Plataforma para llevar a cabo estudios transcriptómicos en el campo de single cell (célula única) que permite estudiar la variabilidad transcriptómica y fenotípica entre miles de células partiendo de ARN de célula única.

El equipo Chromium Controller está basado en la tecnología NEXT GEM de 10X Genomics, en la que se encapsulan las células junto con Gel Beads en vesículas denominadas Gel Beads en Emulsión (GEMs). Estas actúan como vesículas de reacción individuales donde la muestra es etiquetada. Este marcaje se consigue gracias a que cada Bead contiene millones de oligonucleótidos marcados con secuencias barcode. La plataforma utiliza la tecnología microfluídica para encapsular, procesar y analizar desde cientos hasta millones de células. Para ello, utiliza un protocolo de encapsulado de célula única en gotas/beads individuales y marcaje de cada célula individual con un código de barras molecular y con los reactivos necesarios para proceder a la identificación de dianas y amplificación. El equipo es capaz de encapsular y procesar, en cada carrera, hasta 80.000 células individuales con una eficiencia de captura hasta el 65%. La tecnología de captura de células únicas tiene una tasa de captura de dobletes (2 células encapsuladas a la vez) inferior al 1% por cada 1000 células. El chip microfluídico que utiliza el Chromium es compatible con un amplio rango de tamaños y tipos celulares eucariotas (cultivos celulares adheridos, cultivos celulares en suspensión, tejidos, sangre total…etc.). Los productos marcados se agrupan para las reacciones posteriores para crear genotecas compatibles con equipos de secuenciación masiva de lectura corta como los equipos de Illumina.