Nuestro grupo tiene una trayectoria de más de 30 años dedicada al estudio de la diversidad procariótica de medios acuáticos y de la taxonomía bacteriana. La investigación actual comprende la caracterización polifásica de cepas bacterianas, especialmente marinas, con fines taxonómicos y se traduce en la descripción formal y conservación de nuevos taxones bacterianos y la generación de bases de datos de utilidad en su identificación. Su actividad supone la utilización de multitud de herramientas de caracterización del fenotipo de las cepas microbianas: caracteres estructurales, fisiológicos, bioquímicos y nutricionales, además de la determinación de datos quimiotaxonómicos (ácidos grasos, lípidos polares, quinonas, proteínas mayoritarias mediante MALDI-TOF, G+C). Así mismo se llevan a cabo estudios de aplicación de la genómica comparada a la taxonomía procariota, incluyendo tanto la obtención de datos (nuevas secuencias, ampliación y/o cerrado) de cepas tipo y cepas adicionales de interés, así como su posterior análisis con herramientas informáticas y secuencias públicas, estudios filogenéticos basados en genes conservados (gen 16S rRNA y diversos genes esenciales) así como filogenómica basada en genomas completos. Las afinidades genómicas se determinan mediante hibridación DNA-DNA in silico y determinación de los índices ANI (Average Nucleotide Identity) y AAI (Average Aminoacid Identity) a partir de secuencias genómicas.

Los taxones bacterianos que han recibido más aportaciones de nuestro grupo de investigación en los últimos años comprenden familias, géneros y especies de los filos Pseudomonadota y Bacteroidota, pero también se han estudiado bacterias lácticas, actinomicetos y otros taxones.