El Departament de Matemàtiques naix com a conseqüència de la fusió dels antics departaments d'Àlgebra, Geometria i Topologia i Matemàtica Aplicada aprovada per l'acord 30/2016 de 9 de març de 2016 del Consell de Govern de la Universitat de València.

El departament és la unitat de docència i d'investigació encarregada de coordinar els ensenyaments d'acord amb la programació de la Universitat i de fomentar la investigació i les altres activitats universitàries de les àrees de coneixement d'Àlgebra, Geometria i Topologia, i Matemàtica aplicada. Els seus membres participen en projectes, convenis i contractes amb empreses i administracions públiques nacionals i internacionals.