Si la prueba F resulta significativa puede que todas o algunas de las Medias sean diferentes. Para saber entre qué Medias hay diferencias se puede aplicar las pruebas de comparación de medias como la prueba de Tuckey, la prueba de Scheffé (especialmente robusta a la violación de los supuestos estadísticos), la de Duncan (más potente cuanto mayor es el número de Medias comparadas), o la de Dunnett (especialmente adecuada para hacer comparaciones con un grupo de referencia).