Aplicació de mètodes d'inferència filogenètica molecular a dades de seqüències des de la ultrasecuenciació fins a la determinació de nous genomes.
Equip que determina i quantifica la fluorescència de sondes fluorescents unides a diferents parts tant de cèl·lules eucariotes com procariotes, orgànuls, proteïnes. La fluorescència emesa és recollida en diferents filtres delimitats a una longitud d'ona determinada. La quantificació de la fluorescència està associada amb el paràmetre cel·lular que s'està mesurant, generant resultats quantitatius com la intensitat de fluorescència, percentatge de poblacions cel·lulars, compteig del nombre de cèl·lules/ML.
Equip que determina i quantifica la fluorescència de sondes fluorescents unides a diferents parts tant de cèl·lules eucariotes com procariotes, orgànuls, proteïnes. La fluorescència emesa és recollida en diferents filtres delimitats a una longitud d'ona determinada. La quantificació de la fluorescència està associada amb el paràmetre cel·lular que s'està mesurant, generant resultats quantitatius com la intensitat de fluorescència, percentatge de poblacions cel·lulars, compteig del nombre de cèl·lules/ML.
Equip que determina i quantifica la fluorescència de sondes fluorescents unides a diferents parts tant de cèl·lules eucariotes com procariotes, orgànuls, proteïnes. La fluorescència emesa és recollida en diferents filtres delimitats a una longitud d'ona determinada. La quantificació de la fluorescència està associada amb el paràmetre cel·lular que s'està mesurant, generant resultats quantitatius com la intensitat de fluorescència, percentatge de poblacions cel·lulars, compteig del nombre de cèl·lules/ML.
L'equip posseeix un sistema de separació cel·lular permetent la separació física d'una determinada població amb diferents nivells de puresa. Permet la separació en condicions d'esterilitat.
Es tracta d'un analitzador de gasos O2-CO₂ amb Flux d'aire i commutador per a dos animals. Conté: una plataforma programari per a metabolisme, extensió “metabolisme respiratori” del programari Metabolism, Treadmill d'una sola línia per a ratolí amb xoc, Corredor per a Calorimetria per al treadmill, Cubeta per a rata/ratolí, Dos tapes Calorimetria per a rata de menjar i beguda, Menjadora/Abeuradora per a Calorimetria, Botella de 100mL per a sistema d'Oxylet, Sòl de reixeta per a rates, Sòl de reixeta per a ratolins. Aquest equip s'haja supervisat pel tècnic especialista Javier Cuenca.
Centrifugues refrigerades, micropipetes, lupes, PCR Lifecycler, Bombes de buit, orbitals, campanes d'extracció i flux laminar, cubetes electroforesi, vòrtex, MiniSpin, estufa, cubetes electroforesi, Qubit 2.0, NanoDrop 1000, encenedor de gas, cambres de cria d'insectes amb fotoperíode, balança, equip de fotodocumentació, termocicladors, congeladors, neveres.
Sistema de documentació de gels Chemi-Doc XRS (Bio-Rad). Ultracentrifugues de sòl i sobretaula. Sistema CFX96 Touch de PCR en temps real (Bio-Rad). Microscopi de fluorescència. Microscopi de contrast d'imatges i càmera vídeo digital-sistema d'imatges. Lectors microplaques d'ELISA. Sistemes d'electroforesi bonic- i bidimensional. Centrifugues refrigerades, congeladors i frigorífics; incubadors orbitals; electroporador; sonicador; autoclaus i sistemes de purificació d'aigua.
Equip que realitza determinacions de materials mitjançant Espectrofotometria Raman acoblada a un microscopi confocal.
- Elucidació estructural de molècules xicotetes: elucidació de la connectivitat, configuració estereoquímica i conformació.
- Caracterització estructural de nanopartícules, i les seves interaccions amb substrats.
- Estudis de mobilitat i dinàmica molecular.
