este mapeo se ha realizado utilizando la tecnología de deep mutational scanning, un método que permite evaluar simultáneamente el efecto de decenas de miles de mutaciones diferentes.

Gracias a esta aproximación comparada entre dos enterovirus de especies distintas, han logrado identificar qué regiones del virus son universales, esenciales e invariables, y cuáles varían en función del tipo viral y de su modo de interactuar con el huésped. Conocer qué regiones son invariantes es fundamental para entender las presiones selectivas básicas que enfrentan estos virus dentro de las células y para orientar el desarrollo de antivirales hacia estas zonas, ya que la aparición de resistencia debería ser más difícil en regiones que no pueden variar. Por otro lado, descubrir las regiones que cambian a lo largo de la evolución viral permite comprender cómo surgen nuevas funciones en los virus y cómo se desarrollan las interacciones con los hospedadores a lo largo del tiempo.

Identificación de regiones vulnerables del virus
A partir del estudio de más de 80.000 mutaciones, esta investigación revela que tanto EVA71 como CVB3 comparten un ‘núcleo’ estable que incluye las piezas fundamentales que permiten al virus replicarse y ensamblar su cápsida. Estas partes apenas toleran cambios y resultan ser puntos débiles ideales: si se atacan con un antiviral, es muy difícil que el virus pueda escapar mediante mutaciones sin perder su capacidad de infectar.

En cambio, las zonas que más varían entre los dos virus estudiados son aquellas que utilizan para interactuar con nuestras células, como las regiones del exterior de la cápsida que se unen a distintos receptores celulares. Estas diferencias explican por qué cada enterovirus infecta tejidos distintos o provoca enfermedades de gravedad variable. Por otro lado, identificar las regiones que cambian a lo largo de la historia evolutiva de los virus nos ayuda a comprender cómo surgen nuevas funciones virales y cómo se desarrollan las interacciones entre virus y hospedadores con el tiempo.

Nuevo bolsillo en la proteína 2C
Otro de los resultados destacados del estudio es la identificación de un nuevo bolsillo estructural en la proteína 2C, una región clave para la replicación del virus. “Hemos encontrado una región altamente conservada que es prometedora como diana antiviral, ya que está presente y conservada, no solo en los dos virus analizados, sino también en otros virus de la misma familia”, explica Beatriz Álvarez, investigadora del I2SysBio y autora del artículo.

Además, es una zona que apenas admite cambios, lo que significa que un antiviral dirigido contra ella tendría una alta probabilidad de funcionar contra muchos enterovirus a la vez y, al mismo tiempo, una baja probabilidad de generar resistencias.

En conjunto, el trabajo proporciona un mapa detallado de las regiones vulnerables de los enterovirus y de aquellas que varían según el virus. “Estos hallazgos abren nuevas oportunidades de investigación”, señala Ron Geller, uno de los autores principales del estudio y líder del grupo de Biología Viral en el I2SysBio. “Por un lado, la identificación de una potencial diana terapéutica permite aplicar enfoques de cribado virtual in silico para descubrir compuestos capaces de bloquear estos virus, algo especialmente relevante dado que actualmente no existen antivirales efectivos”. “Por otro –continúa Geller–, ofrece la posibilidad de estudiar cómo virus muy similares pueden evolucionar para utilizar distintos factores celulares durante su replicación, aportando información valiosa tanto sobre la biología viral como sobre la del hospedador”.


Referencia del artículo: Álvarez-Rodríguez, B., Bakhache, W., McCormick, L. et al. “Comparative analysis of deep mutational scanning datasets in enteroviruses A and B identifies functional divergence and therapeutic targets”. Nat Ecol Evol (2026). https://doi.org/10.1038/s41559-026-02993-8