Estudis de diversitat procariòtica de mitjans aquàtics (especialment marins) i de taxonomia bacteriana.
- Caracterització polifàsica de bacteris i arqueges, especialment marines, amb finalitats taxonòmics, descripció formal i conservació de nous tàxons bacterians i generació de bases de dades d'utilitat en la seua identificació.
- Caracterització fenotípica i funcional: caràcters culturals, estructurals, fisiològics, bioquímics i nutricionals, determinació de caràcters quimiotaxonòmics (àcids grassos, lípids polars, quinonas, proteïnes majoritàries mitjançant MALDI-TOF, G+C).
- Genòmica comparada aplicada a la taxonomia procariòtica: obtenció de dades (noves seqüències, ampliació i/o tancat) de ceps tipus i nous aïllaments, Anàlisi comparativa i estudis filogenètics basats en gens conservats (gen 16S rRNA, diversos gens essencials), filogenòmica basada en genomes complets. Determinació de valors d'hibridació DNA-DNA in silico i índexs ANI (Average Nucleotide Identity) i AAI (Average Aminoacid Identity) a partir de seqüències genòmiques.
- Aspectes formals: Nomenclatura en Taxonomia de procariotes.
Grups taxonòmics: preferentment famílies, gèneres i espècies dels talls Pseudomonadota (especialment famílies Vibrionaceae, Halomonadaceae i Rhodobacteraceae) i Bacteroidota (ordre Flavobacteriales), entre altres tàxons.
- Generació de coneixement entorn dels recursos microbians, la seua classificació i conservació, incloent les seues possibles aplicacions biotecnològiques.
- Desenvolupament de metodologies de detecció, identificació i quantificació de microorganismes d'importància en aliments.
- Genòmica aplicada a la taxonomia procariota
Estudis d'aplicació de la genòmica comparada a la taxonomia procariota. Inclou tant l'obtenció de dades (noves seqüències, ampliació i/o tancat) de ceps tipus i ceps addicionals d'interés per al grup així com la seua posterior anàlisi amb eines informàtiques i seqüències públiques.
- Taxonomia de bacteris marins
Classificació, identificació i nomenclatura de bacteris marins: caracterització polifàsica (fenotípica, genòmica i filogenètica), especialment d'alfa/gammaproteobacterias i bacteroidetes mitjançant MLSA, hibridació DNA-DNA, índexs taxogenómicos i fenotipado clàssic.
Campus Burjassot/Paterna
Parc CientíficC/ Catedrático Agustín Escardino, 9
46980 Paterna (València)