- Seguiment de processos químics: cinètiques.
- Determinació de processos d'associació i interacció molecular.
- Estudis a temperatura variable.
- Observació d'una àmplia varietat de nuclis magnètics: 19F, 195Pt, 133Cs, 11B, 31P, 6Li, 29Si, etc.
3 laboratoris, 9 despatxos, 12 llocs de treball per a investigadors predoctorals, sala de servidors (6 llocs de treball per a investigadors i 4 despatxos).
Equipament de biologia molecular: 2 termocicladors. 1 termociclador amb gradient. Analitzador d'imatge per a gels d'agarosa. Sistema QIAxcel per a anàlisi d'àcids nucleics. Cabina de flux laminar per a cultius bacterians i treball amb fags. 2 comptadors de colònies.
Equipament: 3 cabines de flux laminar per a cultius cel·lulars. 3 incubadors amb connexió de CO₂. 1 incubador d'hipòxia. Microscopi invertit. Micromanipulador. Bagul de -80 °C. Autoclau. Congelador.
Disposició d'espais de laboratori, dotats del material inventariable i fungible necessari per a llevar a cap les investigacions de les línies detallades. Laboratoris equipats con lectores d'ELISA, sistemes d'electroforesi bonic- i bidimensional, Sistema d'anàlisi i documentació de ChemiDoc XRS Bio-Rad, termocicladors PCR normal i a temps real (sistema CFX96 Touch de PCR temps real; Bio-Rad). Electroporador, Incubadores, neveres, congeladors de -20 i -80. Equip de transferència semihumida. Centrifugues refrigerades de rotors fixos i oscil·lants, per a diverses grandàries de tubs. Ultracentrífugues de sòl i sobretaula. Autoclaus, sistemes de purificació d'aigua. Microscopis òptic i de fluorescència. Cubetes de tincions i reactius de tincions específiques. Lector de plaques ELISA i termociclador a temps real.
El microscopi confocal ens permet visualitzar mostres amb diferents marcatges fluorescents obtenint imatges de gran nitidesa i qualitat pel fet que la imatge obtinguda no està contaminada per la llum emesa fora del pla focal. Gràcies a aquesta característica de confocalitat, ens permet realitzar reconstruccions tridimensionals a partir de seccions òptiques.
El microscopi de camp clar ens permet visualitzar mostres tenyides o amb pigments naturals que resulten altament contrastades. La font d'il·luminació és la llum blanca. Els components de la mostra es visualitzen gràcies a les diferències de contrast que existeixen entre ells i el mitjà que els envolta.
La varietat de proteïnes fluorescents i sondes multicolor que s'han desenvolupat, permeten marcar pràcticament qualsevol molècula. La capacitat de visualitzar dinàmiques proteiques en vesícules, orgànuls, cèl·lules i teixits ha proporcionat nova informació sobre el funcionament de les cèl·lules tant en situacions de salut com de malaltia. Aquesta informació inclou la dinàmica espaciotemporal de processos, com la mitosi; estudis en la dinàmica d'ions, com el Ca+₂ i els canvis en el citoesquelet.
La fluorescència és un dels fenòmens físics més utilitzats en microscòpia biològica i analítica, sobretot pel seu alt grau de sensibilitat i especificitat. La microscòpia de fluorescència permet als usuaris determinar la distribució d'una sola molècula, la seua quantitat i la seua ubicació dins d'una cèl·lula.
Els microscopis de fluorescència que s'empren en aplicacions d'investigació es basen en una sèrie de filtres òptics. Els filtres solen estar inserits en un bloc de filtres. Mentre que el filtre d'excitació selecciona les longituds d'ona que exciten un fluoròfor concret dins de la mostra, el filtre d'emissió actua com una espècie de control de qualitat, ja que només permet passar les longituds d'ona d'interés emeses pel fluoròfor.
Càmera Digital NIKON DXM 1200C. Microscopi NIKON E400. Càmera Digital Progres CT3 USB; Lupa NIKON SMZ 745T.
