Aplicació de mètodes d'inferència filogenètica molecular a dades de seqüències des de la ultrasecuenciació fins a la determinació de nous genomes.
Separador Cel·lular equipat amb 6 làsers, cabina de Bioseguretat i extracció d'aerosols. Permet, en primer lloc, el mesurament ràpid de paràmetres morfològics i funcionals d'un gran nombre de cèl·lules individuals suspeses al mig líquid. Per a això, les cèl·lules es marquen inicialment amb anticossos conjugats amb fluorocroms, o sondes fluorescents que s'uneixen a proteïnes situades en la superfície o dins de la cèl·lula. La llum dispersada i la fluorescència emesa pels marcadors en passar les cèl·lules, una a una pels diferents làsers, permet mesurar simultàniament característiques estructurals i diversos paràmetres en cadascuna d'aquestes cèl·lules.
A més, després de l'anàlisi, és possible separar i recollir subpoblacions d'interés de la mostra per a posteriors estudis.
Equip que determina i quantifica la fluorescència de sondes fluorescents unides a diferents parts tant de cèl·lules eucariotes com procariotes, orgànuls, proteïnes. La fluorescència emesa és recollida en diferents filtres delimitats a una longitud d'ona determinada. La quantificació de la fluorescència està associada amb el paràmetre cel·lular que s'està mesurant, generant resultats quantitatius com la intensitat de fluorescència, percentatge de poblacions cel·lulars, compteig del nombre de cèl·lules/ML.
Equip que determina i quantifica la fluorescència de sondes fluorescents unides a diferents parts tant de cèl·lules eucariotes com procariotes, orgànuls, proteïnes. La fluorescència emesa és recollida en diferents filtres delimitats a una longitud d'ona determinada. La quantificació de la fluorescència està associada amb el paràmetre cel·lular que s'està mesurant, generant resultats quantitatius com la intensitat de fluorescència, percentatge de poblacions cel·lulars, compteig del nombre de cèl·lules/ML.
Citòmetre analitzador amb 5 làsers que permet el mesurament ràpid de paràmetres morfològics i funcionals d'un gran nombre de cèl·lules individuals suspeses al mig líquid. Per a això, les cèl·lules es marquen inicialment amb anticossos conjugats amb fluorocroms o sondes fluorescents que s'uneixen a proteïnes situades en la superfície o dins de la cèl·lula. La llum dispersada i la fluorescència emesa pels marcadors en passar les cèl·lules, una a una pels diferents làsers, permet mesurar simultàniament característiques estructurals i diversos paràmetres en cadascuna d'aquestes cèl·lules.
Citòmetre analitzador amb 3 làsers que permet el mesurament ràpid de paràmetres morfològics i funcionals d'un gran nombre de cèl·lules individuals suspeses al mig líquid. Per a això, les cèl·lules es marquen inicialment amb anticossos conjugats amb fluorocroms o sondes fluorescents que s'uneixen a proteïnes situades en la superfície o dins de la cèl·lula. La llum dispersada i la fluorescència emesa pels marcadors en passar les cèl·lules, una a una pels diferents làsers, permet mesurar simultàniament característiques estructurals i diversos paràmetres en cadascuna d'aquestes cèl·lules.
Equip que determina i quantifica la fluorescència de sondes fluorescents unides a diferents parts tant de cèl·lules eucariotes com procariotes, orgànuls, proteïnes. La fluorescència emesa és recollida en diferents filtres delimitats a una longitud d'ona determinada. La quantificació de la fluorescència està associada amb el paràmetre cel·lular que s'està mesurant, generant resultats quantitatius com la intensitat de fluorescència, percentatge de poblacions cel·lulars, compteig del nombre de cèl·lules/ML.
L'equip posseeix un sistema de separació cel·lular permetent la separació física d'una determinada població amb diferents nivells de puresa. Permet la separació en condicions d'esterilitat.
Equipament de biologia molecular: 2 termocicladors. 1 termociclador amb gradient. Analitzador d'imatge per a gels d'agarosa. Sistema QIAxcel per a anàlisi d'àcids nucleics. Cabina de flux laminar per a cultius bacterians i treball amb fags. 2 comptadors de colònies.
Equipament: 3 cabines de flux laminar per a cultius cel·lulars. 3 incubadors amb connexió de CO₂. 1 incubador d'hipòxia. Microscopi invertit. Micromanipulador. Bagul de -80 °C. Autoclau. Congelador.
