El Reglamento Estudios de Postgrado establece el siguiente procedimiento de seguimiento de los/las doctorandos/as:

Artículo 15. Los tutores o tutoras de tesis doctorales: Una vez admitido y matriculado al Programa de Doctorado, a todos los doctorandos y doctorandas les será asignado por parte de la correspondiente Comisión Académica un tutor o tutora, doctor o doctora con experiencia investigadora acredita, ligado al Departamento de Fisiología de la Universitat de València, como organizador del programa.

Artículo 16. La dirección de las tesis doctorales: La Comisión Académica responsable del programa asignará a cada doctorando o doctoranda, en el plazo máximo de seis meses desde su matrícula, un director de tesis doctoral que podrá ser coincidente o no con el tutor o tutora. Esta asignación podrá recaer en cualquier doctor/a, con experiencia investigadora debidamente acreditada, con independencia de la Universidad, Centro o Instituto en la que preste sus servicios.

Artículo 17. Documento de compromiso doctoral:

Con posterioridad a la formalización de la primera matrícula el doctorando o doctoranda, la Universidad, el tutor o tutora y los directores/as deberán subscribir de forma conjunta el Documento de compromiso doctoral, relativo, entre otras cuestiones, al procedimiento de resolución de conflictos que se puedan plantear, a los aspectos relativos a la propiedad intelectual o industrial y, en general, a las funciones de supervisión de la actividad investigadora del doctorando o doctoranda. El Programa solicitará al doctorando/a para que presente el  Documento de compromiso doctoral en la Secretaría del Dpto. de Fisiología antes de finalizar el curso académico.

Artículo 18. Plan de investigación y Documento de actividades de los estudiantes de doctorado:

Con anterioridad a que finalice el primer año el/la doctorando/a elaborará un Plan de investigación, avalado por el tutor o tutora y los directores/as, este plan deberá incluir la metodología y los objetivos, los medios y la planificación temporal, así como el informe favorable de la Comisión de Ética en Investigación Experimental de la Universitat de Valencia, en los casos señalados. Este plan se podrá mejorar a lo largo de su permanencia en el programa de doctorado y deberá ser avalado por el tutor o tutora y por el director o directora. El Programa solicitará al doctorando/a para que presente el Plan de investigación antes de finalizar el curso académico.

Una vez realizada la primera matrícula se materializará para cada doctorando o doctoranda el Documento personalizado de actividades, donde se registrarán todas las actividades de interés para el desarrollo del doctorando o doctoranda, así como del desarrollo de la tesis, a efectos de revisión por el tutor o tutora y el director o directora de la tesis y su evaluación por la Comisión Académica del Programa de Doctorado.

Serán objeto de evaluación por la Comisión de Ética los planes de investigación que incluyan la experimentación con humanos o con muestras biológicas humanas, la experimentación animal y la utilización de agentes biológicos patógenos u organismos modificados genéticamente.

Anualmente el/la estudiante presentará el Informe del tutor/a y directores/as. del curso académico que termina. La Comisión Académica del Programa evaluará el Plan de investigación y el documento de actividades junto con el Informe del tutor/a y directores/as. La evaluación positiva será requisito para poder continuar en el programa. En caso de evaluación negativa, que deberá ser motivada, el doctorando o doctoranda deberá ser nuevamente evaluado en el plazo de seis meses, para lo que se deberá elaborar un nuevo plan de investigación. Si se produce una nueva evaluación negativa, se dará de baja definitivamente al doctorando o doctoranda. Ante estas resoluciones que no agotan la vía administrativa, el interesado podrá interponer recurso de alzada, que resolverá, previo informe de la Comisión de Estudios de Postgrado, el Rector o persona en quien delega. Para la matrícula de años sucesivos será necesario un informe favorable por parte de la Comisión Académica de este documento personal de actividades y del plan de investigación. Estos documentos deberán de inscribirse y registrarse en la Unidad de Gestión de Tercer Ciclo del Centro de Postgrado. El Programa solicitará al doctorando/a para que rellene el Informe del tutor/a y directores/as con sus datos, lo haga llegar a su tutor/a y directores para que hagan y firmen el informe y el doctorando/a lo presente antes de finalizar el curso académico.

El curso en que haya realizado alguna actividad formativa transversal, el/la estudiante deberá presentar un Informe de las actividades transversales realizadas en el curso. El programa se lo solicitará antes de finalizar el curso académico.