La Investign se conceación sobre biología de la conservacióntra en cetáceos y tortugas marinas. Desde 1982, la Unidad de Zoología Marina (perteneciente en el pasado al Departamento de Biología Animal) mantiene un registro de los varamientos de cetáceos en la Comunidad Valenciana (que cubre unos 380 km de costa). Nuestros objetivos se han hecho progresivamente más ambiciosos a lo largo de los años y actualmente también llevamos un control de los varamientos de tortugas marinas y de las interacciones con aparejos de pesca de cetáceos y tortugas en las aguas de la Comunidad Valenciana. Desde 1988, la Unidad de Zoología Marina actúa por delegación de la Generalitat Valenciana como el organismo científico a cargo del registro de varamientos y capturas accidentales en artes de pesca de cetáceos y tortugas en la Comunidad Valenciana.
La Unidad de Zoología Marina alberga la Mediterranean Database of Cetacean Strandings (MEDACES) bajo los auspicios del ACCOBAMS y el Programa de Naciones Unidas para el Medio Ambiente. Además, la unidad ha sido el coordinador de un estudio exhaustivo financiado por el Ministerio de Medio Ambiente dentro de la iniciativa de la UE Natura 2000. El objetivo del estudio fue el de identificar y designar áreas de protección para cetáceos y tortugas marinas en aguas del Mediterráneo español. Nuestra contribución al proyecto consistió en la realización de censos aéreos en la Comunidad Valenciana y Región de Murcia para obtener estimaciones del tamaño de las poblaciones de cetáceos y de tortugas marinas. Asimismo, hemos realizado estudios sobre la distribución, migración y comportamiento de nidificación (nido) de tortugas marinas en Guinea Ecuatorial y República Dominicana, y sobre la alimentación de tortugas y cetáceos en el Mediterráneo.