La Unidad de Zoología Marina ha participado en el Programa de Doctorado en Biodiversidad del Instituto Cavanilles, el cual recibió una Mención de Calidad por parte del Ministerio de Educación.
Este programa de Doctorado en Biodiversidad y Biología Evolutiva contempla diferentes líneas de investigación, entre otras zoología marina.
Asimismo, diferentes miembros de esta unidad forman parte del Programa de Doctorado en Recursos Marinos UV.
Una de les líneas de formación previa recomendada es el máster interuniversitario UV-UPV en Acuicultura.