Palomares y col. (2002) desarrollaron técnicas de análisis molecular sobre heces de lince ibérico, Lynx pardinus, una especie que, como se sabe, se encuentra en grave peligro de extinción.  La puesta a punto de esta técnica no invasiva ayuda a conocer la distribución actual de la especie e incrementa la posibilidad de detectarla en localidades donde es muy escasa. La escatología molecular se está empleando para otras especies amenazadas como el visón europeo, Mustela lutreola (Gómez-Moliner y col. 2004) o el topillo de Cabrera, Microtus cabrerae (Alasaad y col. 2011).