Laboratori amb equipament complet per a la preparació, adquisició, separació i anàlisi de mostres per citometria de flux.
Laboratori de Cultius Cel·lulars de Nivell de Contenció Biològica 2 (NCB2). Disposa de diverses sales: Sala de Línies Cel·lulars, Sala de Cultius Primaris, sala d'Hipòxia i Sala de Vectors Virals (NCB2+), amb 10 cabines de bioseguretat, 6 incubadors i tot l'equipament necessari per a poder treballar amb cultius de cèl·lules eucariotes.
Preparat i controlat pels tècnics perquè l'usuari només pense en el seu experiment.
El microscopi confocal ens permet visualitzar mostres amb diferents marcatges fluorescents obtenint imatges de gran nitidesa i qualitat pel fet que la imatge obtinguda no està contaminada per la llum emesa fora del pla focal. Gràcies a aquesta característica de confocalitat, ens permet realitzar reconstruccions tridimensionals a partir de seccions òptiques.
El microscopi de camp clar ens permet visualitzar mostres tenyides o amb pigments naturals que resulten altament contrastades. La font d'il·luminació és la llum blanca. Els components de la mostra es visualitzen gràcies a les diferències de contrast que existeixen entre ells i el mitjà que els envolta.
La varietat de proteïnes fluorescents i sondes multicolor que s'han desenvolupat, permeten marcar pràcticament qualsevol molècula. La capacitat de visualitzar dinàmiques proteiques en vesícules, orgànuls, cèl·lules i teixits ha proporcionat nova informació sobre el funcionament de les cèl·lules tant en situacions de salut com de malaltia. Aquesta informació inclou la dinàmica espaciotemporal de processos, com la mitosi; estudis en la dinàmica d'ions, com el Ca+₂ i els canvis en el citoesquelet.
La fluorescència és un dels fenòmens físics més utilitzats en microscòpia biològica i analítica, sobretot pel seu alt grau de sensibilitat i especificitat. La microscòpia de fluorescència permet als usuaris determinar la distribució d'una sola molècula, la seua quantitat i la seua ubicació dins d'una cèl·lula.
Els microscopis de fluorescència que s'empren en aplicacions d'investigació es basen en una sèrie de filtres òptics. Els filtres solen estar inserits en un bloc de filtres. Mentre que el filtre d'excitació selecciona les longituds d'ona que exciten un fluoròfor concret dins de la mostra, el filtre d'emissió actua com una espècie de control de qualitat, ja que només permet passar les longituds d'ona d'interés emeses pel fluoròfor.
Ultracentrífuga dempeus per a volums xicotets amb 3 rotors: S55A2, S50A i rotor oscil·lant S52ST.
La plataforma Massarray s'encarrega de l'estudi, amb finalitats d'investigació, de mostres de tipus biològic a través del mapatge fi de seqüències d'ADN, així com de l'anàlisi de fenòmens de metilació. Amb aquest equip es poden analitzar desenes de variants de l'ADN com SNPs, insercions o deleccions en centenars de mostres en poc temps amb un gran grau de precisió i sensibilitat. També és possible analitzar mutacions somàtiques com les presents en mostra d'origen cancerigen. Finalment, es poden quantificar el grau de metilació de CpG individuals en seqüències curtes d'ADN de manera quantitativa.
Sala situada dins del laboratori de Cultius Cel·lulars (NCB2), amb equipament propi i protocols de treball de nivell superior. Dissenyada per a treballar amb vectors virals, OMGs o agents biològics de nivell 2 que requerisquen d'una major seguretat.
Capacitat per a abordar la seqüenciació de material genètic de qualsevol organisme emprant tant tècniques tradicionals de seqüenciació (mètode Sanger) com a seqüenciació de nova generació.
La PCR en temps real és una tècnica que combina l'amplificació i la detecció en un mateix pas, en correlacionar el producte de la PCR de cadascun dels cicles amb un senyal d'intensitat de fluorescència. Estan compostos per un termociclador acoblat a un sistema òptic, que monitora el senyal dels fluoròfors usats per a detectar el producte amplificat. Pel fet que la fluorescència d'aquests augmenta conforme el producte s'amplifica, es combinen els processos d'amplificació i detecció en una sola etapa.
Equip de seqüenciació massiva de DNA basat en seqüenciació per síntesi, utilitza nucleòtids marcats amb fluoròfors de diferents colors, i captació d'imatges de la fluorescència emesa.