La plataforma Massarray s'encarrega de l'estudi, amb finalitats d'investigació, de mostres de tipus biològic a través del mapatge fi de seqüències d'ADN, així com de l'anàlisi de fenòmens de metilació. Amb aquest equip es poden analitzar desenes de variants de l'ADN com SNPs, insercions o deleccions en centenars de mostres en poc temps amb un gran grau de precisió i sensibilitat. També és possible analitzar mutacions somàtiques com les presents en mostra d'origen cancerigen. Finalment, es poden quantificar el grau de metilació de CpG individuals en seqüències curtes d'ADN de manera quantitativa.
Galaxy Badger, UGene, Artemis: Genome Browser, ACT, ClustalX, MrBayes, Mafft, RAxML, GS De Novo Assembler, GPRo, MIRA, Velvet, AphidBase, Staden, Unix Desktop Environment Project (UDE).
Capacitat per a abordar la seqüenciació de material genètic de qualsevol organisme emprant tant tècniques tradicionals de seqüenciació (mètode Sanger) com a seqüenciació de nova generació.
La PCR en temps real és una tècnica que combina l'amplificació i la detecció en un mateix pas, en correlacionar el producte de la PCR de cadascun dels cicles amb un senyal d'intensitat de fluorescència. Estan compostos per un termociclador acoblat a un sistema òptic, que monitora el senyal dels fluoròfors usats per a detectar el producte amplificat. Pel fet que la fluorescència d'aquests augmenta conforme el producte s'amplifica, es combinen els processos d'amplificació i detecció en una sola etapa.
Equip de seqüenciació massiva de DNA basat en seqüenciació per síntesi, utilitza nucleòtids marcats amb fluoròfors de diferents colors, i captació d'imatges de la fluorescència emesa.
Manteniment i cria d’ insectes, dissecció del sistema nerviós central d’insectes.
Anàlisi de dades de seqüenciació genòmica i proteòmica, elaboració d’arbres filogenètics, programació informàtica, BLAST, estudi de xarxes bioquímiques.
Electroforesi, PCR in situ , RT PCR, PCR quantitativa, mètodes de tinció i detecció, Anàlisis de transferència (western, Southern...), tecnologia DNA recombinant (extracció DNA, tractament enzimàtic, transferència DNA, ...), citometria de flux i i "FACS" (Fluorescence-Activated Cell Sorter), amplificació genòmica (WGA, whole genome amplification), Tractament de la mostra per a microscòpia òptica i electrònica, inclusió, Inmunohistoquímica, FISH.
Citometria de flux, qRT-PCR, Western Blot, Big-Data i tècniques de cultius cel·lulars primaris.
Diagnòstic morfològic, morfomètric i molecular de protozous, d'helmints i d'artròpodes paràsits humans i animals. Modelització epidemiològica de malalties parasitàries humanes i animals mitjançant la creació de Sistemes d'Informació Geogràfica (SIG).
Laboratori amb última tecnologia en eines biomecàniques i un important equip de psiquiatres i psicòlegs que realitzen avaluacions funcionals i neurocognitives, oferint 3 serveis:
- Avaluació Neurocognitiva: es duu a terme avaluacions clíniques i neurocognitives integrals, i assessora a les persones afectades i als seus familiars per a una vida de qualitat i independent.
- Avaluació Biomecànica de la Funcions Humanes: proporciona informació quantitativa i objectiva de la repercussió funcional que té una patologia en les activitats i funcions d'una persona, convertint-se en una eina més per al personal sanitari en el control de les deficiències funcionals del sistema múscul-esquelètic.
- Sistema de monitoratge de la mirada (TOBII): que permet el registre i anàlisi de la mirada que es pot utilitzar com un instrument d'avaluació i rehabilitació. Aportar informació en diversos camps de coneixement com a interpretació de la conducta humana.
