La fluorescencia es uno de los fenómenos físicos más utilizados en microscopía biológica y analítica, sobre todo por su alto grado de sensibilidad y especificidad. La microscopía de fluorescencia permite a los usuarios determinar la distribución de una sola molécula, su cantidad y su ubicación dentro de una célula.

Los microscopios de fluorescencia que se emplean en aplicaciones de investigación se basan en una serie de filtros ópticos. Los filtros suelen estar insertados en un bloque de filtros. Mientras que el filtro de excitación selecciona las longitudes de onda que excitan un fluoróforo concreto dentro de la muestra, el filtro de emisión actúa como una especie de control de calidad, ya que solo permite pasar las longitudes de onda de interés emitidas por el fluoróforo.

Es un microscopio de fluorescencia invertido lo que permite visualizar tanto muestras fijadas como cultivos celulares.

Tiene 4 objetivos: 10x, 20x, 40x y 63x, este último de aceite.

Posee tres filtros para la visualización de marcadores que emiten en azul, verde y rojo.

Para adquirir imágenes de fluorescencia este microscopio posee una cámara (Leica DFC450 C) que combina la sensibilidad y calidad de imagen. También captura imágenes de campo claro y contraste de fases para la microscopía en el ámbito de las ciencias biológicas y para aplicaciones clínicas e industriales.