El Programa en Fisiologia de la Universitat de València té el seu origen en l'experiència prèvia adquirida pel professorat del Departament de Fisiologia en l'antic Programa de Doctorat amb Esment de Qualitat denominat també "Fisiología", del que prové i que va començar a impartir-se en el curs acadèmic 1986-87, adaptant-se a les directrius indicades per la Universitat de València, a causa de les normatives associades a la implantació de nous plans d'estudi.

Des dels inicis de la seua realització, el Programa de Doctorat Fisiologia va proporcionar magnífics resultats en nombre de Tesis Doctorals defensades, Premis Extraordinaris de Doctorat i Tesi amb Esment Europeu, així com en publicacions científiques en revistes de prestigi internacional derivades de les Tesis, estades predoctorales i posdoctorales en centres nacionals i internacionals i situació actual dels titulats egressats, entre altres indicadors. De fet, la formació rebuda ha permès que egressats del Programa s'hagen integrat en Centres de Recerca i Universitats. El Departament de Fisiologia va tenir l'oportunitat de sol·licitar ja en el curs acadèmic 1995-96 l'Esment de Qualitat per al llavors Programa en Fisiologia 190-A, obtenint aquest esment i la seua corresponent ajuda per part del Ministeri d'Educació i Ciència. Així mateix, en el curs 2004-05 va ser distingit també amb l'Esment de Qualitat pel Ministeri de Ciència i Innovació (Ref. MCD2004-00413), segons Resolució de 22 de juny de 2004 de la Direcció general d'Universitats, i ha anat obtenint les successives renovacions. I en el curs 2011-12 va ser distingit amb l'Esment cap a l'Excel·lència pel Ministeri d'Educació (Ref. PIXE2011-0349), segons resolució de 6 d'octubre de 2011 de la Secretaria General d'Universitats.

El programa respon a la creixent demanda d'estudiants amb interès en la realització de la tesi doctoral en un camp de gran rellevància científica com és el de la Fisiologia. Els/les estudiants formats en ciències de la salut poden realitzar la seua tesi doctoral en una de les línies de recerca que es desenvolupen amb notable èxit en el Departament de Fisiologia de la Universitat de València, oferides pels grups de recerca del Departament i el prestigi del qual és reconegut a nivell nacional i internacional. Aquestes línies cobreixen una part important dels temes de major impacte de la bibliografia científica corresponent, com són la fisiologia cardiovascular, la fisiologia i fisiopatologia de l'estrès oxidatiu en biomedicina, els efectes fisiològics de l'exercici físic, el desenvolupament de noves teràpies contra el càncer i la utilització de la llum estructurada i l'anàlisi d'imatge en biomedicina, entre uns altres. Amb aquest ampli ventall, es pot donar resposta a la pròpia iniciativa del/de l'estudiant de doctorat per a realitzar la seua recerca en un camp siga del seu interès.

Amb la formació rebuda, els/les titulats/as, a més d'aconseguir el grau de doctor, poden treballar en grups de recerca consolidats, així com en la seua adreça, plantejant temes nous susceptibles de sol·licitar projectes competitius en convocatòries públiques i privades.

Els/les estudiants adquireixen destreses i habilitats investigadores que els permeten accedir a llocs de treball en universitats, havent d'assenyalar que la Fisiologia, com a ciència bàsica, està present en nombroses titulacions actuals. Així mateix, poden accedir a llocs de treball en centres i instituts de recerca, així com en empreses privades o altres organismes oficials en els quals es desenvolupe labor investigadora relacionada amb l'àrea de la salut. De fet, són nombrosos els egressats d'aquest programa que estan desenvolupant el seu treball, tant en la Universitat de València com en altres universitats i centres de recerca nacionals i estrangers.