El temps que els microorganismes liofilitzats es poden mantenir viables depèn en gran manera del mateix microorganisme i de les condicions d’emmagatzematge. Hi ha soques que són molt resistents i suporten períodes de temps llargs, que poden arribar a ser d’unes quantes desenes d’anys, però d’altres a penes poden mantenir-se viables alguns mesos. Quant a les condicions d’emmagatzematge s’aconsella una temperatura estable i protegir-los de la llum.