Universitat de ValènciaOferta Científic Tecnològica COVIDOferta Científic Tecnològica COVID Logo del portal

Anàlisi filogenètica

Aplicació de mètodes d'inferència filogenètica molecular a dades de seqüències des de la ultrasecuenciació fins a la determinació de nous genomes.

Equip de laboratori especialitzat per anàlisi biològic

Centrifugues refrigerades, micropipetes, lupes, PCR Lifecycler, Bombes de buit, orbitals, campanes d'extracció i flux laminar, cubetes electroforesi, vòrtex, MiniSpin, estufa, cubetes electroforesi, Qubit 2.0, NanoDrop 1000, encenedor de gas, cambres de cria d'insectes amb fotoperíode, balança, equip de fotodocumentació, termocicladors, congeladors, neveres.

Equips per a tècniques de Bioquímica, Biologia Molecular, Immunologia i Biologia Cel·lular

Sistema de documentació de gels Chemi-Doc XRS (Bio-Rad). Ultracentrifugues de sòl i sobretaula. Sistema CFX96 Touch de PCR en temps real (Bio-Rad). Microscopi de fluorescència. Microscopi de contrast d'imatges i càmera vídeo digital-sistema d'imatges. Lectors microplaques d'ELISA. Sistemes d'electroforesi bonic- i bidimensional. Centrifugues refrigerades, congeladors i frigorífics; incubadors orbitals; electroporador; sonicador; autoclaus i sistemes de purificació d'aigua.

Fags

Col·lecció de fags.

Genètica Evolutiva

3 laboratoris, 9 despatxos, 12 llocs de treball per a investigadors predoctorals, sala de servidors (6 llocs de treball per a investigadors i 4 despatxos).

Laboratori de Biologia molecular

Equipament de biologia molecular: 2 termocicladors. 1 termociclador amb gradient. Analitzador d'imatge per a gels d'agarosa. Sistema QIAxcel per a anàlisi d'àcids nucleics. Cabina de flux laminar per a cultius bacterians i treball amb fags. 2 comptadors de colònies.

Laboratori de Bioseguretat P3

Equipament: 3 cabines de flux laminar per a cultius cel·lulars. 3 incubadors amb connexió de CO₂. 1 incubador d'hipòxia. Microscopi invertit. Micromanipulador. Bagul de -80 °C. Autoclau. Congelador.

Laboratoris Bioquímica núm. A/ES/13/73 del Ministeri d'Agricultura de contenció de bioseguretat nivell 2, i de l'Àrea de Parasitologia 2-02-038 i 2-15-053 amb certificació de bioseguretat P1 en procés de certificació 2

Disposició d'espais de laboratori, dotats del material inventariable i fungible necessari per a llevar a cap les investigacions de les línies detallades. Laboratoris equipats con lectores d'ELISA, sistemes d'electroforesi bonic- i bidimensional, Sistema d'anàlisi i documentació de ChemiDoc XRS Bio-Rad, termocicladors PCR normal i a temps real (sistema CFX96 Touch de PCR  temps real; Bio-Rad). Electroporador, Incubadores, neveres, congeladors de -20 i -80. Equip de transferència semihumida. Centrifugues refrigerades de rotors fixos i oscil·lants, per a diverses grandàries de tubs. Ultracentrífugues de sòl i sobretaula. Autoclaus, sistemes de purificació d'aigua. Microscopis òptic i de fluorescència. Cubetes de tincions i reactius de tincions específiques. Lector de plaques ELISA i termociclador a temps real.

Microscòpia i Fotografia

Càmera Digital NIKON DXM 1200C. Microscopi NIKON E400. Càmera Digital Progres CT3 USB; Lupa NIKON SMZ 745T.

Programes bioinformàtics

Galaxy Badger, UGene, Artemis: Genome Browser, ACT, ClustalX, MrBayes, Mafft, RAxML, GS De Novo Assembler, GPRo, MIRA, Velvet, AphidBase, Staden, Unix Desktop Environment Project (UDE).

Seqüenciació d'àcids nucleics

Capacitat per a abordar la seqüenciació de material genètic de qualsevol organisme emprant tant tècniques tradicionals de seqüenciació (mètode Sanger) com a seqüenciació de nova generació.

Sistema de Real-Time PCR

La PCR en temps real és una tècnica que combina l'amplificació i la detecció en un mateix pas, en correlacionar el producte de la PCR de cadascun dels cicles amb un senyal d'intensitat de fluorescència. Estan compostos per un termociclador acoblat a un sistema òptic, que monitora el senyal dels fluoròfors usats per a detectar el producte amplificat. Pel fet que la fluorescència d'aquests augmenta conforme el producte s'amplifica, es combinen els processos d'amplificació i detecció en una sola etapa.

Sistema de seqüenciació massiva de DNA

Equip de seqüenciació massiva de DNA basat en seqüenciació per síntesi, utilitza nucleòtids marcats amb fluoròfors de diferents colors, i captació d'imatges de la fluorescència emesa.

Soques bacterianes. Insectes: Blatella germanica, Blatella orientalis, Periplaneta americana, Bemisia tabaci, Gromphadorhina portentosa, Planococcus citrí, Cinara cedri., Acyrthosiphon pisum
Tècniques amb insectes

Manteniment i cria d’ insectes, dissecció del sistema nerviós central d’insectes.

Tècniques bioinformàtiques

Anàlisi de dades de seqüenciació genòmica i proteòmica, elaboració d’arbres filogenètics, programació informàtica, BLAST, estudi de xarxes bioquímiques.

Tècniques bàsiques de biologia molecular i microscòpia

Electroforesi, PCR in situ , RT PCR, PCR quantitativa, mètodes de tinció i detecció, Anàlisis de transferència (western, Southern...), tecnologia DNA recombinant (extracció DNA, tractament enzimàtic, transferència DNA, ...), citometria de flux i i "FACS" (Fluorescence-Activated Cell Sorter), amplificació genòmica (WGA, whole genome amplification), Tractament de la mostra per a microscòpia òptica i electrònica, inclusió, Inmunohistoquímica, FISH.

Tècniques de Diagnòstic Etiològic

Diagnòstic morfològic, morfomètric i molecular de protozous, d'helmints i d'artròpodes paràsits humans i animals. Modelització epidemiològica de malalties parasitàries humanes i animals mitjançant la creació de Sistemes d'Informació Geogràfica (SIG).