Plataforma per a dur a terme estudis transcriptòmics en el camp de single cell (cèl·lula única) que permet estudiar la variabilitat transcriptòmica i fenotípica entre milers de cèl·lules partint d'ARN de cèl·lula única.

L'equip Chromium Controller està basat en la tecnologia NEXT GEM de 10X Genomics, en la qual s'encapsulen les cèl·lules juntament amb Gel Beads en vesícules denominades Gel Beads en Emulsió (GEMs). Aquestes actuen com a vesícules de reacció individuals on la mostra és etiquetada. Aquest marcatge s'aconsegueix gràcies a que cada Bead conté milions de oligonucleòtids marcats amb seqüències barcode. La plataforma utilitza la tecnologia microfluídica per a encapsular, processar i analitzar des de centenars fins a milions de cèl·lules. Per a això, utilitza un protocol d'encapsulat de cèl·lula única en gotes/beads individuals i marcatge de cada cèl·lula individual amb un codi de barres molecular i amb els reactius necessaris per a procedir a la identificació de dianes i amplificació. L'equip és capaç d'encapsular i processar, en cada carrera, fins a 80.000 cèl·lules individuals amb una eficiència de captura fins al 65%. La tecnologia de captura de cèl·lules úniques té una taxa de captura de doblets (2 cèl·lules encapsulades alhora) inferior a l'1% per cada 1000 cèl·lules. El xip microfluídic que utilitza el Chromium és compatible amb un ampli rang de grandàries i tipus cel·lulars eucariotes (cultius cel·lulars adherits, cultius cel·lulars en suspensió, teixits, sang total…etc.). Els productes marcats s'agrupen per a les reaccions posteriors per a crear genoteques compatibles amb equips de seqüenciació massiva de lectura curta com els equips d'Illumina.