El Reglament Estudis de Postgrau i la seua posterior adaptació a la memòria de verificació del programa, estableix el següent procediment de seguiment dels doctorands/de les doctorandes:

Article 15. Una vegada admés i matriculat al programa de doctorat, a tots els doctorands i doctorandes els serà assignat per part de la corresponent comissió acadèmica un tutor o tutora, doctor o doctora amb experiència investigadora acreditada, lligat a la unitat o Escola de Doctorat que organitze el programa.

Article 16. La comissió acadèmica responsable del programa assignarà a cada doctorand o doctoranda, en el termini màxim de sis mesos des de la seua matrícula, un director o directora de tesi doctoral que podrà ser coincident o no amb el tutor o tutora. Aquesta assignació podrà recaure en qualsevol doctor o doctora, amb experiència investigadora degudament acreditada, amb independència de la Universitat, Centre o Institut en la qual preste els seus serveis.

Article 17. Document de compromís doctoral:

Amb posterioritat a la formalització de la primera matrícula, el doctorand o doctoranda, la Universitat, el tutor o tutora, i si escau el director o directora hauran de subscriure de manera conjunta el compromís doctoral, relatiu, entre altres qüestions, al procediment de resolució de conflictes que es puguen plantejar, als aspectes relatius a la propietat intel·lectual o industrial i, en general a les funcions de supervisió de l'activitat investigadora del doctorand o doctoranda.

Aquest document, aprovat per la Subcomissió de Doctorat de data 17 d'octubre de 2011, en el qual es defineixen els drets i els deures respectius i els compromisos recíprocs dels membres signants amb la finalitat d'assegurar la consecució dels objectius definits en el Programa durant el període d'elaboració de la tesi doctoral.

Aquest document inclou:

• Compromisos recíprocs en l'establiment d'una col·laboració mútua.
• Obligacions i dedicació del director o directora o de la Tesi: compromís de regularitat, motivació d'iniciatives autònomes, caràcter original i innovador del projecte i coherent amb la Línia d'investigació.
• Obligacions i dedicació del Doctorand o de la doctoranda: Informar el Director o a la Directora regularment sobre l'evolució del treball, dels seus resultats i compromís de seguir les observacions que li faça el Director o Directora.
• Confidencialitat amb les dades i informacions que pogueren tindre tal caràcter que se li proporcionen i compromís d'utilitzar la informació per als fins corresponents, Règim de Propietat Intel·lectual, reconeixent-se-li al doctorand o doctoranda els drets de propietat intel·lectual o industrial que li corresponguen d'acord amb la legislació vigent.
• Resolució de conflictes, en els quals el Coordinador o Coordinadora del Programa de Doctorat haurà d'actuar de mediador.

Article 18. Pla d'investigació i Document d'activitats dels estudiants de doctorat:

Amb anterioritat al fet que finalitze el primer any, el doctorand o doctoranda elaborarà un pla d'investigació, avalat pel tutor o tutora i el director o directora, aquest pla haurà d'incloure la metodologia i els objectius, els mitjans i la planificació temporal, així com l'informe favorable de la Comissió d'Ètica en Investigació Experimental de la Universitat de València, en els casos assenyalats. Aquest pla es podrà millorar al llarg de la seua permanència en el programa de doctorat i haurà de ser avalat pel tutor o tutora i pel director o directora. 

Seran objecte d'avaluació per la Comissió d'Ètica els plans d'investigació que incloguen l'experimentació amb humans o amb mostres biològiques humanes, l'experimentació animal i la utilització d'agents biològics patògens o organismes modificats genèticament.

Anualment, la Comissió Acadèmica del Programa avaluarà el pla d'investigació i el document d'activitats juntament amb els informes que haurà d'emetre el tutor o tutora i el director o directora. L'avaluació positiva serà requisit per a poder continuar en el programa. En cas d'avaluació negativa, que haurà de ser motivada, el doctorand o doctoranda haurà de ser novament avaluat en el termini de sis mesos, per al que s'haurà d'elaborar un nou pla d'investigació. Si es produeix una nova avaluació negativa, es donarà de baixa definitivament al doctorand o doctoranda. Davant aquestes resolucions que no esgoten la via administrativa, l'interessat podrà interposar recurs d'alçada, que resoldrà, previ informe de la Comissió d'Estudis de Postgrau, el Rector o Rectora o persona en qui delega. Per a la matrícula d'anys successius serà necessari un informe favorable per part de la Comissió Acadèmica d'aquest document personal d'activitats i del pla d'investigació. Aquests documents hauran d'inscriure's i registrar-se en la Unitat de Gestió de Tercer Cicle del Centre de Postgrau. 
Pel que fa al Pla d'Investigació, es descriu a continuació el procediment per a la valoració anual del Pla d'investigació i el document d'activitats del doctorand o doctoranda. Abans de la finalització del primer any, quan s'establisquen els terminis administratius pertinents, el doctorand o doctoranda elaborarà un Pla d'investigació que inclourà, almenys: 1) la metodologia a utilitzar, 2) els objectius a aconseguir, 3) els mitjans materials per al seu desenvolupament i 4) la planificació temporal, indicant les tasques i fites previstes en cadascun dels mesos d'execució de la tesi. Els doctorands disposaran d'una plantilla per al seu emplenament a l'aula virtual.

El pla haurà de remetre's a la Comissió Acadèmica, després de l'aprovació del tutor o tutora/director o directora, en el termini esmentat per a la seua avaluació, qui usarà el següent barem:

• Desenvolupament satisfactori de les activitats formatives incloses en el registre d'activitats del doctorand o doctoranda segons l'apartat 4 (35%).
• Compliment del cronograma de tasques marcat en el Pla d'investigació (30%).
• Realització de la difusió prevista per a aqueix any en el Pla d'Investigació (35%).

A més, aquesta proposta de projecte, una vegada acceptada per la CAD, serà remesa per a la seua avaluació per la Comissió d'Ètica d'investigació de la Universitat de València, si això fora necessari per al tipus de projecte plantejat. El pla d'investigació inclourà la previsió de les estades dels doctorands o doctorandes en altres centres de formació nacionals i internacionals, co-tuteles i esments europeus