Aplicación de métodos de inferencia filogenética molecular a datos de secuencias desde la ultrasecuenciación hasta la determinación de nuevos genomas.
Centrifugas refrigeradas, micropipetes, lupas, PCR Lifecycler, Bombas de vacío, orbitales, campanas de extracción y flujo laminar, cubetos electroforesis, vórtice, MiniSpin, estufa, cubetos electroforesis, Qubit 2.0, NanoDrop 1000, mechero de gas, cámaras de cría de insectos con fotoperíodo, balanza, equipo de fotodocumentación, termocicladores, congeladores, neveras.
Sistema de documentación de geles Chemi-Doc XRS (Bio-Rad). Ultracentrifugas de suelo y sobremesa. Sistema CFX96 Touch de PCR en tiempo real (Bio-Rad). Microscopio de fluorescencia. Microscopio de contraste de imágenes y cámara video digital-sistema de imágenes. Lectores microplacas de ELISA. Sistemas de electroforesis mono- y bidimensional. Centrifugas refrigeradas, congeladores y frigoríficos; incubadores orbitales; electroporador; sonicador; autoclaves y sistemas de purificación de agua.
Colección de fagos.
3 laboratorios, 9 despachos, 12 puestos de trabajo para investigadores predoctorales, sala de servidores (6 puestos de trabajo para investigadores y 4 despachos).
Equipamiento de biología molecular: 2 termocicladores. 1 termociclador con gradiente. Analizador de imagen para geles de agarosa. Sistema QIAxcel para análisis de ácidos nucleicos. Cabina de flujo laminar para cultivos bacterianos y trabajo con fagos. 2 contadores de colonias.
Equipamiento: 3 cabinas de flujo laminar para cultivos celulares. 3 incubadores con conexión de CO2. 1 incubador de hipoxia. Microscopio invertido. Micromanipulador. Arcón de -80ºC. Autoclave. Congelador.
Disposición de espacios de laboratorio, dotados del material inventariable y fungible necesario para quitar a cabo las investigaciones de las líneas detalladas. Laboratorios equipados cono lectoras de ELISA, sistemas de electroforesis mono- y bidimensional, Sistema de análisis y documentación de ChemiDoc XRS Bio-Rad, termocicladores PCR normal y a tiempo real (sistema CFX96 Touch de PCR tiempo real; Bio-Rad). Electroporador, Incubadoras, neveras, congeladores de -20 y -80. Equipo de transferencia semihúmeda. Centrifugas refrigeradas de rotores fijos y oscilantes, para varios tamaños de tubos. Ultracentrífugas de suelo y sobremesa. Autoclaves, sistemas de purificación de agua. Microscopios óptico y de fluorescencia. Cubetas de tinciones y reactivos de tinciones específicas. Lector de placas ELISA y termociclador a tiempo real.
Cámara Digital NIKON DXM 1200C. Microscopio NIKON E400. Cámara Digital Progres CT3 USB; Lupa NIKON SMZ 745T.
Galaxy Badger, UGene, Artemis: Genome Browser, ACT, ClustalX, MrBayes, Mafft, RAxML, GS De Novo Assembler, GPRo, MIRA, Velvet, AphidBase, Staden, Unix Desktop Environment Project (UDE).
Capacidad para abordar la secuenciación de material genético de cualquier organismo empleando tanto técnicas tradicionales de secuenciación (método Sanger) como secuenciación de nueva generación.
La PCR en tiempo real es una técnica que combina la amplificación y la detección en un mismo paso, al correlacionar el producto de la PCR de cada uno de los ciclos con una señal de intensidad de fluorescencia. Están compuestos por un termociclador acoplado a un sistema óptico, que monitoriza la señal de los fluoróforos usados para detectar el producto amplificado. Debido a que la fluorescencia de éstos aumenta conforme el producto se amplifica, se combinan los procesos de amplificación y detección en una sola etapa.
Equipo de secuenciación masiva de DNA basado en secuenciación por síntesis, utiliza nucleótidos marcados con fluoróforos de distintos colores, y captación de imágenes de la fluorescencia emitida.
Análisis de datos de secuenciación genómica y proteómica, elaboración de árboles filogenéticos, programación informática, BLASTO, estudio de redes bioquímicas.
Electroforesis, PCR in situ, RT PCR, PCR cuantitativa, métodos de tinción y detección, Análisis de transferencia (western, Southern...), tecnología DNA recombinante (extracción DNA, tratamiento enzimático, transferencia DNA, ...), citometria de flujo y y "FACS" (Fluorescence-Activated Cell Sorter), amplificación genómica (WGA, whole genome amplification), Tratamiento de la muestra para microscopia óptica y electrónica, inclusión, Inmunohistoquímica, FISH.
Mantenimiento y cría de insectos, disección del sistema nervioso central de insectos.
Diagnóstico morfológico, morfométrico y molecular de protozoos, de helmintos y de artrópodos parásitos humanos y animales. Modelización epidemiológica de dolencias parasitarias humanas y animales mediante la creación de Sistemas de Información Geográfica (SIG).
