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El I2SysBio identifica el método de extracción más eficaz para obtener ADN de alta calidad en condiciones no ideales
- Unidad de Cultura Científica y de la Innovación
- 7 mayo de 2025
(De izquierda a derecha): Mária Džunková, Oleanna Guerra-Font, Omar Daniel Espinoza-Calderón e Inés Alberola-Mora.
El grupo de investigación de Mária Džunková, del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro mixto de la Universitat de València (UV) y del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), ha conseguido métodos de extracción de ADN de animales recolectados en campo en condiciones no ideales. En concreto, han obtenido ADN de calidad de una especie de nudibranquio –moluscos marinos sin concha, de cuerpo blando y colores llamativos– en seis de las 24 combinaciones practicadas. El trabajo se ha publicado en la revista Ecology and Evolution.
Esta investigación se enmarca en la Iniciativa Catalana per a l’Earth Biogenome Project (CBP), una rama regional del proyecto Earth BioGenome Project (EBP), que busca secuenciar y catalogar los genomas de todas las especies eucariotas conocidas. En concreto, el CBP pretende secuenciar los genomas de más de 40.000 especies que habitan en territorios de habla catalana.
En el estudio publicado se evaluaron 24 combinaciones de conservación y extracción de ADN en un ejemplar del nudibranquio Peltodoris atromaculata. Como los nudibranquios suelen recolectarse en lugares remotos, es necesario aplicar métodos de conservación que pueden afectar a la calidad del ADN, dificultando así la obtención del material requerido por las técnicas de secuenciación de lectura larga, aquellas que permiten generar ensamblajes de lecturas muy precisos y continuos, fundamentales para el estudio de la arquitectura genómica y la resolución de regiones complejas del genoma.
“Los resultados indican que el éxito de las extracciones de ADN de alto peso molecular está influido por los métodos de conservación”, explica Mária Džunková, quien apunta que el estudio aporta resultados clave al identificar combinaciones eficaces de conservación y extracción de ADN, “lo que permitirá generar genomas de referencia de alta calidad y contribuir al conocimiento y aprovechamiento sostenible de la biodiversidad marina”.
Actualmente, aunque solo se ha secuenciado el genoma del 1 % de las 2.545 especies de nudibranquios conocidas, existe un creciente interés en este grupo por su extraordinaria diversidad biológica y sus complejos mecanismos de defensa química, con potencial en biotecnología y farmacología.
En esta investigación también han participado Inés Alberola-Mora, Oleanna Guerra-Font y Omar Daniel Espinoza-Calderón, investigadoras e investigador del I2SysBio, así como Carles Galià-Camps, de la Universitat de Barcelona, el Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBo) y del Blanes Centre for Advanced Studies (CSIC). En la investigación han colaborado económicamente el Institut d’Estudis Catalans, la Generalitat Valenciana y el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades.
Referencia artículo: Inés Alberola-Mora, Oleanna Guerra-Font, Omar Daniel Espinoza-Calderón, Carles Galià-Camps, Mária Džunková: «Combination of Sample Preservation Approaches and DNA Extraction Methods for Long-Read Sequencing of Nudibranchs’ Genomes». Ecology and Evolution, 2025; 15:e71262. DOI: https://doi.org/10.1002/ece3.71262
Pie de foto anexo:
1. Mária Džunková, con un ejemplar del nudibranquio Peltodoris atromaculata.
Archivada en: Investigació a la UV , Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SYSBIO) , Recerca, innovació i transferència , Difusió i comunicació científica , Grups de recerca , Internacionalització recerca
