El Programa de Doctorat en Fisiologia té com a objectiu la realització de la tesi doctoral en temes capdavanters de la Fisiologia, formant persones competents en el desenvolupament de les tècniques d'investigació implicades. Per a això, ofereix una formació i preparació d'excel·lència com a investigadors especialistes en Fisiologia, ciència fonamental en l'àrea de la salut, els avanços de la qual són la base per al desenvolupament d'altres camps biomèdics.

Aquest objectiu general implica que, donat el caràcter de ciència experimental, al llarg del programa s'adquiriran les habilitats i destreses necessàries per a manejar les fonts d'informació, tant tradicionals com a través de les noves tecnologies, aplicar el mètode científic i les tècniques experimentals necessàries, analitzar els resultats d'investigació obtinguts i exposar-los de manera verbal i escrita. Així mateix, s'adquirirà mentalitat crítica per a valorar els seus resultats i els d'altres autors.