Logo de la Universitat de València Logo Oferta Científic Tecnològica Logo del portal

PacBio, Sequel
Sistema de seqüenciació massiva
Marca: PacBio, Sequel
Tipus: Equip

Equip de seqüenciació d'alt rendiment que permet l'obtenció de seqüències amb una longitud mitjana superior a 30 kb.

Descripció

L'equip de seqüenciació de molècula única Sequel es basa en la tecnologia SMRT (Single Molecule Real Time) Sequencing. La seqüenciació es realitza sobre DNA o RNA (cDNA) directament, sense la necessitat d'un pas previ d'amplificació per PCR. Cada cel·la de seqüenciació conté fins a 1 milió de pouets (Zero-Mode Waveguides).

Amb l'equip es poden obtindre fàcilment seqüències d'una longitud superior a 30 kb, per la qual cosa es facilita l'assemblat de regions riques en GC o altament repetitives. Les característiques del mètode de seqüenciació permeten la identificació directa de nucleòtids modificats, com 5-mC. La possibilitat de realitzar una seqüenciació circular del mateix motle augmenta l'exactitud de les seqüències que s'obtenen, amb una precisió del 99,999% (QV50).

Aplicacions pràctiques

Seqüenciació de “novo” de genomes, transcriptomes i epigenomes, anàlisis de isoformes d'RNA, anàlisi de metagenòmica, seqüenciació de amplicons, etc.

Certificacions de qualitat

ISO 9001

Condicions d'ús

Ús restringit al personal de la secció de Genòmica del SCSIE. Contactar amb la Secció.

Estructura/es UV que ho gestiona
Servei Central de Suport a la Investigació Experimental (SCSIE)
Contactes
  • Martinez Ramirez, Amparo Consuelo
  • PAS-E.T.S. Investigacio
Veure fitxa