Taxogenómica de bacterias marinas. 2020 - 2021.  Ref. AICO/2020/181. Conselleria de Innovación, Universidades, Ciencia y Sociedad digital. Generalitat Valenciana. IP: María Jesús Pujalte Domarco

Taxogenómica de bacterias marinas. 2020 - 2021. Ref. UV--INV-AE19-1199655. Universitat de València. IP: María Jesús Pujalte Domarco

Genome Encyclopedia of Bacteria and Archaea VI: Functional Genomics of Type Strains. 2018 - 2021. Joint Genome Institute, JGI's Community Science Program. IP: David R. Arahal /R. Aznar (IP William B Whitman, University of Georgia).

Aplicación de la espectrometría MALDI-TOF en la construcción de bibliotecas para la identificación rápida de microorganismos. 2018 - 2019. Generalitat Valenciana, Programa I+D.  IP: R. Aznar.

Desarrollo de una biblioteca de perfiles MALDI-TOF para la identificación de cepas bacterianas presentes en aguas de consumo (DRINKING WATER LIBRARY). 2015 - 2018. Ref.RTC-2015-4496-2. Ministerio de Economía y Competitividad. IP: R. Aznar

Exploración de la diversidad microbiana y de su potencial biotecnológico (BIODIMI). 2012 - 2015. Ref. PROMETEO/2012/040. Conselleria d'Educació i Ciencia, GV. IP: Esperanza Garay/R. Aznar

Taxonomía, filogenia y conservación de bacterias marinas 2010. 2011 - 2014. Ref.CGL2010-18134/BOS . Ministerio de Ciencia y Tecnología . IP: M Jesus Pujalte Domarco

European Consortium of Microbial Resource Centres –EmbaRC. 2009 - 2012. European Commission. IP: David Ruiz Arahal.

Taxonomía, filogenia y conservación de bacterias marinas. Ayudas complementarias para proyectos de I+D+i. 2006 - 2006. Ref.ACOMP06/177. Conselleria d'Empresa, Universitat i Ciència . IP: María Jesús Pujalte Domarco

Taxonomía, filogenia y conservación de bacterias marinas. 2005 - 2008. Ref.CGL2005-02292/BOS. Ministerio de Educación y Ciencia (Proyectos de I+D. Plan Nacional de Investigación Científica). IP: María Jesús Pujalte Domarco

Filogenia de la Familia 'Leuconostocaceae' basada en secuencias génicas alternativas al rDNA 16S. 2004 -2005. Ref. GV04A-170. Conselleria de Cultura Educació i esport . IP: David RUIZ ARAHAL.